NCBI Logo
GEO Logo
   NCBI > GEO > Accession DisplayHelp Not logged in | LoginHelp
GEO help: Mouse over screen elements for information.
          Go
Platform GPL6244 Query DataSets for GPL6244
Status Public on Dec 05, 2007
Title [HuGene-1_0-st] Affymetrix Human Gene 1.0 ST Array [transcript (gene) version]
Technology type in situ oligonucleotide
Distribution commercial
Organism Homo sapiens
Manufacturer Affymetrix
Manufacture protocol See manufacturer's web site
 
Description Affymetrix submissions are typically submitted to GEO using the GEOarchive method described at http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/geo/info/geo_affy.html

June 03, 2009: annotation table updated with netaffx build 28
June 18, 2012: annotation table updated with netaffx build 32
July 01, 2016: annotation table updated with netaffx build 35
 
Web link http://www.affymetrix.com/support/technical/byproduct.affx?product=hugene-1_0-st-v1
http://www.affymetrix.com/support/technical/libraryfilesmain.affx
Submission date Dec 05, 2007
Last update date Mar 05, 2020
Organization Affymetrix, Inc.
E-mail(s) geo@ncbi.nlm.nih.gov, support@affymetrix.com
Phone 888-362-2447
URL http://www.affymetrix.com/index.affx
Street address
City Santa Clara
State/province CA
ZIP/Postal code 95051
Country USA
 
Samples (38334) GSM247678, GSM247679, GSM247680, GSM247681, GSM247682, GSM247683 
Series (1873)
GSE9819 Comparisons of Affymetrix Whole-Transcript Human Gene 1.0 ST array with standard 3' expression arrays
GSE11414 Gene expression of osteosarcoma cell (U2OS, MG63) lines relative to normal human osteoblasts (HOB)
GSE11416 Comparison of osteosarcoma cell lines and normal human osteoblasts
Relations
Alternative to GPL10063 (Alternative CDF)
Alternative to GPL10666 (Alternative CDF)
Alternative to GPL11209 (Alternative CDF)
Alternative to GPL13243 (Alternative CDF [HuGene10stv1_Hs_ENTREZG_11.0.1])
Alternative to GPL14010 (Alternative CDF)
Alternative to GPL15034 (Alternative CDF [HuGene10stv1_Hs_ENTREZG_v14])
Alternative to GPL15424 (alternative CDF [HuGene10stv1_Hs_ENST])
Alternative to GPL15648 (Alternative CDF)
Alternative to GPL15969 (Alternative CDF [HuGene1_0_genecentric])
Alternative to GPL16239 (Alternative CDF)
Alternative to GPL16332 (Alternative CDF [MMBGX-Ensembl64])
Alternative to GPL16522 (Alternative CDF [HuGene10stv1_Hs_ENTREZG_15.1.0])
Alternative to GPL16786 (Alternative CDF [HuGene10stv1_Hs_ENSG_v13.0.0])
Alternative to GPL16987 (Alternative CDF [GATExplorer_Ensembl v57])
Alternative to GPL17047 ( Alternative CDF [HuGene10stv1_Hs_ENTREZG_15.0.0])
Alternative to GPL17244 (Alternative CDF [HuGene10stv1_Hs_ENTREZG_16.0.0])
Alternative to GPL17556 (alternative)
Alternative to GPL17737 (Alternative CDF)
Alternative to GPL18401 (AltAnalyze probeset-to-Ensembl)
Alternative to GPL18412 (Alternative CDF [hugene10stv1_74_030])
Alternative to GPL18695 (alternative CDF[Hugene10st_Hs_ENST_16.0.0])
Alternative to GPL19145 (Alternative CDF [hugene10st_Hs_ENSG_16.0.0])
Alternative to GPL19433 (Alternative CDF [hugene10st_Hs_ENSGvs1500.cdf])
Alternative to GPL20171 (Alternative CDF [hugene10st_Hs_ENTREZG_19.0.0])
Alternative to GPL23526 (Alternative CDF [hugene10st_Hs_ENTREZG_20])
Alternative to GPL27927 (Alternative CDF)
Alternative to GPL28228 (Alternative CDF [HuGene10stv1_Hs_REFSEQ_23.0.0])

Data table header descriptions
ID transcript_cluster_id
GB_LIST GenBank and RefSeq Accessions from mrna_assignment column
SPOT_ID genomic location of the transcript cluster in the version of the genome assembly used at annotation time. Coordinates are standard 1-based (length=stop-start+1).
seqname chromosome number
RANGE_GB NCBI RefSeq for chromosome of current build
RANGE_STRAND strand (+|-)
RANGE_START start (integer). Coordinates are standard 1-based (length=stop-start+1).
RANGE_STOP stop (integer). Coordinates are standard 1-based (length=stop-start+1).
total_probes Total number of probes contained by this transcript cluster.
gene_assignment Gene information for each assigned mRNA for mRNAs that corresponds to known genes (multipart).
mrna_assignment Description of the public mRNAs that should be detected by the sets within this transcript cluster based on sequence alignment (multipart).
