Conserved Protein Domain Family
PRK00771

?
PRK00771: PRK00771 
signal recognition particle protein Srp54; Provisional
Statistics
?
PSSM-Id: 179118
Aligned: 93 rows
Threshold Bit Score: 576.389
Created: 9-Dec-2010
Updated: 25-Oct-2021
Structure
?
Aligned Rows:
Sequence Alignment
?
Format: Row Display: Color Bits: Type Selection:
15897850    1 MLENIRDAVRKFLTGSTPYEKAVDEFIKDLQKSLISSDVNVKLVFSLTAKIKERLNKEKPPSVLERKEWFISIVYDELSK 80 
170289017   5 LQEKLSRVFKNLSGRGKITEKNVKDAIREVKLSLLEADVNYKVVKEFVDHVLQKALGEEVLRSLTPDQQFIKIVRDELVR 84 
15644313    5 LQEKLSRVFKNLSGRGKITEKNVKDAIREVKLSLLEADVNYKVVKEFVDHVLQKALGEEVLRSLTPDQQFIKIVRDELVR 84 
222100122   5 LQEKLSRVFKNLSGRGKITEKNVKDAVREVKLSLLEADVNYKVVKEFVDHVLQKALGEEVLKSLTPDQQFIKIVRDELIK 84 
148270357   5 LQEKLSRVFKNLSGRGKITEKNVKDAIREVKLSLLEADVNYKVVKEFVDHVLQKALGEEVLRSLTPDQQFIKIVRDELVR 84 
281412663   5 LQEKLSRVFKNLSGRGKITEKNVKDAIREVKLSLLEADVNYKVVKEFVDHVLQKALGEEVLRSLTPDQQFIKIVRDELVR 84 
157362996   5 LQERLSKIFRSLTGQGRLTEKNINEAVRQVKLSLLEADVNFKVVKEFIDSVKAKALGEEVLKSFTPDQQFVKIVRDELIN 84 
150021672   5 LQEKLSKAFKTLSGKGKITEKNIKEAIKIVKLSLLEADVNYKVVKEFIEDVKKKALGEKVLRSLTPDQMFIKILRDELIK 84 
217076198   5 LQEKLSKAFKTLSGKGKITEKNIKEAIKMVKLSLLEADVNYKVVKEFIAEVTEKATGEEVLKSLTPDQMFIKILRDELIR 84 
154249332   5 LRDKLSNAFKVLSGKGKITERNIEEAIQIVKTALLAADVNYKVVKEFVENVKKRALGEEVLKSLTPDQMFVKIIRDELIK 84 
15897850   81 LFGGDKEPNVNPtKLPFIIMLVGVQGSGKTTTAGKLAYFYKKRGYKVGLVAADVYRPAAYDQLLQLGNQIGVQVYGEpNN 160
170289017  85 IMGEKNEPLRLV-HRPAPIMMVGLQGSGKTTTCAKLAKLLKKEGRNPLLVAADLYRPAAVDQLVKLGNQIGVNVVHD-YN 162
15644313   85 IMGEKNEPLRLV-HRPAPIMMVGLQGSGKTTTCAKLAKLLKKEGRNPLLVAADLYRPAAVDQLVKLGNQIGVNVVHD-YN 162
222100122  85 IMGEKNEPLRLI-HRPAPIMMVGLQGSGKTTTCAKLAKLLKKEGRNPLLVAADLYRPAAVDQLVKLGNQIGVNVVHD-YN 162
148270357  85 IMGEKNEPLRLV-HRPAPIMMVGLQGSGKTTTCAKLAKLLKKEGRNPLLVAADLYRPAAVDQLVKLGNQIGINVVHD-YN 162
281412663  85 IMGEKNEPLRLV-HRPAPIMMVGLQGSGKTTTCAKLAKLLKKEGRNPLLVAADLYRPAAVDQLVKLGNQIGVNVVHD-YN 162
157362996  85 IMGKSAATLNLR-HHPSVIMLVGLQGSGKTTTAAKLANYLRKSGRTVLLVAADTYRPAAIDQLEKLGKSIQIPVLTG-DR 162
