 |
 |
GEO help: Mouse over screen elements for information. |
|
Status |
Public on Sep 30, 2014 |
Title |
[HuGene-2_0-st] Affymetrix Human Gene 2.0 ST Array [probe set (exon) version] |
Technology type |
in situ oligonucleotide |
Distribution |
commercial |
Organism |
Homo sapiens |
Manufacturer |
Affymetrix |
Manufacture protocol |
See manufacturer's web site
|
|
|
Description |
Affymetrix submissions are typically submitted to GEO using the GEOarchive method described at http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/geo/info/geo_affy.html
#%chip_type=HuGene-2_0-st-v1 #%lib_set_name=HuGene-2_0-st #%lib_set_version=v1 #%genome-species=Homo sapiens #%genome-version=hg19 #%genome-version-ucsc=hg19 #%genome-version-ncbi=GRCh37 #%genome-version-create_date=2009-02-00 #%genome-lifted-method=liftOver #%genome-lifted_from-species=Homo sapiens #%genome-lifted_from-version-ucsc=hg19 #%genome-lifted_from-version-ncbi=GRCh37 #%netaffx-annotation-date=2013-08-30 #%netaffx-annotation-netaffx-build=34
|
|
|
Submission date |
Sep 30, 2014 |
Last update date |
Mar 18, 2015 |
Organization |
Affymetrix, Inc. |
E-mail(s) |
geo@ncbi.nlm.nih.gov, support@affymetrix.com
|
Phone |
888-362-2447
|
URL |
http://www.affymetrix.com/index.affx
|
Street address |
|
City |
Santa Clara |
State/province |
CA |
ZIP/Postal code |
95051 |
Country |
USA |
|
|
Samples (302)
|
GSM1517175, GSM1517176, GSM1517177, GSM1517178, GSM1517179, GSM1517180
GSM1517181, GSM1517182, GSM1517183, GSM1517184, GSM1588586, GSM1588587, GSM1588588, GSM1637471, GSM1637472, GSM1637473, GSM1637474, GSM1637475, GSM1637476, GSM1847411, GSM1847412, GSM1847413, GSM1847414, GSM1847415, GSM1847416, GSM2057972, GSM2057973, GSM2057974, GSM2057975, GSM2057976, GSM2057977, GSM2093900, GSM2093901, GSM2093902, GSM2093903, GSM2093904, GSM2093905, GSM2093906, GSM2093907, GSM2093908, GSM2093909, GSM2093910, GSM2093911, GSM2093912, GSM2093913, GSM2093914, GSM2219037, GSM2219038, GSM2219039, GSM2219040, GSM2219041, GSM2219042, GSM2226765, GSM2226766, GSM2226767, GSM2226768, GSM2226769, GSM2226770, GSM2425640, GSM2425641, GSM2433856, GSM2433857, GSM2433858, GSM2433859, GSM2433860, GSM2433861, GSM2433862, GSM2433863, GSM2433864, GSM2433865, GSM2433866, GSM2433867, GSM2730278, GSM2730279, GSM2730280, GSM2730281, GSM2730282, GSM2730283, GSM2730284, GSM2730285, GSM2730286, GSM2730287, GSM2776417, GSM2776418, GSM2776419, GSM2776420, GSM2776421, GSM2776422, GSM2776423, GSM2776424, GSM2776425, GSM2776426, GSM2776427, GSM2776428, GSM2776429, GSM2776430, GSM2776431, GSM2776432, GSM2776433, GSM2776434, GSM2776435, GSM2776436, GSM2776437, GSM2776438, GSM2776439, GSM2776440, GSM2776441, GSM2776442, GSM2776443, GSM2776444, GSM2776445, GSM2776446, GSM2776447, GSM2776448, GSM2776449, GSM2776450, GSM2776451, GSM2776452, GSM2776453, GSM2776454, GSM2776455, GSM2776456, GSM2776457, GSM2776458, GSM2776459, GSM2776460, GSM2776461, GSM2776462, GSM2776463, GSM2776464, GSM3728779, GSM3728780, GSM3728781, GSM3728782, GSM3728783, GSM3728784, GSM3728785, GSM3728786, GSM3728787, GSM3728788, GSM3728789, GSM3728790, GSM3728831, GSM3728832, GSM3728833, GSM3728834, GSM3728835, GSM3728836, GSM3728837, GSM3728838, GSM3728851, GSM3728852, GSM3728853, GSM3728854, GSM3728855, GSM3728856, GSM3728857, GSM3728858, GSM3728859, GSM3728860, GSM3728861, GSM3728862, GSM3728863, GSM3728864, GSM3728865, GSM3728866, GSM3728867, GSM3728868, GSM3728869, GSM3728870, GSM3728871, GSM3728872, GSM3728873, GSM3728874, GSM3728875, GSM3728876, GSM3728877, GSM3728878, GSM3728879, GSM3728880, GSM3728881, GSM3728882, GSM3728883, GSM3728884, GSM3728885, GSM3728886, GSM3728887, GSM3728888, GSM4155791, GSM4155792, GSM4155793, GSM4155794, GSM4155795, GSM4155796, GSM4155797, GSM4155798, GSM4155799, GSM4155800, GSM4155801, GSM4155802, GSM4155803, GSM4155804, GSM4155805, GSM4155806, GSM4155807, GSM4155808, GSM4155809, GSM4155810, GSM4155811, GSM4155812, GSM4155813, GSM4155814, GSM4155815, GSM4155816, GSM4155817, GSM4155818, GSM4155819, GSM4155820, GSM4155821, GSM4155822, GSM4155823, GSM4155824, GSM4155825, GSM4155826, GSM4254233, GSM4254234, GSM4254235, GSM4254236, GSM4254237, GSM4254238, GSM4254239, GSM4254240, GSM4254241, GSM4254242, GSM4254243, GSM4254244, GSM4254245, GSM4254246, GSM4254247, GSM4254248, GSM4460406, GSM4460407, GSM4460408, GSM4460409, GSM4460410, GSM4517492, GSM4517493, GSM4517494, GSM4517495, GSM4517496, GSM4517497, GSM4517498, GSM4517499, GSM4517500, GSM4517501, GSM4517502, GSM4517503, GSM4517504, GSM4517505, GSM4517506, GSM4517507, GSM4517508, GSM4517509, GSM4569819, GSM4569820, GSM4569821, GSM4569822, GSM4569823, GSM4569824, GSM5282793, GSM5282794, GSM5282795, GSM5567127, GSM5567128, GSM5567129, GSM5567130, GSM5567131, GSM5567132, GSM5567133, GSM5567134, GSM5567135, GSM5567136, GSM5567137, GSM5567138, GSM5567139, GSM5567140, GSM5567141, GSM5567142, GSM5567143, GSM5567144, GSM5567145, GSM5567146, GSM5567147, GSM5567148, GSM5567149, GSM5567150, GSM7017214, GSM7017215, GSM7017216, GSM7017217, GSM7017218, GSM7017219
|
Series (30)
|
GSE61912 |
Enhancer Sequence Variants and Transcription Factor Deregulation Synergize to Construct Pathogenic Regulatory Circuits in B Cell Lymphoma (array) |
GSE62246 |
Enhancer Sequence Variants and Transcription Factor Deregulation Synergize to Construct Pathogenic Regulatory Circuits in B Cell Lymphoma |
GSE65171 |
NF-κB activation impairs somatic cell reprogramming in ageing [IKBA-SR] |
GSE65173 |
NF-κB activation impairs somatic cell reprogramming in ageing |
GSE67048 |
Identification of diffrentially expressed genes upon DDSR1 knockdown |
GSE71922 |
Loss of the proteostasis modulator AIRAPL causes myeloid transformation by deregulating IGF-1 signaling |
GSE72358 |
A BRCA1 interacting lncRNA regulates homologous recombination |
GSE77732 |
Affect of Interferon Gamma on Chordoma Cells |
GSE79376 |
Genome-wide expression profiling of USP9X/Y knockdown in the DU145 cell culture model |
GSE83811 |
Expression Data from ALDH1+ breast cancer stem cells |
GSE84072 |
Expression data from CD8+TIM-3+ and CD8+TIM-3- T cells sorted from follicular lymphoma lymph nodes |
GSE92320 |
Bio-Electric Field Enhancement: The Influence on MDA-MB231 Cells in Vitro |
GSE92638 |
Effect of STAT3 Knockdown on Gene Level Expression Profiling of hepatic stellate LX-2 Cells in response to TGF-b treatment |
GSE102203 |
Expression data from EBV+ and EBV- plasmablastic lymphomas |
GSE103611 |
Gene expression-profiling to predict distant metastasis in locoregionally advanced nasopharyngeal carcinoma |
GSE129972 |
AHR activation in glioblastoma cells [FICZ_KynA] |
GSE129974 |
AHR activation in glioblastoma cells [I3CA_U87] |
GSE129976 |
AHR activation in glioblastoma cells [I3P_HPP_PP_U87_U87] |
GSE129977 |
AHR activation in glioblastoma cells [IL4I1_shAHR_U87] |
GSE129978 |
AHR activation in glioblastoma cells and gene expression analysis of T cells in TCL1-AT mice. |
GSE140175 |
Chromatin Remodeling and Immediate Early Gene Activation by SLFN11 in Response to Replication Stress [microarray] |
GSE143240 |
Activation of AHR transcriptional activity upon treatment with indole-3-pyruvate |
GSE148322 |
Gene expression analysis of bladder cancer cell line, its BCG resistant and AR knockdown subline. |
GSE149910 |
Gene expression profile of IL4I1 knockout CAS-1 glioblastoma cells |
GSE151266 |
Identification of VIMP/SELS as a gene inhibiting cytokine production in human CD4+ effector T cells |
GSE173903 |
Human CD8 T cell transcriptomic analysis from the three male siblings of similar ages with DJ-1 loss-of-function or heterozygous mutations |
GSE173916 |
DJ-1 gene and immunoaging |
GSE183659 |
Transcriptomic analysis of synchonized AC16 cells treated with 0.5µM or 5µM digoxin after T0, T4, T16 and T20. |
GSE183661 |
Vehicle or Digoxin treatment in AC16 cells and mouse |
GSE224187 |
Enhancement of the anticancer ability of natural killer cells through allogeneic mitochondrial transfer |
|
Data table header descriptions |
ID |
probe set id |
seqname |
|
strand |
|
start |
|
stop |
|
probe_count |
|
transcript_cluster_id |
|
exon_id |
|
psr_id |
|
gene_assignment |
|
mrna_assignment |
|
probeset_type |
|
SPOT_ID |
|
Data table |
ID |
seqname |
strand |
start |
stop |
probe_count |
transcript_cluster_id |
exon_id |
psr_id |
gene_assignment |
mrna_assignment |
probeset_type |
SPOT_ID |
16657437 |
chr1 |
+ |
12200 |
12224 |
1 |
16657436 |
4977396 |
3142850 |
NR_046018 // DDX11L1 /// NR_034090 // DDX11L9 /// NR_051985 // DDX11L9 /// BC032353 // DDX11L1 /// ENST00000562189 // DDX11L9 /// ENST00000562189 // DDX11L5 /// ENST00000559159 // DDX11L9 /// ENST00000559159 // DDX11L5 /// ENST00000456328 // DDX11L5 /// ENST00000456328 // DDX11L1 /// ENST00000560040 // DDX11L9 /// ENST00000560040 // DDX11L5 /// ENST00000450305 // DDX11L5 /// ENST00000450305 // DDX11L1 /// ENST00000515173 // DDX11L9 /// ENST00000515173 // DDX11L5 /// ENST00000515242 // DDX11L5 /// ENST00000515242 // DDX11L1 /// ENST00000518655 // DDX11L5 /// ENST00000518655 // DDX11L1 /// OTTHUMT00000417614 // DDX11L9 /// OTTHUMT00000417615 // DDX11L9 /// OTTHUMT00000417616 // DDX11L9 /// OTTHUMT00000362751 // DDX11L1 /// OTTHUMT00000002844 // DDX11L1 |
NR_046018 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// NR_034090 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// NR_051985 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// BC032353 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// ENST00000562189 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// ENST00000559159 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// ENST00000456328 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// ENST00000560040 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// ENST00000450305 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// ENST00000515173 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// ENST00000515242 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// ENST00000518655 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// uc001aaa.3 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// uc010nxr.1 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// uc010nxq.1 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// uc002cds.2 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// uc010utv.1 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// uc010utw.1 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// OTTHUMT00000417614 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// OTTHUMT00000417615 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// OTTHUMT00000417616 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// OTTHUMT00000362751 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// OTTHUMT00000002844 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// n409689 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// GENSCAN00000003613 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// GENSCAN00000026650 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 |
main |
chr1(+):12200-12224 |
16657438 |
chr1 |
+ |
12616 |
12701 |
12 |
16657436 |
4977397 |
3142852 |
--- |
NR_046018 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_045117 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_024004 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_024005 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_034090 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_051985 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_051986 // chr1 // 25 // 3 // 12 // 0 /// TCONS_l2_00010384-XLOC_l2_005087 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// TCONS_l2_00010385-XLOC_l2_005087 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// TCONS_l2_00030644-XLOC_l2_015857 // chr1 // 25 // 3 // 12 // 0 /// TCONS_l2_00028588-XLOC_l2_014685 // chr1 // 38 // 3 // 8 // 0 /// TCONS_l2_00030643-XLOC_l2_015857 // chr1 // 38 // 3 // 8 // 0 /// BC032353 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000562189 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000559159 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000513886 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000456328 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AK125998 // chr1 // 25 // 3 // 12 // 0 /// ENST00000515173 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000545636 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000515242 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000518655 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000535848 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000457993 // chr1 // 100 // 9 // 8 // 0 /// ENST00000560040 // chr1 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000430178 // chr1 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000450305 // chr1 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000437401 // chr1 // 100 // 8 // 8 // 0 /// uc001aaa.3 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// uc010nxq.1 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// uc002cds.2 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// uc010utv.1 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// uc010bqm.2 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// uc010yxx.1 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// OTTHUMT00000417614 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// OTTHUMT00000417615 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// OTTHUMT00000420565 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// OTTHUMT00000362751 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// OTTHUMT00000109037 // chr1 // 100 // 9 // 8 // 0 /// OTTHUMT00000417616 // chr1 // 100 // 8 // 8 // 0 /// OTTHUMT00000195854 // chr1 // 100 // 8 // 8 // 0 /// OTTHUMT00000002844 // chr1 // 100 // 8 // 8 // 0 /// OTTHUMT00000109036 // chr1 // 100 // 8 // 8 // 0 /// uc010nxr.1 // chr1 // 100 // 7 // 6 // 0 /// uc010utw.1 // chr1 // 100 // 7 // 6 // 0 /// OTTHUMT00000058841 // chr1 // 38 // 3 // 8 // 0 /// ENST00000507418 // chr1 // 38 // 3 // 8 // 0 /// uc010sdi.1 // chr1 // 25 // 3 // 12 // 0 /// uc010sdj.1 // chr1 // 25 // 3 // 12 // 0 /// uc011llp.1 // chr1 // 25 // 3 // 12 // 0 /// uc011nad.1 // chr1 // 25 // 3 // 12 // 0 /// uc011ncc.1 // chr1 // 25 // 3 // 12 // 0 /// OTTHUMT00000051447 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENST00000426146 // chr1 // 25 // 3 // 12 // 0 /// ENST00000421620 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENST00000445777 // chr1 // 25 // 3 // 12 // 0 /// n406497 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// n406498 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// n409689 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// n386937 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000003613 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029586 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026650 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// OTTHUMT00000397513 // chr1 // 38 // 3 // 8 // 1 /// OTTHUMT00000427435 // chr1 // 38 // 3 // 8 // 1 /// OTTHUMT00000427560 // chr1 // 38 // 3 // 8 // 1 /// ENST00000535849 // chr1 // 38 // 3 // 8 // 1 /// ENST00000575871 // chr1 // 38 // 3 // 8 // 1 /// ENST00000572276 // chr1 // 38 // 3 // 8 // 1 /// GENSCAN00000051592 // chr1 // 25 // 3 // 12 // 1 /// GENSCAN00000051406 // chr1 // 25 // 3 // 12 // 1 |
main |
chr1(+):12616-12701 |
16657439 |
chr1 |
+ |
13419 |
13629 |
12 |
16657436 |
4977398 |
3142854 |
NR_046018 // DDX11L1 /// NR_034090 // DDX11L9 /// NR_051985 // DDX11L9 /// NR_045117 // DDX11L10 /// NR_051986 // DDX11L5 /// NR_024004 // DDX11L2 /// NR_024005 // DDX11L2 /// BC032353 // DDX11L1 /// ENST00000456328 // DDX11L5 /// ENST00000456328 // DDX11L1 /// ENST00000562189 // DDX11L9 /// ENST00000562189 // DDX11L5 /// ENST00000559159 // DDX11L9 /// ENST00000559159 // DDX11L5 /// ENST00000513886 // DDX11L10 /// AK125998 // DDX11L5 /// ENST00000515242 // DDX11L5 /// ENST00000515242 // DDX11L1 /// ENST00000518655 // DDX11L5 /// ENST00000518655 // DDX11L1 /// ENST00000515173 // DDX11L9 /// ENST00000515173 // DDX11L5 /// ENST00000545636 // DDX11L10 /// ENST00000450305 // DDX11L5 /// ENST00000450305 // DDX11L1 /// ENST00000535848 // DDX11L2 /// ENST00000437401 // DDX11L2 /// ENST00000457993 // DDX11L2 /// ENST00000560040 // DDX11L9 /// ENST00000560040 // DDX11L5 /// ENST00000430178 // DDX11L10 /// ENST00000538648 // DDX11L9 /// ENST00000538648 // DDX11L5 /// OTTHUMT00000362751 // DDX11L1 /// OTTHUMT00000417614 // DDX11L9 /// OTTHUMT00000417615 // DDX11L9 /// OTTHUMT00000420565 // DDX11L10 /// ENST00000426146 // DDX11L5 /// ENST00000445777 // DDX11L16 /// OTTHUMT00000002844 // DDX11L1 /// OTTHUMT00000109036 // DDX11L2 /// OTTHUMT00000109037 // DDX11L2 /// OTTHUMT00000417616 // DDX11L9 /// OTTHUMT00000195854 // DDX11L10 /// OTTHUMT00000058841 // DDX11L16 /// ENST00000507418 // DDX11L16 |
NR_046018 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NR_034090 // chr1 // 92 // 11 // 12 // 0 /// NR_051985 // chr1 // 92 // 11 // 12 // 0 /// NR_045117 // chr1 // 83 // 10 // 12 // 0 /// NR_051986 // chr1 // 75 // 9 // 12 // 0 /// NR_024004 // chr1 // 67 // 8 // 12 // 0 /// NR_024005 // chr1 // 67 // 8 // 12 // 0 /// TCONS_l2_00010384-XLOC_l2_005087 // chr1 // 83 // 10 // 12 // 0 /// TCONS_l2_00010385-XLOC_l2_005087 // chr1 // 83 // 10 // 12 // 0 /// TCONS_l2_00030644-XLOC_l2_015857 // chr1 // 75 // 9 // 12 // 0 /// TCONS_l2_00028588-XLOC_l2_014685 // chr1 // 63 // 5 // 8 // 0 /// TCONS_l2_00030643-XLOC_l2_015857 // chr1 // 63 // 5 // 8 // 0 /// BC032353 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000456328 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000562189 // chr1 // 92 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000559159 // chr1 // 92 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000513886 // chr1 // 83 // 10 // 12 // 0 /// AK125998 // chr1 // 75 // 9 // 12 // 0 /// ENST00000515242 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000518655 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENST00000515173 // chr1 // 92 // 11 // 12 // 0 /// ENST00000545636 // chr1 // 83 // 10 // 12 // 0 /// ENST00000450305 // chr1 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000535848 // chr1 // 67 // 8 // 12 // 0 /// ENST00000437401 // chr1 // 67 // 8 // 12 // 0 /// ENST00000457993 // chr1 // 67 // 8 // 12 // 0 /// ENST00000560040 // chr1 // 88 // 7 // 8 // 0 /// ENST00000430178 // chr1 // 75 // 6 // 8 // 0 /// ENST00000538648 // chr1 // 100 // 4 // 4 // 0 /// uc001aaa.3 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// uc010nxr.1 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// uc010nxq.1 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// OTTHUMT00000362751 // chr1 // 100 // 12 // 12 // 0 /// uc002cds.2 // chr1 // 92 // 11 // 12 // 0 /// uc010utv.1 // chr1 // 92 // 11 // 12 // 0 /// uc010utw.1 // chr1 // 92 // 11 // 12 // 0 /// OTTHUMT00000417614 // chr1 // 92 // 11 // 12 // 0 /// OTTHUMT00000417615 // chr1 // 92 // 11 // 12 // 0 /// uc010sdi.1 // chr1 // 83 // 10 // 12 // 0 /// uc010sdj.1 // chr1 // 83 // 10 // 12 // 0 /// uc010bqm.2 // chr1 // 83 // 10 // 12 // 0 /// OTTHUMT00000420565 // chr1 // 83 // 10 // 12 // 0 /// uc011llp.1 // chr1 // 75 // 9 // 12 // 0 /// uc011nad.1 // chr1 // 75 // 9 // 12 // 0 /// uc011ncc.1 // chr1 // 75 // 9 // 12 // 0 /// ENST00000426146 // chr1 // 75 // 9 // 12 // 0 /// ENST00000445777 // chr1 // 75 // 9 // 12 // 0 /// uc010yxx.1 // chr1 // 67 // 8 // 12 // 0 /// OTTHUMT00000002844 // chr1 // 100 // 8 // 8 // 0 /// OTTHUMT00000109036 // chr1 // 67 // 8 // 12 // 0 /// OTTHUMT00000109037 // chr1 // 67 // 8 // 12 // 0 /// OTTHUMT00000417616 // chr1 // 88 // 7 // 8 // 0 /// OTTHUMT00000195854 // chr1 // 75 // 6 // 8 // 0 /// OTTHUMT00000058841 // chr1 // 63 // 5 // 8 // 0 /// ENST00000507418 // chr1 // 63 // 5 // 8 // 0 /// n409689 // chr1 // 92 // 11 // 12 // 0 /// n386937 // chr1 // 83 // 10 // 12 // 0 /// n406497 // chr1 // 67 // 8 // 12 // 0 /// n406498 // chr1 // 67 // 8 // 12 // 0 |
main |
chr1(+):13419-13629 |
16657441 |
chr1 |
+ |
29561 |
29993 |
7 |
16657440 |
4977400 |
3142857 |
ENST00000422679 // MIR1302-11 /// ENST00000422679 // MIR1302-10 /// ENST00000422679 // MIR1302-9 /// ENST00000422679 // MIR1302-2 |
ENST00000422679 // chr1 // 86 // 6 // 7 // 0 |
main |
chr1(+):29561-29993 |
16657442 |
chr1 |
+ |
30270 |
30532 |
7 |
16657440 |
4977401 |
3142859 |
ENST00000422679 // MIR1302-11 /// ENST00000422679 // MIR1302-10 /// ENST00000422679 // MIR1302-9 /// ENST00000422679 // MIR1302-2 |
ENST00000422679 // chr1 // 100 // 7 // 7 // 0 |
main |
chr1(+):30270-30532 |
16657443 |
chr1 |
+ |
30594 |
30656 |
7 |
16657440 |
4977401 |
3142860 |
ENST00000422679 // MIR1302-11 /// ENST00000422679 // MIR1302-10 /// ENST00000422679 // MIR1302-9 /// ENST00000422679 // MIR1302-2 |
ENST00000422679 // chr1 // 100 // 7 // 7 // 0 |
main |
chr1(+):30594-30656 |
16657444 |
chr1 |
+ |
31031 |
31102 |
7 |
16657440 |
4977402 |
3142862 |
ENST00000422679 // MIR1302-11 /// ENST00000422679 // MIR1302-10 /// ENST00000422679 // MIR1302-9 /// ENST00000422679 // MIR1302-2 |
ENST00000422679 // chr1 // 71 // 5 // 7 // 0 |
main |
chr1(+):31031-31102 |
16657446 |
chr1 |
+ |
69541 |
69583 |
8 |
16657445 |
4977404 |
3142865 |
NM_001005484 // OR4F5 /// ENST00000335137 // OR4F5 |
NM_001005484 // chr1 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENST00000335137 // chr1 // 100 // 8 // 8 // 0 |
main |
chr1(+):69541-69583 |
16657448 |
chr1 |
+ |
160543 |
160569 |
2 |
16657447 |
4977406 |
3142868 |
OTTHUMT00000007169 // OTTHUMG00000002525 /// OTTHUMT00000007169 // RP11-34P13.9 |
OTTHUMT00000007169 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// n363361 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENST00000496488 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// TCONS_00000119-XLOC_000001 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 |
main |
chr1(+):160543-160569 |
16657449 |
chr1 |
+ |
161464 |
161501 |
11 |
16657447 |
4977407 |
3142870 |
OTTHUMT00000007169 // OTTHUMG00000002525 /// OTTHUMT00000007169 // RP11-34P13.9 |
OTTHUMT00000007169 // chr1 // 100 // 11 // 11 // 0 /// n363361 // chr1 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENST00000496488 // chr1 // 100 // 11 // 11 // 0 /// TCONS_00000119-XLOC_000001 // chr1 // 100 // 11 // 11 // 0 |
main |
chr1(+):161464-161501 |
16657452 |
chr1 |
+ |
320408 |
320565 |
2 |
16657450 |
4977410 |
3142875 |
NR_039983 // LOC729737 |
NR_039983 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 |
main |
chr1(+):320408-320565 |
16657453 |
chr1 |
+ |
320883 |
320913 |
2 |
16657450 |
4977411 |
3142877 |
OTTHUMT00000346878 // OTTHUMG00000156968 /// OTTHUMT00000346878 // RP4-669L17.10 /// OTTHUMT00000461271 // OTTHUMG00000156968 /// OTTHUMT00000461271 // RP4-669L17.10 /// ENST00000432964 // LOC101060495 /// ENST00000432964 // LOC101060494 /// ENST00000432964 // LOC101059936 /// ENST00000432964 // LOC100996502 /// ENST00000432964 // LOC100996328 /// ENST00000432964 // LOC100287894 /// ENST00000601486 // LOC101060495 /// ENST00000601486 // LOC101060494 /// ENST00000601486 // LOC101059936 /// ENST00000601486 // LOC100996502 /// ENST00000601486 // LOC100996328 /// ENST00000601486 // LOC100287894 |
uc003mns.2 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// OTTHUMT00000346878 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// OTTHUMT00000461271 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENST00000432964 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENST00000601486 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// n363362 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// TCONS_00000120-XLOC_000002 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 |
main |
chr1(+):320883-320913 |
16657454 |
chr1 |
+ |
322068 |
322214 |
2 |
16657450 |
4977413 |
3142881 |
AK302511 // LOC100132062 /// ENST00000526704 // LOC101060495 /// ENST00000526704 // LOC101059936 |
AK302511 // chr1 // 50 // 1 // 2 // 0 /// ENST00000526704 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 |
main |
chr1(+):322068-322214 |
16657455 |
chr1 |
+ |
322734 |
322967 |
3 |
16657450 |
4977414 |
3142883 |
OTTHUMT00000346881 // OTTHUMG00000156968 /// OTTHUMT00000346881 // RP4-669L17.10 /// ENST00000419160 // LOC101060495 /// ENST00000419160 // LOC101060494 /// ENST00000419160 // LOC101059936 /// ENST00000419160 // LOC100996502 /// ENST00000419160 // LOC100996328 /// ENST00000419160 // LOC100287894 |
OTTHUMT00000346881 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 /// ENST00000419160 // chr1 // 100 // 3 // 3 // 0 |
main |
chr1(+):322734-322967 |
16657456 |
chr1 |
+ |
323985 |
324009 |
1 |
16657450 |
4977415 |
3142885 |
OTTHUMT00000462548 // OTTHUMG00000156968 /// OTTHUMT00000462548 // RP4-669L17.10 /// ENST00000601814 // LOC101060495 /// ENST00000601814 // LOC101060494 /// ENST00000601814 // LOC101059936 /// ENST00000601814 // LOC100996502 /// ENST00000601814 // LOC100996328 /// ENST00000601814 // LOC100287894 |
uc001aau.3 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// uc001abe.4 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// uc010jlw.3 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// OTTHUMT00000462548 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// ENST00000601814 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 /// n408179 // chr1 // 100 // 1 // 1 // 0 |
main |
chr1(+):323985-324009 |
16657457 |
chr1 |
+ |
324312 |
324340 |
2 |
16657450 |
4977416 |
3142887 |
OTTHUMT00000346880 // OTTHUMG00000156968 /// OTTHUMT00000346880 // RP4-669L17.10 /// OTTHUMT00000346879 // OTTHUMG00000156968 /// OTTHUMT00000346879 // RP4-669L17.10 /// OTTHUMT00000462548 // OTTHUMG00000156968 /// OTTHUMT00000462548 // RP4-669L17.10 /// ENST00000440038 // LOC101060495 /// ENST00000440038 // LOC101060494 /// ENST00000440038 // LOC101059936 /// ENST00000440038 // LOC100996502 /// ENST00000440038 // LOC100996328 /// ENST00000440038 // LOC100287894 /// ENST00000423728 // LOC101060495 /// ENST00000423728 // LOC101060494 /// ENST00000423728 // LOC101059936 /// ENST00000423728 // LOC100996502 /// ENST00000423728 // LOC100996328 /// ENST00000423728 // LOC100287894 /// ENST00000601814 // LOC101060495 /// ENST00000601814 // LOC101060494 /// ENST00000601814 // LOC101059936 /// ENST00000601814 // LOC100996502 /// ENST00000601814 // LOC100996328 /// ENST00000601814 // LOC100287894 |
uc009vjk.2 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// uc001aau.3 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// uc021oeh.1 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// uc001abe.4 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// uc002khh.3 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// uc002fqs.2 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// uc003mns.2 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// uc010jlv.2 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// uc010jlw.3 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// OTTHUMT00000346880 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// OTTHUMT00000346879 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// OTTHUMT00000462548 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENST00000440038 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENST00000423728 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENST00000601814 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// n408179 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 |
main |
chr1(+):324312-324340 |
16657458 |
chr1 |
+ |
324589 |
324675 |
2 |
16657450 |
4977417 |
3142890 |
NR_039983 // LOC729737 /// AK302511 // LOC100132062 /// AK294489 // LOC729737 /// AK123446 // LOC441124 /// ENST00000526704 // LOC101060495 /// ENST00000526704 // LOC101059936 |
NR_039983 // chr1 // 50 // 1 // 2 // 0 /// AK302511 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// AK294489 // chr1 // 50 // 1 // 2 // 0 /// TCONS_l2_00001802-XLOC_l2_001332 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// TCONS_l2_00001804-XLOC_l2_001332 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// TCONS_l2_00002815-XLOC_l2_001399 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// TCONS_l2_00001922-XLOC_l2_000001 // chr1 // 50 // 1 // 2 // 0 /// TCONS_l2_00001923-XLOC_l2_000001 // chr1 // 50 // 1 // 2 // 0 /// AK123446 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENST00000526704 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 |
main |
chr1(+):324589-324675 |
16657459 |
chr1 |
+ |
324691 |
324718 |
2 |
16657450 |
4977417 |
3142891 |
NR_039983 // LOC729737 /// AK294489 // LOC729737 /// AK123446 // LOC441124 /// ENST00000526704 // LOC101060495 /// ENST00000526704 // LOC101059936 |
NR_039983 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// AK294489 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// TCONS_l2_00001802-XLOC_l2_001332 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// TCONS_l2_00001804-XLOC_l2_001332 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// TCONS_l2_00001922-XLOC_l2_000001 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// TCONS_l2_00001923-XLOC_l2_000001 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// TCONS_l2_00002815-XLOC_l2_001399 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// AK123446 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENST00000526704 // chr1 // 50 // 1 // 2 // 0 |
main |
chr1(+):324691-324718 |
16657460 |
chr1 |
+ |
324719 |
324744 |
2 |
16657450 |
4977417 |
3142892 |
NR_039983 // LOC729737 /// AK294489 // LOC729737 /// AK302511 // LOC100132062 /// AK123446 // LOC441124 /// ENST00000526704 // LOC101060495 /// ENST00000526704 // LOC101059936 |
NR_039983 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// AK294489 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// AK302511 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// TCONS_l2_00001922-XLOC_l2_000001 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// TCONS_l2_00001923-XLOC_l2_000001 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// TCONS_l2_00002815-XLOC_l2_001399 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// TCONS_l2_00002817-XLOC_l2_001399 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// AK123446 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 /// ENST00000526704 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 |
main |
chr1(+):324719-324744 |
16657461 |
chr1 |
+ |
324770 |
324795 |
2 |
16657450 |
4977417 |
3142893 |
BC092421 // FLJ45340 |
BC092421 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 0 |
main |
chr1(+):324770-324795 |
Total number of rows: 353131
Table truncated, full table size 274850 Kbytes.
Supplementary data files not provided |
|
|
|
|
 |