category Array design category of the transcript cluster

Data table
ID GB_LIST SPOT_ID seqname RANGE_GB RANGE_STRAND RANGE_START RANGE_STOP total_probes gene_assignment mrna_assignment category
7896736 chr1:53049-54936 chr1 NC_000001.10 + 53049 54936 7 --- NONHSAT060105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 main
7896738 chr1:63015-63887 chr1 NC_000001.10 + 63015 63887 31 ENST00000328113 // OR4G2P // olfactory receptor, family 4, subfamily G, member 2 pseudogene // --- // --- /// ENST00000492842 // OR4G11P // olfactory receptor, family 4, subfamily G, member 11 pseudogene // --- // --- /// ENST00000588632 // OR4G1P // olfactory receptor, family 4, subfamily G, member 1 pseudogene // --- // --- ENST00000328113 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101926805:101927707:-1 gene:ENSG00000183909 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000492842 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:62948:63887:1 gene:ENSG00000240361 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000588632 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:104535:105471:1 gene:ENSG00000267310 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONHSAT000016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONHSAT051704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONHSAT060106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 main
7896740 NM_001004195, NM_001005240, NM_001005484, BC136848, BC136867, BC136907, BC136908 chr1:69091-70008 chr1 NC_000001.10 + 69091 70008 24 NM_001004195 // OR4F4 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 4 // 15q26.3 // 26682 /// NM_001005240 // OR4F17 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 17 // 19p13.3 // 81099 /// NM_001005484 // OR4F5 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 5 // 1p36.33 // 79501 /// ENST00000318050 // OR4F17 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 17 // 19p13.3 // 81099 /// ENST00000326183 // OR4F4 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 4 // 15q26.3 // 26682 /// ENST00000335137 // OR4F5 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 5 // 1p36.33 // 79501 /// ENST00000585993 // OR4F17 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 17 // 19p13.3 // 81099 /// BC136848 // OR4F17 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 17 // 19p13.3 // 81099 /// BC136867 // OR4F17 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 17 // 19p13.3 // 81099 /// BC136907 // OR4F4 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 4 // 15q26.3 // 26682 /// BC136908 // OR4F4 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 4 // 15q26.3 // 26682 NM_001004195 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 4 (OR4F4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_001005240 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 17 (OR4F17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_001005484 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 5 (OR4F5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000318050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:19:110643:111696:1 gene:ENSG00000176695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000326183 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:15:101922042:101923095:-1 gene:ENSG00000177693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000335137 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:69091:70008:1 gene:ENSG00000186092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000585993 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:107461:111696:1 gene:ENSG00000176695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC136848 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 17, mRNA (cDNA clone MGC:168462 IMAGE:9020839), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC136867 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 17, mRNA (cDNA clone MGC:168481 IMAGE:9020858), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC136907 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:168521 IMAGE:9020898), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC136908 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:168522 IMAGE:9020899), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000618231 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:110613:111417:1 gene:ENSG00000176695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 main
7896742 NR_024437, XM_006711854, XM_006726377, XR_430662, AK298283, AL137655, BC032332, BC118988, BC122537, BC131690, NM_207366, AK301928, BC071667 chr1:334129-334296 chr1 NC_000001.10 + 334129 334296 6 NR_024437 // LOC728323 // uncharacterized LOC728323 // 2q37.3 // 728323 /// XM_006711854 // LOC101060626 // F-box only protein 25-like // --- // 101060626 /// XM_006726377 // LOC101060626 // F-box only protein 25-like // --- // 101060626 /// XR_430662 // LOC101927097 // uncharacterized LOC101927097 // --- // 101927097 /// ENST00000279067 // LINC00266-1 // long intergenic non-protein coding RNA 266-1 // 20q13.33 // 140849 /// ENST00000431812 // LOC101928706 // uncharacterized LOC101928706 // --- // 101928706 /// ENST00000431812 // LOC101929823 // uncharacterized LOC101929823 // --- // 101929823 /// ENST00000433444 // LOC728323 // uncharacterized LOC728323 // 2q37.3 // 728323 /// ENST00000436899 // LINC00266-3 // long intergenic non-protein coding RNA 266-3 // --- // --- /// ENST00000445252 // LINC00266-1 // long intergenic non-protein coding RNA 266-1 // 20q13.33 // 140849 /// ENST00000455207 // LOC101928706 // uncharacterized LOC101928706 // --- // 101928706 /// ENST00000455207 // LOC101929823 // uncharacterized LOC101929823 // --- // 101929823 /// ENST00000455464 // LOC101928706 // uncharacterized LOC101928706 // --- // 101928706 /// ENST00000455464 // LOC101929823 // uncharacterized LOC101929823 // --- // 101929823 /// ENST00000456398 // LOC728323 // uncharacterized LOC728323 // 2q37.3 // 728323 /// ENST00000601814 // LOC101928706 // uncharacterized LOC101928706 // --- // 101928706 /// ENST00000601814 // LOC101929823 // uncharacterized LOC101929823 // --- // 101929823 /// AK298283 // LOC728323 // uncharacterized LOC728323 // 2q37.3 // 728323 /// AL137655 // LOC100134822 // uncharacterized LOC100134822 // --- // 100134822 /// BC032332 // PCMTD2 // protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 2 // 20q13.33 // 55251 /// BC118988 // LINC00266-1 // long intergenic non-protein coding RNA 266-1 // 20q13.33 // 140849 /// BC122537 // LINC00266-1 // long intergenic non-protein coding RNA 266-1 // 20q13.33 // 140849 /// BC131690 // LOC728323 // uncharacterized LOC728323 // 2q37.3 // 728323 /// NM_207366 // SEPT14 // septin 14 // 7p11.2 // 346288 /// ENST00000388975 // SEPT14 // septin 14 // 7p11.2 // 346288 /// ENST00000427373 // LINC00266-4P // long intergenic non-protein coding RNA 266-4, pseudogene // --- // --- /// ENST00000431796 // LOC728323 // uncharacterized LOC728323 // 2q37.3 // 728323 /// ENST00000509776 // LINC00266-2P // long intergenic non-protein coding RNA 266-2, pseudogene // --- // --- /// ENST00000570230 // LOC101929008 // uncharacterized LOC101929008 // --- // 101929008 /// ENST00000570230 // LOC101929038 // uncharacterized LOC101929038 // --- // 101929038 /// ENST00000570230 // LOC101930130 // uncharacterized LOC101930130 // --- // 101930130 /// ENST00000570230 // LOC101930567 // uncharacterized LOC101930567 // --- // 101930567 /// AK301928 // SEPT14 // septin 14 // 7p11.2 // 346288 NR_024437 // RefSeq // Homo sapiens uncharacterized LOC728323 (LOC728323), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// XM_006711854 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens F-box only protein 25-like (LOC101060626), partial mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// XM_006726377 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens F-box only protein 25-like (LOC101060626), partial mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// XR_430662 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens uncharacterized LOC101927097 (LOC101927097), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000279067 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:20:64290385:64303559:1 gene:ENSG00000149656 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000431812 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:485066:489553:-1 gene:ENSG00000237094 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// ENST00000433444 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:2:242122293:242138888:1 gene:ENSG00000220804 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000436899 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:131910:144885:-1 gene:ENSG00000170590 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000445252 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:20:64294897:64311371:1 gene:ENSG00000149656 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000455207 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:373182:485208:-1 gene:ENSG00000237094 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000455464 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:476531:497259:-1 gene:ENSG00000237094 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000456398 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:242088633:242140638:1 gene:ENSG00000220804 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000601814 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:484832:495476:-1 gene:ENSG00000237094 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// AK298283 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ60027 complete cds, moderately similar to F-box only protein 25. // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// AL137655 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434B2016 (from clone DKFZp434B2016). // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// BC032332 // GenBank // Homo sapiens protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:40288 IMAGE:5169056), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// BC118988 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 69, mRNA (cDNA clone MGC:141807 IMAGE:40035995), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// BC122537 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 69, mRNA (cDNA clone MGC:141808 IMAGE:40035996), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// BC131690 // GenBank // Homo sapiens similar to bA476I15.3 (novel protein similar to septin), mRNA (cDNA clone IMAGE:40119684), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NM_207366 // RefSeq // Homo sapiens septin 14 (SEPT14), mRNA. // chr1 // 50 // 100 // 3 // 6 // 0 /// ENST00000388975 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:7:55793544:55862789:-1 gene:ENSG00000154997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 100 // 3 // 6 // 0 /// ENST00000427373 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:25378300:25394719:-1 gene:ENSG00000228786 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// ENST00000431796 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:242088693:242122405:1 gene:ENSG00000220804 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 60 // 83 // 3 // 5 // 0 /// ENST00000509776 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:Y:24278681:24291346:1 gene:ENSG00000248792 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// ENST00000570230 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:16:90157932:90178344:1 gene:ENSG00000260528 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// AK301928 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ59065 complete cds, moderately similar to Septin-10. // chr1 // 50 // 100 // 3 // 6 // 0 /// ENST00000413839 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:7:45816557:45821064:1 gene:ENSG00000226838 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// ENST00000414688 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:711342:720200:-1 gene:ENSG00000230021 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000419394 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:703685:720194:-1 gene:ENSG00000230021 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000420830 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:243031272:243047869:-1 gene:ENSG00000231512 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// ENST00000428915 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:10:38453181:38466176:1 gene:ENSG00000203496 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000439401 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:3:198228194:198228376:1 gene:ENSG00000226008 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000440200 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:601436:720200:-1 gene:ENSG00000230021 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000441245 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:701936:720150:-1 gene:ENSG00000230021 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 67 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000445840 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:485032:485211:-1 gene:ENSG00000224813 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000447954 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:720058:724550:-1 gene:ENSG00000230021 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// ENST00000450226 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:243038914:243047875:-1 gene:ENSG00000231512 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// ENST00000453405 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:242122287:242122469:1 gene:ENSG00000244528 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000477740 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:92230:129217:-1 gene:ENSG00000238009 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// ENST00000508026 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:8:200385:200562:-1 gene:ENSG00000255464 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000509192 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:5:181329241:181342213:1 gene:ENSG00000250765 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000513445 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:4:118640673:118640858:1 gene:ENSG00000251155 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// ENST00000523795 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:8:192091:200563:-1 gene:ENSG00000250210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000529266 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:11:121279:125784:-1 gene:ENSG00000254468 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000587432 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:191212:195696:-1 gene:ENSG00000267237 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// ENST00000610542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:120725:133723:-1 gene:ENSG00000238009 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// ENST00000612088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:10:38453181:38466176:1 gene:ENSG00000203496 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000612214 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:186371:191429:-1 gene:ENSG00000267237 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000613471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:476738:489710:-1 gene:ENSG00000237094 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000615295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:5:181329241:181342213:1 gene:ENSG00000250765 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000616585 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:711715:724707:-1 gene:ENSG00000230021 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000618096 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:191178:191354:-1 gene:ENSG00000267237 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000618222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:6:131910:144885:-1 gene:ENSG00000170590 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000622435 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:2:242088684:242159382:1 gene:ENSG00000220804 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000622626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:11:112967:125927:-1 gene:ENSG00000254468 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000007486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:2:242089132:242175655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000023775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:7:45812479:45856081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000045845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:8:166086:213433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// BC071667 // GenBank HTC // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4384656, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT000053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT000055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT000063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// NONHSAT000064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT000065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT000086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT000097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 100 // 67 // 4 // 4 // 0 /// NONHSAT000098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Sense No Exonic // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// NONHSAT010578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// NONHSAT012829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT017180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT060112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT078034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT078035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT078039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT078040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT078041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT081035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT081036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT094494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT094497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT098010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// NONHSAT105956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT105968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONHSAT120472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// NONHSAT124571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00001800-XLOC_l2_001331 // Broad TUCP // linc-TP53BP2-4 chr1:-:224133091-224222680 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00001926-XLOC_l2_000004 // Broad TUCP // linc-OR4F16-1 chr1:+:329783-334271 // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00001927-XLOC_l2_000004 // Broad TUCP // linc-OR4F16-1 chr1:+:334139-342806 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00002370-XLOC_l2_000720 // Broad TUCP // linc-ZNF692-5 chr1:-:92229-129217 // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00002386-XLOC_l2_000726 // Broad TUCP // linc-OR4F29-1 chr1:-:637315-655530 // chr1 // 100 // 67 // 4 // 4 // 0 /// TCONS_l2_00002387-XLOC_l2_000726 // Broad TUCP // linc-OR4F29-1 chr1:-:639064-655574 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00002388-XLOC_l2_000726 // Broad TUCP // linc-OR4F29-1 chr1:-:646721-655580 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00002389-XLOC_l2_000726 // Broad TUCP // linc-OR4F29-1 chr1:-:655437-659930 // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00002812-XLOC_l2_001398 // Broad TUCP // linc-PLD5-4 chr1:-:243194573-243211171 // chr1 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00003949-XLOC_l2_001561 // Broad TUCP // linc-BMS1-9 chr10:+:38742108-38755311 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00003950-XLOC_l2_001561 // Broad TUCP // linc-BMS1-9 chr10:+:38742265-38764837 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00014349-XLOC_l2_007835 // Broad TUCP // linc-ORC6-14 chr2:+:243030831-243101574 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00014350-XLOC_l2_007835 // Broad TUCP // linc-ORC6-14 chr2:+:243030855-243102147 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00014351-XLOC_l2_007835 // Broad TUCP // linc-ORC6-14 chr2:+:243030868-243101569 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00014352-XLOC_l2_007835 // Broad TUCP // linc-ORC6-14 chr2:+:243030886-243064759 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00014354-XLOC_l2_007835 // Broad TUCP // linc-ORC6-14 chr2:+:243030931-243067562 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00014355-XLOC_l2_007835 // Broad TUCP // linc-ORC6-14 chr2:+:243030941-243102157 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00014357-XLOC_l2_007835 // Broad TUCP // linc-ORC6-14 chr2:+:243037045-243101538 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00014358-XLOC_l2_007835 // Broad TUCP // linc-ORC6-14 chr2:+:243058329-243064628 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00015637-XLOC_l2_007835 // Broad TUCP // linc-ORC6-14 chr2:+:243030783-243082789 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00015638-XLOC_l2_007835 // Broad TUCP // linc-ORC6-14 chr2:+:243030843-243065243 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00015639-XLOC_l2_007835 // Broad TUCP // linc-ORC6-14 chr2:+:243030843-243102469 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00015640-XLOC_l2_007835 // Broad TUCP // linc-ORC6-14 chr2:+:243030843-243102469 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00015641-XLOC_l2_007835 // Broad TUCP // linc-ORC6-14 chr2:+:243030843-243102469 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00015643-XLOC_l2_007835 // Broad TUCP // linc-ORC6-14 chr2:+:243064443-243081039 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00016828-XLOC_l2_008724 // Broad TUCP // linc-HNF1B-4 chr20:+:62921737-62934707 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00020055-XLOC_l2_010084 // Broad TUCP // linc-MCMBP-2 chr3:+:197937115-197955676 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00025304-XLOC_l2_012836 // Broad TUCP // linc-PDCD2-1 chr6:-:131909-144885 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00025849-XLOC_l2_013383 // Broad TUCP // linc-IGFBP1-1 chr7:+:45831387-45863181 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00025850-XLOC_l2_013383 // Broad TUCP // linc-IGFBP1-1 chr7:+:45836951-45863174 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000437691 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:243047737:243052252:-1 gene:ENSG00000231512 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// ENST00000447236 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:7:56360362:56360541:-1 gene:ENSG00000231299 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 50 // 100 // 3 // 6 // 0 /// ENST00000453576 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:129081:133566:-1 gene:ENSG00000238009 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// ENST00000611754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:Y:25378671:25391610:-1 gene:ENSG00000228786 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// ENST00000617978 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:227980051:227980227:1 gene:ENSG00000274886 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// ENST00000621799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:16:90173217:90186204:1 gene:ENSG00000260528 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:processed_transcript // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// NONHSAT000022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// NONHSAT010579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// NONHSAT010580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// NONHSAT120743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 100 // 3 // 6 // 0 /// NONHSAT139746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// NONHSAT144650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// NONHSAT144655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00002372-XLOC_l2_000720 // Broad TUCP // linc-ZNF692-5 chr1:-:129080-133566 // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00002813-XLOC_l2_001398 // Broad TUCP // linc-PLD5-4 chr1:-:243202215-243211826 // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00002814-XLOC_l2_001398 // Broad TUCP // linc-PLD5-4 chr1:-:243211038-243215554 // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00010440-XLOC_l2_005352 // Broad TUCP // linc-RBM11-5 chr16:+:90244124-90289080 // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 /// TCONS_l2_00031062-XLOC_l2_015962 // Broad TUCP // linc-BPY2B-4 chrY:-:27524446-27540866 // chr1 // 67 // 100 // 4 // 6 // 0 main
7896744 NM_001005221, NM_001005224, NM_001005277, NM_001005504, BC137547, BC137568 chr1:367659-368597 chr1 NC_000001.10 + 367659 368597 36 NM_001005221 // OR4F29 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 29 // 1p36.33 // 729759 /// NM_001005224 // OR4F3 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3 // 5q35.3 // 26683 /// NM_001005277 // OR4F16 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 16 // 1p36.33 // 81399 /// NM_001005504 // OR4F21 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 21 // 8p23.3 // 441308 /// ENST00000320901 // OR4F21 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 21 // 8p23.3 // 441308 /// ENST00000332831 // OR4F3 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3 // 5q35.3 // 26683 /// ENST00000332831 // OR4F16 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 16 // 1p36.33 // 81399 /// ENST00000332831 // OR4F29 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 29 // 1p36.33 // 729759 /// ENST00000402444 // OR4F7P // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 7 pseudogene // --- // --- /// ENST00000405102 // OR4F1P // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 1 pseudogene // --- // --- /// ENST00000424047 // OR4F2P // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 2 pseudogene // --- // --- /// ENST00000426406 // OR4F3 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3 // 5q35.3 // 26683 /// ENST00000426406 // OR4F16 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 16 // 1p36.33 // 81399 /// ENST00000426406 // OR4F29 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 29 // 1p36.33 // 729759 /// ENST00000456475 // OR4F3 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3 // 5q35.3 // 26683 /// ENST00000456475 // OR4F16 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 16 // 1p36.33 // 81399 /// ENST00000456475 // OR4F29 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 29 // 1p36.33 // 729759 /// ENST00000559128 // OR4F28P // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 28 pseudogene // --- // --- /// BC137547 // OR4F3 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3 // 5q35.3 // 26683 /// BC137547 // OR4F16 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 16 // 1p36.33 // 81399 /// BC137547 // OR4F29 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 29 // 1p36.33 // 729759 /// BC137568 // OR4F3 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3 // 5q35.3 // 26683 /// BC137568 // OR4F16 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 16 // 1p36.33 // 81399 /// BC137568 // OR4F29 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 29 // 1p36.33 // 729759 /// ENST00000589943 // OR4F8P // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 8 pseudogene // --- // --- NM_001005221 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 29 (OR4F29), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_001005224 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3 (OR4F3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_001005277 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 16 (OR4F16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_001005504 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 21 (OR4F21), mRNA. // chr1 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// ENST00000320901 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:8:166049:167043:-1 gene:ENSG00000176269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// ENST00000332831 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:685716:686654:-1 gene:ENSG00000273547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000185097 // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000402444 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:170639606:170640536:1 gene:ENSG00000217874 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 78 // 100 // 28 // 36 // 0 /// ENST00000405102 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:6:105919:106856:-1 gene:ENSG00000220212 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 81 // 100 // 29 // 36 // 0 /// ENST00000424047 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:11:86649:87586:-1 gene:ENSG00000224777 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 78 // 100 // 28 // 36 // 0 /// ENST00000426406 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:450740:451678:-1 gene:ENSG00000278566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding gene:ENSG00000235249 // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000456475 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:5:181367268:181368262:1 gene:ENSG00000230178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000559128 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:15:101875964:101876901:1 gene:ENSG00000257109 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 83 // 100 // 30 // 36 // 0 /// BC137547 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:169170 IMAGE:9021547), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC137568 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:169191 IMAGE:9021568), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000589943 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:19:156279:157215:-1 gene:ENSG00000266971 gene_biotype:unprocessed_pseudogene transcript_biotype:unprocessed_pseudogene // chr1 // 72 // 100 // 26 // 36 // 0 /// GENSCAN00000011446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:5:181367527:181368225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:685716:686414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:450740:451438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:8:166086:213433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 83 // 26 // 30 // 0 /// NONHSAT051700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 83 // 100 // 30 // 36 // 0 /// NONHSAT051701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 83 // 100 // 30 // 36 // 0 /// NONHSAT105966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 81 // 100 // 29 // 36 // 0 /// NONHSAT060109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 72 // 100 // 26 // 36 // 0 main
7896746 AK074482, NC_001807 chr1:564951-565019 chr1 NC_000001.10 + 564951 565019 28 ENST00000387377 // MT-TM // mitochondrially encoded tRNA methionine // --- // --- ENST00000387377 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCh38:MT:4402:4469:1 gene:ENSG00000210112 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chr1 // 78 // 96 // 21 // 27 // 0 /// AK074482 // GenBank // Homo sapiens cDNA fis, A-BNGH41000020, highly similar to Homo sapiens isolate EIJbIII-4-94 NADH dehydrogenase subunit 1 gene; mitochondrial gene for mitochondrial product. // chr1 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:4403-4470; gene=TRNM; product=tRNA-Met // chr1 // 78 // 96 // 21 // 27 // 0 /// NONHSAT135808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 main
7896748 NC_001807 chr1:566062-566129 chr1 NC_000001.10 + 566062 566129 24 ENST00000387382 // MT-TW // mitochondrially encoded tRNA tryptophan // --- // --- ENST00000387382 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCh38:MT:5512:5579:1 gene:ENSG00000210117 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:5513-5580; gene=TRNW; product=tRNA-Trp // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT135810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 main
7896750 NC_001807 chr1:568069-568136 chr1 NC_000001.10 + 568069 568136 28 ENST00000387419 // MT-TD // mitochondrially encoded tRNA aspartic acid // --- // --- ENST00000387419 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCh38:MT:7518:7585:1 gene:ENSG00000210154 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:7519-7586; gene=TRND; product=tRNA-Asp // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// NONHSAT135817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 main
7896752 M37726, NC_001807 chr1:568844-568913 chr1 NC_000001.10 + 568844 568913 24 ENST00000387421 // MT-TK // mitochondrially encoded tRNA lysine // --- // --- ENST00000387421 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:GRCh38:MT:8295:8364:1 gene:ENSG00000210156 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// M37726 // GenBank // Human mitochondrial Lys-tRNA-aaa. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:8296-8365; gene=TRNK; product=tRNA-Lys // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONHSAT139825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT139826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONHSAT147698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 main
7896754 AK026836, AK290103 chr1:721406-721912 chr1 NC_000001.10 + 721406 721912 23 ENST00000540997 // LOC100287497 // uncharacterized LOC100287497 // 1q42.11 // 100287497 /// ENST00000591702 // LOC100287934 // uncharacterized LOC100287934 // 1p36.33 // 100287934 /// ENST00000591702 // LOC101930657 // uncharacterized LOC101930657 // --- // 101930657 /// AK026836 // LOC100287497 // uncharacterized LOC100287497 // 1q42.11 // 100287497 /// AK290103 // LOC100287934 // uncharacterized LOC100287934 // 1p36.33 // 100287934 ENST00000540997 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:224008727:224010612:1 gene:ENSG00000185495 gene_biotype:transcribed_unprocessed_pseudogene transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENST00000591702 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:785800:787672:1 gene:ENSG00000237491 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK026836 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23183 fis, clone LNG11477. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK290103 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78588 complete cds. // chr1 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// NONHSAT000137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT009765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONHSAT139832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 main
7896756 NR_103536, NR_103537, BC037297, BC118644 chr1:752751-755214 chr1 NC_000001.10 + 752751 755214 26 NR_103536 // FAM87B // family with sequence similarity 87, member B // 1p36.33 // 400728 /// NR_103537 // FAM87A // family with sequence similarity 87, member A // 8p23.3 // 157693 /// ENST00000326734 // FAM87B // family with sequence similarity 87, member B // 1p36.33 // 400728 /// ENST00000330148 // FAM87A // family with sequence similarity 87, member A // 8p23.3 // 157693 /// BC037297 // FAM87A // family with sequence similarity 87, member A // 8p23.3 // 157693 /// ENST00000602608 // FAM87A // family with sequence similarity 87, member A // 8p23.3 // 157693 /// BC118644 // FAM87A // family with sequence similarity 87, member A // 8p23.3 // 157693 NR_103536 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 87, member B (FAM87B), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_103537 // RefSeq // Homo sapiens family with sequence similarity 87, member A (FAM87A), long non-coding RNA. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENST00000326734 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:817371:819837:1 gene:ENSG00000177757 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENST00000330148 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:8:375931:383174:-1 gene:ENSG00000182366 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC037297 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4821387. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENST00000602608 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:8:376243:377759:-1 gene:ENSG00000182366 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// BC118644 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40030978. // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// ENST00000613235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:8:377779:378637:-1 gene:ENSG00000182366 gene_biotype:lincRNA transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// NONHSAT000148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT124585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// TCONS_00000129-XLOC_000007 // Rinn lincRNA // linc-SAMD11-5 chr1:+:752750-755214 // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONHSAT124586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 main
7896759 NR_015368, NR_047519, NR_047520, NR_047521, NR_047522, NR_047523, NR_047524, NR_047525 chr1:791391-793751 chr1 NC_000001.10 + 791391 793751 12 NR_015368 // LINC01128 // long intergenic non-protein coding RNA 1128 // 1p36.33 // 643837 /// NR_047519 // LINC01128 // long intergenic non-protein coding RNA 1128 // 1p36.33 // 643837 /// NR_047520 // LINC01128 // long intergenic non-protein coding RNA 1128 // 1p36.33 // 643837 /// NR_047521 // LINC01128 // long intergenic non-protein coding RNA 1128 // 1p36.33 // 643837 /// NR_047522 // LINC01128 // long intergenic non-protein coding RNA 1128 // 1p36.33 // 643837 /// NR_047523 // LINC01128 // long intergenic non-protein coding RNA 1128 // 1p36.33 // 643837 /// NR_047524 // LINC01128 // long intergenic non-protein coding RNA 1128 // 1p36.33 // 643837 /// NR_047525 // LINC01128 // long intergenic non-protein coding RNA 1128 // 1p36.33 // 643837 /// ENST00000445118 // LINC01128 // long intergenic non-protein coding RNA 1128 // 1p36.33 // 643837 NR_015368 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1128 (LINC01128), transcript variant 6, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_047519 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1128 (LINC01128), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_047520 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1128 (LINC01128), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_047521 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1128 (LINC01128), transcript variant 3, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_047522 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1128 (LINC01128), transcript variant 4, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_047523 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1128 (LINC01128), transcript variant 5, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_047524 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1128 (LINC01128), transcript variant 7, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_047525 // RefSeq // Homo sapiens long intergenic non-protein coding RNA 1128 (LINC01128), transcript variant 8, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000445118 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:827608:859446:1 gene:ENSG00000228794 gene_biotype:processed_transcript transcript_biotype:lincRNA // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT000162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT000163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT000165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT000171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT000174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT000178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT000187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT000189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONHSAT000190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// NONHSAT000172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1 /// NONHSAT000175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1 /// NONHSAT000177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1 main
7896761 NM_152486, AK054643, BC024295, BC033213, JX093066, JX093067, JX093068, JX093070, JX093071, JX093073, JX093074, JX093075, JX093076, JX093077, JX093078, JX093080, JX093082, JX093083, JX093084, JX093086, JX093087, JX093089, JX093090, JX093091, JX093092, JX093093, JX093097, JX093098, JX093099, JX093100, JX093102, JX093103, JX093104, JX093105, JX093108, JX093109, JX093110, JX093072, JX093079, JX093081, JX093094, JX093095, JX093096, JX093101, JX093106, JX093107 chr1:860530-880512 chr1 NC_000001.10 + 860530 880512 42 NM_152486 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// ENST00000341065 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// ENST00000342066 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// ENST00000420190 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// ENST00000455979 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// ENST00000474461 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// AK054643 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// BC024295 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// BC033213 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093066 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093067 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093068 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093070 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093071 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093073 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093074 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093075 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093076 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093077 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093078 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093080 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093082 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093083 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093084 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093086 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093087 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093089 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093090 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093091 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093092 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093093 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093097 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093098 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093099 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093100 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093102 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093103 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093104 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093105 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093108 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093109 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093110 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093072 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093079 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093081 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093094 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093095 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093096 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093101 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093106 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// JX093107 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 NM_152486 // RefSeq // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 (SAMD11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000341065 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:930312:944575:1 gene:ENSG00000187634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000342066 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:925738:944575:1 gene:ENSG00000187634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000420190 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:924880:939291:1 gene:ENSG00000187634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 29 // 10 // 12 // 0 /// ENST00000455979 // ENSEMBL // havana:novel chromosome:GRCh38:1:939275:944259:1 gene:ENSG00000187634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 69 // 28 // 29 // 0 /// ENST00000474461 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:941076:942994:1 gene:ENSG00000187634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// AK054643 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ30081 fis, clone BGGI12000693, weakly similar to POLYHOMEOTIC-PROXIMAL CHROMATIN PROTEIN. // chr1 // 97 // 69 // 28 // 29 // 0 /// BC024295 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:39333 IMAGE:3354502), complete cds. // chr1 // 94 // 76 // 30 // 32 // 0 /// BC033213 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:45873 IMAGE:5014368), complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// JX093066 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV1 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// JX093067 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV2 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 94 // 83 // 33 // 35 // 0 /// JX093068 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV3 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// JX093070 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV5 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// JX093071 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV6 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// JX093073 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV8 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// JX093074 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV9 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// JX093075 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV10 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// JX093076 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV11 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 93 // 69 // 27 // 29 // 0 /// JX093077 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV12 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0 /// JX093078 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV13 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// JX093080 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV15 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// JX093082 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV17 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 97 // 79 // 32 // 33 // 0 /// JX093083 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV18 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 97 // 79 // 32 // 33 // 0 /// JX093084 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV19 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 96 // 67 // 27 // 28 // 0 /// JX093086 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV21 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// JX093087 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV22 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// JX093089 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV24 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// JX093090 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV25 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// JX093091 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV26 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 89 // 45 // 17 // 19 // 0 /// JX093092 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV27 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 45 // 19 // 19 // 0 /// JX093093 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV28 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 94 // 74 // 29 // 31 // 0 /// JX093097 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV32 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 50 // 21 // 21 // 0 /// JX093098 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV33 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 45 // 19 // 19 // 0 /// JX093099 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV34 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// JX093100 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV35 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// JX093102 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV37 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 45 // 19 // 19 // 0 /// JX093103 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV38 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// JX093104 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV39 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// JX093105 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV40 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// JX093108 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV43 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// JX093109 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV44 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 55 // 23 // 23 // 0 /// JX093110 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV45 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 64 // 27 // 27 // 0 /// JX093072 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV7 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 60 // 60 // 25 // 42 // 1 /// JX093079 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV14 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 64 // 64 // 27 // 42 // 1 /// JX093081 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV16 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 62 // 62 // 26 // 42 // 1 /// JX093094 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV29 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 69 // 69 // 29 // 42 // 1 /// JX093095 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV30 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 69 // 69 // 29 // 42 // 1 /// JX093096 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV31 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 55 // 55 // 23 // 42 // 1 /// JX093101 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV36 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 69 // 69 // 29 // 42 // 1 /// JX093106 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV41 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 64 // 64 // 27 // 42 // 1 /// JX093107 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 splice variant ASV42 (SAMD11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 60 // 60 // 25 // 42 // 1 /// ENST00000616016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:925741:944581:1 gene:ENSG00000187634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000617307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:925741:944581:1 gene:ENSG00000187634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000618779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:925741:944581:1 gene:ENSG00000187634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 86 // 35 // 36 // 0 /// ENST00000622503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:925741:944581:1 gene:ENSG00000187634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000017669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:924432:944153:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENST00000616125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:925741:944581:1 gene:ENSG00000187634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 34 // 42 // 1 /// ENST00000618181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:925741:944581:1 gene:ENSG00000187634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 32 // 42 // 1 /// ENST00000618323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:925741:944581:1 gene:ENSG00000187634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1 /// ENST00000620200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:925741:944581:1 gene:ENSG00000187634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 26 // 42 // 1 main
7896779 NM_198317, XM_005244744, XM_006710601, AY423763, BC033192, BC045768, BC105742, AK293258 chr1:895967-901099 chr1 NC_000001.10 + 895967 901099 47 NM_198317 // KLHL17 // kelch-like family member 17 // 1p36.33 // 339451 /// XM_005244744 // KLHL17 // kelch-like family member 17 // 1p36.33 // 339451 /// XM_006710601 // KLHL17 // kelch-like family member 17 // 1p36.33 // 339451 /// ENST00000338591 // KLHL17 // kelch-like family member 17 // 1p36.33 // 339451 /// ENST00000463212 // KLHL17 // kelch-like family member 17 // 1p36.33 // 339451 /// ENST00000466300 // KLHL17 // kelch-like family member 17 // 1p36.33 // 339451 /// AY423763 // KLHL17 // kelch-like family member 17 // 1p36.33 // 339451 /// BC033192 // KLHL17 // kelch-like family member 17 // 1p36.33 // 339451 /// BC045768 // KLHL17 // kelch-like family member 17 // 1p36.33 // 339451 /// BC105742 // KLHL17 // kelch-like family member 17 // 1p36.33 // 339451 /// AK293258 // KLHL17 // kelch-like family member 17 // 1p36.33 // 339451 NM_198317 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like family member 17 (KLHL17), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// XM_005244744 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens kelch-like family member 17 (KLHL17), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 37 // 37 // 0 /// XM_006710601 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens kelch-like family member 17 (KLHL17), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 43 // 20 // 20 // 0 /// ENST00000338591 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:960587:965715:1 gene:ENSG00000187961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000463212 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:961449:962478:1 gene:ENSG00000187961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 32 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000466300 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:962727:964530:1 gene:ENSG00000187961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:nonsense_mediated_decay // chr1 // 100 // 28 // 13 // 13 // 0 /// AY423763 // GenBank // Homo sapiens actinfilin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// BC033192 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4661653. // chr1 // 100 // 45 // 21 // 21 // 0 /// BC045768 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 17 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:5732717), complete cds. // chr1 // 100 // 32 // 15 // 15 // 0 /// BC105742 // GenBank // Homo sapiens kelch-like 17 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:40026625), complete cds. // chr1 // 97 // 64 // 29 // 30 // 0 /// AK293258 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ50001 complete cds, moderately similar to Kelch-like protein 17. // chr1 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1 /// ENST00000622660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:960639:965602:1 gene:ENSG00000187961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 64 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:959789:974544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 79 // 36 // 37 // 0 main