150021672  85 LMGEKQPLKMI--HSPSYIMMVGLQGSGKTTSAAKLANLLKKKGRKPYLVAADTYRPAAIDQLITLGKKIDVPVYCG-DR 161
217076198  85 VMGEKSQLSLV--HSPSYIMMVGLQGSGKTTSAAKLANLLKKKGKKTFLVAADTYRPAAIDQLITLGKKIDVPVFYG-DR 161
154249332  85 LLGEREPFKLI--HRPAYIMMVGLQGTGKTTSAAKIANYLKKQGKNPILVAADTYRPAAIDQLETLGKKIGVPVITG-DR 161
15897850  161 QNPIEIAKKGVDIFVKNkmDIIIVDTAGRHgyGEETKLLEEMKEMYDVLKPDDVILVIDASIGQKAYDLASRFHQASPIG 240
170289017 163 KTPVEIVKEAVDVAESTgkDVLIVDTAGRL--HIDEEMMKELEEIKKILNPDEILLVVDAMMGQDAVNTAKVFDERLDLT 240
15644313  163 KTPVEIVKEAVDVAESTgkDVLIVDTAGRL--HIDEEMMKELEEIKKILNPDEILLVVDAMMGQDAVNTAKVFDERLDLT 240
222100122 163 KSPVEIVKEGIQEAERTgkDVLIVDTAGRL--HIDEDMMRELEEIKAILNPDEILLVVDAMMGQDAVNTAKVFDERLDLT 240
148270357 163 KTPVEIVKEAVDVAESTgkDILIVDTAGRL--HIDEEMMKELEEIKKILNPDEILLVVDAMMGQDAVNTAKVFDERLDLT 240
281412663 163 KTPVEIVKEAVDVAESTgkDILIVDTAGRL--HIDEEMMKELEEIKKILNPDEILLVVDAMMGQDAVNTAKVFDERLDLT 240
157362996 163 KNPLIIVQQALEYSKNSqyNTLIFDTAGRL--HIDEEMMEELQQIKQLSNPDEILMVVDAMIGQDAVNSALEFDKRLNVT 240
150021672 162 KHPIKIVEEALKEVKDSgyDVVIFDTAGRL--HIDNEMMNELVEIKEILSPDEILMVVDAMTGQDAVNSAKTFNEKLDVT 239
217076198 162 KDPVKIVREAIKEVKDSgyNVVIFDTAGRL--HVDDEMMNELEEIKDILNPDEILMVVDAMAGQDAVNSAKIFNERLDVT 239
154249332 162 KNALKIVEEAKKQVKDSghDVVILDTAGRL--HIDDEMMQELEQIKEMVNPDEILLTVDAMAGQDAVNSGKTFNDRLNVT 239
15897850  241 SVIITKMDGTAKGGGALSAVVATGATIKFIGTGEKIDELETFNAKRFVSRILGMGDIESILEKVKGLEEYDKIQKKMEDV 320
170289017 241 GFVVTKMDGDARGGVILSIKYVTGKPVKFIGTSEKLDGLEPFHPDRIANRILGMGDVLSLIEKVEKELDQEKMKKSAEKF 320
15644313  241 GFVVTKMDGDARGGVILSIKYVTGKPVKFIGTSEKLDGLEPFHPDRIANRILGMGDVLSLIEKVEKELDQEKMKKSAEKF 320
222100122 241 GFVVTKMDGDARGGVILSIKYVTGKPVKFIGTSEKLDGLEPFHPDRIANRILGMGDVLSLIEKVERELDQEKMKKSAEKF 320
148270357 241 GFVVTKMDGDARGGVILSIKYVTGKPVKFIGTSEKIDGLEPFHPDRIANRILGMGDVLSLIEKVEKELDQEKMKKSAEKF 320
281412663 241 GFVVTKMDGDARGGVILSIKYVTGKPVKFIGTSEKIDGLEPFHPDRIANRILGMGDVLSLIEKVEKELDQEKMKKSAEKF 320
157362996 241 GFIVTKMDGDARGGVILSITHITGKPVKFIGVGEKIDAFEQFHPDRVAARILGMGDVLSLIEKAEKELDKEKMEKVGKKI 320
150021672 240 GFVVTKMDGDARGGVILSIRYVTNKPVKFIGVGEKIEDLEEFYPERIASRILGLGDVLTLIEKAEKELDKEKMKTLGKKM 319
217076198 240 GYVVTKMDGDARGGVILSIRYITNKPIKFIGVGEKIEDLEEFHPERIASRILGLGDVLSLIEKAEQELDKDKMQKLGKKM 319
154249332 240 GFVITKLDGDSRGGVILTIRYITGKPVKFVGVGEKIDDFDEFYPDRIASRILGLGDMLSLIEKVERELDKEKMEKMSQKF 319
15897850  321 MEGkgKLTLRDVYAQIIALRKMGPLSKVLQHIPglgiMLPTpseDQLKIGEEKIRRWLAALNSMTYKELENPNIIDKSRM 400
170289017 321 LKA--EFTLEDFKEQLQEMKKLGPLSSILEMLP----GAPK---VDVEMSEKELKKIEAIINSMTIEERRNPGIINASRK 391
15644313  321 LKA--EFTLEDFKEQLQEMKKLGPLSSILEMLP----GAPK---VDVEMSEKELKKIEAIINSMTIEERRNPGIINASRK 391
222100122 321 LKA--EFTLEDFKEQLQEMKKLGPLSSILEMLP----GAPK---VDVEMSEKELKKIEAIINSMTIEERRNPRIIDASRK 391
148270357 321 LKA--EFTLEDFKEQLQEMKKLGPLSSILEMLP----GAPK---VDVEMSEKELKKIEAIINSMTIEERRNPGIINASRK 391
281412663 321 LKA--EFTLEDFKEQLQEMKKLGPLSSILEMLP----GAPK---VDVEMSEKELKKIEAIINSMTIEERRNPGIINASRK 391
157362996 321 LQA--EFTLEDFQEQLKEMKKLGPLSSLIEMLP----GAPK---IDVETSEQQLKKVEAIINSMTIEERRNPRVLNASRR 391
150021672 320 INA--EFTLEDFQEQLKEIKKLGSLSKIMELLP----GAPK---VDIEQGEREMKITEAIINSMTPEERRNPKILNASRK 390
217076198 320 LNA--EFTLEDFQEQLKEIKKLGSLSKIVEMLP----GSPK---VDINQSEKELKVIEAIINSMTPEERRNPKILNASRK 390
154249332 320 MRA--EFTLEDFREQIKEIKKLG-IDKILEALP----GSPQ---VDLDTSEKELKRIEAIINSMTPEERNNPDIINASRK 389
15897850  401 RRIAEGSGLEVEEVRELLEWYNNMNRLLKMVKRrrGNIDKLFGGKIG 447
170289017 392 RRIARGSGTTVQDVNKLLKSYEQMKALMKRMKK-----GRFKIPFGF 433
15644313  392 RRIARGSGTTVQDVNKLLKSYEQMKALMKRMKK-----GRFKIPFGF 433
222100122 392 RRIARGSGTTVQDVNKLLKSYEQMKVLMKRMKK-----GKFKIPFGF 433
148270357 392 RRIARGSGTTVQDVNKLLKSYEQMKALMKRMKK-----GRFKIPFGF 433
281412663 392 RRIARGSGTTVQDVNKLLKSYEQMKALMKRMKK-----GRFKIPFGF 433
157362996 392 QRIAKGSGTSVQDVNKLLKSYEEMKELMKRLKH-----GKLKLPFKI 433
150021672 391 RRIALGSGTTVQDINKLLKNYEEMKKMMKMFKK--GKLPFNLKGFKL 435
217076198 391 KRIAKGSGTSVQEVNKLLKNYEEMKKMMKIFKK--GKLPFNLKGFKI 435
154249332 390 KRIAAGSGTTVQDINKLLKSYEEMKKLMKTMKK--GKMPFALKGFKF 434
| Disclaimer | Privacy statement | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap