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Platform GPL20601 Query DataSets for GPL20601
Status Public on Mar 01, 2016
Title University of Groningen Lactococcus lactis MG1363 amplicon/oligo 2 X 2.5K [includes plasmids and pseudogenes]
Technology type spotted DNA/cDNA
Distribution non-commercial
Organism Lactococcus cremoris subsp. cremoris MG1363
Manufacturer University of Groningen
Manufacture protocol General Microgrid II spotting protocol on superamine slides
 
Description Platform includes plasmid and pseudo genes.
 
Submission date Jun 22, 2015
Last update date Mar 01, 2016
Contact name Claire Price
E-mail(s) price_claire@yahoo.co.uk
Organization name DSM
Department DFS
Lab ABC
Street address Alexander Fleminglaan
City Delft
ZIP/Postal code 2613 AX
Country Netherlands
 
Samples (4) GSM1652931, GSM1652932, GSM1652933, GSM1652934
Series (1)
GSE67657 L. lactis MG1363 transcriptome analysis of 4 evolved strains

Data table header descriptions
ID
ORF Locus tag
GENE gene name
GI_REF Gene GI number
SEQUENCE Amplicon or Oligo
SPOT_ID

Data table
ID ORF GENE GI_REF SEQUENCE SPOT_ID
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llmg_0002-dnaN-MG1066 llmg_0002 dnaN GeneID:4798369 gttctaaagttacaattcctgctttaacaaagttaaaaattgaagttgaagaaaaaggaattaccttaattggttcaaatggtcaaatttcaatcaaaaactttttgccagctgataataaagatgcaagtatgcttatttcaggaactggttctgtcttattagaagctgctttctttgaaaatgtagtaagtcaacttcctgaagttactttggaatttatcgaaaaagaacaaaaacaagttttgttgacttctggtaaatcagaaattactttaaaaggtttagattctgaaatttatccacatttacaagaaatctctgaaggttcttctttaaaaatgaaagtgaaagttttgaaagaaattttcacagagactgtttttgctgtaagtactcaagaaaatcgtccaattttcacaggggttcacttagaaactttgtcaacgggtgaattaaaagcagtagcaactgactcacatcgaatgagccaacgtttattgcctttagaagatacagacttaaaatttgatgtaattttaccaagtaaatcaatcaatagttttaaaaatgtttttacaaatgatgaagaagagattgaaattttcatcagtggaagccaaatgcttttccaaaatgaaacaattagttattatagtcgtttgattgagggttcttatcctgatactaatcgtttgattccaaatgaagctgattatactttagatttggt
llmg_0003-rexB-MG1068 llmg_0003 rexB GeneID:4798396 attttctgcggaagaagagttatttattgaaagtattcaagagaaagttgcccgctttgttgttggaacttatagtgatgaaaattcactgacagctggttcggagacaatttacgtgggaacgagtcagatgattactcgctttcgaaataaatttccagtagaattaagaaaaatagcttcttcagctgtcaatgaagtttacagtaagttgacaagaattcttgatttagattctcgttttgttattactgatgaaaaaattgaattaaaagcagaagatgaaaaatattttagaatttgggaagctgaaaatcaaaaagttgaaattgaacgagtggctaaggaaattagacaaaaaatcatccaaggggcttttttcaaagattttactgttttagtcggtgatccagcagcttatgagattactttgaaagaagtttttgatctctatgagattccatttttctatgctcaagaagaatccatgagccagcatcctttagtgattttttttgaaagtctatttgccatcaaaaaaaataattatcgaacggatgatgttgtcaatcttttaaaaagtaaagtttacacagatgccaaccttgatgaagaagttattgattactttgaatactatgttcaaaagtataagatttcaggtcgcaagaaatttacagaagaatttattgagagtgaattttctcaaattgaattagttaatgaaatgcgggaaaaactacttggaagtgaatctcctttacaa
llmg_0004-rexA-MG1069 llmg_0004 rexA GeneID:4797078 tctcagctagtgctgggtccggaaaaacttttgttatggcgcaaagaattgttgaaaaagtcaaacaaggtattgaaattgatcgactttttatttcaactttcactaaaaaagcggctagtgagttgcgaatgcgacttgaaagagatttgaaaaaagcgcgtcaagagagttctgatgacgaggaagctcacagattgacacttgctttacagaatctttcaaacgcagatattggaacaatggatagttttactcaaaaattgacaaaagctaattttaaccgtgtaaatattgatccaaattttcgaatattggctgaccaaacagaaagtgacttgattagacaagaagtttttgaacaattggttgagtcttatttatcagctgatgaaagcttaaatatttcaaaagataaatttgaaaaattgataaaaaatttctctaaagacaggaatattcttggctttcagaaggtagtttacaccatttatcgttttgcgtcagcaactgaaaatccaataagttggttagaaaatcaatttttaaaaggttttgagacttataaatcactgacagacttatcggaagactttacagtgaatgtaaaagaaaatttactgacattttttgagctgttagaaaattcactgaccaatggtgtgattgctaaaaaaggagctggtcgtgataaggc
llmg_0005-llmg_0005-MG150026 llmg_0005 llmg_0005 GeneID:4798206 atgctagattacaaaataggctcaattgtcgaaatgaaaaaacctcatgcctgtacagtcaaagcaactggaaaaaaagccaatgcttgggaaattacaaggcttggggctgatatcaaaattaaatgtacaaactgtaaccatgaagtgatgatgagtcgttttgacttcaataaaaaaataaaaaaagtgctcaag
llmg_0006-llmg_0006-MG1071 llmg_0006 llmg_0006 GeneID:4796748 cactcaagaggaagtcgcaaaagaactatactttagtcgtcaagcgatttcccgttgggaatctaacaaaactgaaccaaattttgaaacattaattgccttagctgatttatatgattcagacttattggctttttcacaaggaattgaacctcaaaaaagaaaaaaacatatcaatctttttgctggctttggcttagtcttttttaacttcgttcttggtttctggctgataatcactactgctttgcttctcttggctctttacggtcttattttagccatattcctagctccatttatcatgatttttgctcttgttacacacaatccacatattacctttggcaatgcgaatggagcaacaggttttgactggtggtattggttagtt
llmg_0007-llmg_0007-MG1072 llmg_0007 llmg_0007 GeneID:4798155 tttaacagcaggtatcgttggtttaccaaacgttgggaaatcaacactttttaatgcaattacaaaagcaggcgcggaagctgcaaactatcctttcgcaacaattgacccaaatgttgggatggtagaggtaccggatgaacgtttgaacaagttaacagagttgattaaacctaaaaaaactgttccaacaacttttgaatttactgatattgcagggattgtaaaaggagcttctcgaggagaaggtttgggaaataaattcctggctaatattcgtgaagtagatgcaattattcacgttgttcgagcttttgatgatgaaaacgttatgcgtgaaaataatcgtgaagatgcctttattgacccaatggctgatattgaaacgattaacctagaattaattttggccgatttagaatcagtcaataaacgttatgcgcgtgtagaaaaaattgctcgcacagcaaaagataaagatgcggtcgcagaatttaatgttttgaaaaaactcaaacctgttcttgaagatggtaaatcagcgcgaacaattgactttgatgaagatgaaacaaaggttcttaaaagtttattcttgttgacaagtaaaccagtcctttatgtggccaatgtttcagaagatgaagttggtgaacctgataacattgagtatgttaaacaaattcgtgattttgcggcgactgaaaatgctgaagttgcggtaatttctgctcg
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llmg_0009-llmg_0009-mg13950s llmg_0009 llmg_0009 GeneID:4798235 gagtggcatggtatggtcttagctaaaaataaaaaaataatgatttcaacaatttcgttagtaattttgagccttgtttgtttcaaagaaaatctacctgctcaggcatcaacaaagtcattagatacaggtgaaagttttactgaagtttacaataaggacaatggtttttatttaaatagccctttttatgatatttcaaaggtttcaaaaagtttttatgttggggaaagtgggactattaatcaagttaaagttttgccgatttataatatgacgccaaaaagttctgtgaatttttatcaaaatacagcaactaataatcttattggggcaaccttaccctcgctattcacgggagcaatagctttaacacaagctggtcaatatactgctcaaaaagctggaacagctacagttgcattgacttatatgctgtctagtgatttcaaaaaagaattacttagtaaatatccggatgcttggacaaatattgcacctgctagctatggttctcctgattttatgtatgcaaaatatagcaatcaaactttctatgtaacaatcaaggaacataccgtcccactctatcgcatgtataatcctaactcaggggaacatttttatactgaaaattcctttgagcgtgattcattggtgaaggcaggctggaactatgaaggagtcgcagaagaatctccaataaagacagtctataatcaagcagtttatcgtgtttataatccgaatgctggggaccat
llmg_0010 llmg_0010 llmg_0010 GeneID:4799098 TTCAGCTGAACGTGACTCTCTTGTGAGAGCAGGTTGGCACTATGAAGGAACGGCTTGGTATGGTGGATAA
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Total number of rows: 2739

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