7896798 NM_001160184, NM_032129, BC101386, BC101387 chr1:901877-910488 chr1 NC_000001.10 + 901877 910488 43 NM_001160184 // PLEKHN1 // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 // 1p36.33 // 84069 /// NM_032129 // PLEKHN1 // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 // 1p36.33 // 84069 /// ENST00000379407 // PLEKHN1 // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 // 1p36.33 // 84069 /// ENST00000379409 // PLEKHN1 // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 // 1p36.33 // 84069 /// ENST00000379410 // PLEKHN1 // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 // 1p36.33 // 84069 /// ENST00000480267 // PLEKHN1 // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 // 1p36.33 // 84069 /// ENST00000491024 // PLEKHN1 // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 // 1p36.33 // 84069 /// BC101386 // PLEKHN1 // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 // 1p36.33 // 84069 /// BC101387 // PLEKHN1 // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 // 1p36.33 // 84069 NM_001160184 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family N member 1 (PLEKHN1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// NM_032129 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family N member 1 (PLEKHN1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000379407 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:966502:975008:1 gene:ENSG00000187583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000379409 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:966502:975008:1 gene:ENSG00000187583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000379410 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:966497:975108:1 gene:ENSG00000187583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000480267 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:970875:971523:1 gene:ENSG00000187583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000491024 // ENSEMBL // havana:putative chromosome:GRCh38:1:973512:975865:1 gene:ENSG00000187583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// BC101386 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family N member 1, mRNA (cDNA clone MGC:120613 IMAGE:40026400), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// BC101387 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family N member 1, mRNA (cDNA clone MGC:120616 IMAGE:40026404), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 40 // 43 // 0 /// NONHSAT000217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Exonic // chr1 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000017660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:959789:974544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 34 // 43 // 1 main
7896817 NM_005101, AY168648, BC009507, BT007297, M13755 chr1:948803-949920 chr1 NC_000001.10 + 948803 949920 27 NM_005101 // ISG15 // ISG15 ubiquitin-like modifier // 1p36.33 // 9636 /// ENST00000379389 // ISG15 // ISG15 ubiquitin-like modifier // 1p36.33 // 9636 /// AY168648 // ISG15 // ISG15 ubiquitin-like modifier // 1p36.33 // 9636 /// BC009507 // ISG15 // ISG15 ubiquitin-like modifier // 1p36.33 // 9636 /// BT007297 // ISG15 // ISG15 ubiquitin-like modifier // 1p36.33 // 9636 /// M13755 // ISG15 // ISG15 ubiquitin-like modifier // 1p36.33 // 9636 NM_005101 // RefSeq // Homo sapiens ISG15 ubiquitin-like modifier (ISG15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000379389 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1013423:1014540:1 gene:ENSG00000187608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY168648 // GenBank // Homo sapiens ubiquitin-like protein ISG15 mRNA, complete cds. // chr1 // 82 // 41 // 9 // 11 // 0 /// BC009507 // GenBank // Homo sapiens ISG15 ubiquitin-like modifier, mRNA (cDNA clone MGC:3945 IMAGE:3545944), complete cds. // chr1 // 85 // 74 // 17 // 20 // 0 /// BT007297 // GenBank // Homo sapiens interferon, alpha-inducible protein (clone IFI-15K) mRNA, complete cds. // chr1 // 82 // 41 // 9 // 11 // 0 /// M13755 // GenBank // Human interferon-induced 17-kDa/15-kDa protein mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1006335:1014478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 main
7896822 NM_198576, XM_006710635, AB191264, AK128761 chr1:955503-991496 chr1 NC_000001.10 + 955503 991496 49 NM_198576 // AGRN // agrin // 1p36.33 // 375790 /// XM_006710635 // AGRN // agrin // 1p36.33 // 375790 /// ENST00000379370 // AGRN // agrin // 1p36.33 // 375790 /// AB191264 // AGRN // agrin // 1p36.33 // 375790 /// ENST00000461111 // AGRN // agrin // 1p36.33 // 375790 /// AK128761 // AGRN // agrin // 1p36.33 // 375790 NM_198576 // RefSeq // Homo sapiens agrin (AGRN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// XM_006710635 // RefSeq // PREDICTED: Homo sapiens agrin (AGRN), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000379370 // ENSEMBL // ensembl_havana_transcript:known chromosome:GRCh38:1:1020123:1056116:1 gene:ENSG00000188157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// AB191264 // GenBank // Homo sapiens AGRN mRNA for agrin, complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 48 // 49 // 0 /// ENST00000461111 // ENSEMBL // havana:known chromosome:GRCh38:1:1051986:1056112:1 gene:ENSG00000188157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:retained_intron // chr1 // 20 // 20 // 10 // 49 // 1 /// AK128761 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ45064 fis, clone BRAWH3024242. // chr1 // 20 // 20 // 10 // 49 // 1 /// ENST00000620552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:GRCh38:1:1020123:1056118:1 gene:ENSG00000188157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// GENSCAN00000014913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1034556:1054981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 40 // 40 // 0 main
7896859 NR_029639 chr1:1102484-1102578 chr1 NC_000001.10 + 1102484 1102578 25 NR_029639 // MIR200B // microRNA 200b // 1p36.33 // 406984 /// ENST00000384997 // MIR200B // microRNA 200b // 1p36.33 // 406984 NR_029639 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 200b (MIR200B), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384997 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:1167092:1167202:1 gene:ENSG00000207730 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-200b // miRBase Micro RNA Database // MI0000342 Homo sapiens miR-200b stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 main
7896861 NR_029834 chr1:1103243-1103332 chr1 NC_000001.10 + 1103243 1103332 25 NR_029834 // MIR200A // microRNA 200a // 1p36.33 // 406983 /// ENST00000384875 // MIR200A // microRNA 200a // 1p36.33 // 406983 NR_029834 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 200a (MIR200A), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENST00000384875 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:1167846:1167956:1 gene:ENSG00000207607 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-200a // miRBase Micro RNA Database // MI0000737 Homo sapiens miR-200a stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONHSAT000253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 main
7896863 NR_029957 chr1:1104373-1104471 chr1 NC_000001.10 + 1104373 1104471 18 NR_029957 // MIR429 // microRNA 429 // 1p36.33 // 554210 /// ENST00000362106 // MIR429 // microRNA 429 // 1p36.33 // 554210 NR_029957 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 429 (MIR429), microRNA. // chr1 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// ENST00000362106 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:GRCh38:1:1169005:1169087:1 gene:ENSG00000198976 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// hsa-mir-429 // miRBase Micro RNA Database // MI0001641 Homo sapiens miR-429 stem-loop // chr1 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// NONHSAT000250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE: Linc // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONHSAT000255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000014910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:GRCh38:1:1126225:1185529:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 94 // 12 // 17 // 0 main

Total number of rows: 33297

Table truncated, full table size 97019 Kbytes.






Download family Format
SOFT formatted family file(s) SOFTHelp
MINiML formatted family file(s) MINiMLHelp

Supplementary data files not provided
| NLM | NIH | GEO Help | Disclaimer | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap