All KIR sequences deposited in GenBank were included in this alignment, some of which have not been confirmed in a second study. When identical sequences were deposited, the longest was used here. KIR sequences that were not assigned to a particular KIR gene were designated as alleles of a specific KIR gene if they differed by <2% from the consensus sequence of that gene. A curated alignment of confirmed KIR sequences can be found at http://www.ebi.ac.uk/ipd/kir
Key: - identity with consensus sequence; . gap; * deletion. Note: AY059417 is a hybrid of 3DL1 and 3DL2.
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1 100 2dl1_u24078 .-------c- -t------t- ---------t ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_ac011501 .......... ..------t- ---------t ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_af285431 ........c- -t------t- ---------t ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_l41267 .........- -t------t- ---------t ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_u24076 ........c- c-t-g-cgt- ---------t ---------- ---------- t--t------ ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_af022045 .......... .......... .......... ....------ ---------- t--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_af135560 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl1_af285432 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kirg2_af001885-8 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir221_af133901 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds1_al133414 .......... .......... .--------- ---------- ---------- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds1_x98858 .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds1_x89892 .......... .......... .--------- ---------- ---------- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds1_af285437 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- 2dl2_u24075 .......... .......... .......--- -a-a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl2_al133414 .......... .......... .......... -a-a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl2_l76669 .......... .......... .......... -a-a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl2_af285433 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- 2dl2_af285434 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- 2ds2_al133414 .......... .......... ..-------- -a-a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_l41347 .......... .......... ..-------- -a-a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_x89893 .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------g- 2ds2_af285439 .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_af285438 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- kir2d_aj002102 .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- --------c- ---------- ---------- ---------- kir2d_aj002103 .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kir2d_aj002105 .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_u97173-80 .--------- ---------- ---------- -a-a------ ---------- ---------- ------t--- ---------- ---------- ---------- 2dl3_af082936-9 .--------- ---------- ---------- -a-a------ ---------- ---------- ------t--- ---------- ---------- ---------- 2dl3_af022048 .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_af285435 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- 2dl3_l76662 .......... .......... .......... -a-a------ ---------- ---------- ------t--- ---------- ---------- ---------- 2dl3_l76663 .......... .......... .......... -a-a------ ---------- ---------- ------t--- ---------- ---------- ---------- 2dl3_u73395 .......... .......... .--------- -a-a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_u96190 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir412_af134312-6 .-------.- ---------- ---------- -a-a------ ---------- ---------- ------t--- ---------- ---------- ---------- kircl23_af133896-900 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds3_x97231 ctgagcta-- --t------- ---------t ------c--- ---------- ------a--- -------a-- ---------- ----g----- ---------- 2ds3_af022047 .......... .......... .......... .......--- ---------- ------a--- -------a-- ---------- ----g----- ---------- 2ds3_l76670 .......... .......... .......... ---------- ---------- ------a--- -------a-- ---------- ----g----- ---------- 2ds4_ac011501 .......... .--------- ---------- ---------- ---------- ------a--- t--------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_af215832 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417555 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_af002255 .--------- -------t-- ---------- ---------- ---------- ------a--- t--------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_l76671 .......... .......... .......... ---------- ---------- ------a--- t--------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_af285440 .......... .......... .......--- ---------- ---------- ------a--- t--------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_x94609 .--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------a--- t--------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_u96188 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_af082961 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417554 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- ---------- ---------- 2ds5_al133414 .......... .......... .......... ---------- ---------- ------a--- ---------- -----c---- ---------- ---------- 2ds5_af272389 .......... .......... .......... .......... .......... .......--- ---------- -----c---- ---------- ---------- 2ds5_l76672 .......... .......... .......... ---------- -----t---- ------a--- ---------- -----c---- ---------- ---------- 2dl4_bc028137 ********** ********** ***agaa--t g-ac--tgt- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- 2dl4_af285436 ********** ********** ***agaa--t g-ac--tgt- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- 2dl4_af002980 ********** ********** ***agaa--t g-ac--tgt- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- 2dl4_u71199 ********** ********** ***agaa--t g-ac--tgt- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- 2dl4_x97229 ********** ********** ***....... .....-tgt- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- 2dl4_ac011501 ********** ********** ***....... .....-tgt- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- 2dl4_al133414 ********** ********** ***....... ...c--tgt- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- 2dl4_af002979 ********** ********** ***....... .....-tgt- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- 2dl4_af276292 ********** ********** ***....... .....-tgt- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- 2dl4_ay052496 ********** ********** ***....... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl4_ay052498 ********** ********** ***....... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl4_af002256 ********** ********** ***....... .........- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- 2dl4_af034772 ********** ********** ***....... .........- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- 2dl4_af034771 ********** ********** ***....... .........- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- 2dl4_x99480 ********** ********** ***....... .........- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- kir2dl_x99481 ********** ********** ***....... .....-tgt- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- kirg9p_af110032-5 ********** ********** ***....... .....-tgt- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- kir2dl_y13054 ********** ********** ***....... .....-tgt- ------a-c- -c----a--- t-c----a-- -c-------- ------gac- --a-t-tg-- 2dl5_af217486 .--------- --------t- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl5_af204903 .--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------a--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl5_af260138-41 .--------- --------t- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------. .....----- ---------- ---------- 2dl5_af217487 .......... .......--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dlx_af271608 .......... .......... .......... .......... .--------- ------a--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dlx_af272157 .--------- --------t- ---------- ---------- ---------- ------a--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dlx_af271607 .......... .......... .......... .......... .--------- ------a--- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_bc028206 .......... ....-a---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------g ------g-c- --a-----g- 3dl1_ay059417 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_u30274 .--------- -----a---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------g ------g-c- --a-----g- 3dl1_u31416 .......... ......c-ac g-gtc-g--- ---------- -----t---- ---------- ---------- ---------- ------g-c- --a-----g- 3dl1_af022049 .......... .......... .......... .......... .----t---- ---------- ---------- ---------- ------g-c- --a-----g- 3dl1_u33328 .......... ......c-ac g-gtc-g--- ---------- -----t---- ---------- ---------- ---------- ------g-c- --a-----g- 3dl1_af103010 .......... .......... .......... .......... .----t---- ---------- ---------- ---------- ------g-c- --a-----g- 3dl1_af104848-56 .......... .......... .......... .......... .----t---- ---------- ---------- ---------- ------g-c- --a-----g- 3dl1_af103011 .......... .......... .......... .......... .----t---- ---------- ---------- ---------- ------g-c- --a-----g- 3dl1_af103013 .......... .......... .......... .......... .----t---- ---------- ---------- ---------- ------g-c- --a-----g- 3dl1_af103012 .......... .......... .......... .......... .----t---- ---------- ---------- ---------- ------g-c- --a-----g- 3dl1_af082956-9 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af208688 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af208689 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af262968 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af262969 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ..a-----g- 3dl1_af262970 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af262971 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af262972 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af262973 .......... .......... .......... .......... .----t---- ---------- ---------- ---------- ------g-c- --a-----g- 3dl1_af262974 .......... .......... .......... .......... .----t---- ---------- ---------- ---------- ------g-c- --a-----g- 3dl_af105231-9 .......... .......... .......... .......... .----t---- ---------- ---------- ---------- ------g-c- --a-----g- 3dl_x97230 .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- ---------- ---------g ------g-c- --a-----g- 3ds1_aj417558 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ..a-----g- 3ds1_l76661 .......... .......... .......... ---------- ---------- ---------- ---------- ---------g ------g-c- --a-----g- 3ds1_af022044 .......... .......... ........-- ---------- -----t---- ---------- ---------- ---------g ------g-c- --a-----g- 3ds1_al133414 .......... .......... .......... ---------- -----t---- ---------- ---------- ---------g ------g-c- --a-----g- 3ds1_u73396 .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- ---------- ---------g ------g-c- --a-----g- 3ds1_x97233 .......... .......... .......... .......... .--------- ---------- ---------- ---------g ------g-c- --a-----g- 3dl2_x93595 .......... .--------t ---------- ---------- ---------- -c-------- ---------- c--------- ---------- ---------- 3dl2_ay059418 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_ay059419 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_ay059420 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_l41270 .......... .......... ..-------- ---------- ---------- -c-------- ---------- c--------- ---------- ---------- 3dl2_al133414 .......... .......... .......... ---------- ---------- -ct------- ---------- c--------- ---------- ---------- 3dl2_l76665 .......... .......... .......... ---------- ---------- -c-------- ---------- c--------- ---------- ---------- 3dl2_l76666 .......... .......... .......... ---------- ---------- -c-------- ---------- c--------- ---------- ---------- 3dl2_u30272 .......... .......... .......... .........- ---------- -ct------- ---------- c--------- ---------- ---------- 3dl2_x93596 .......... .......... .......... .......... .--------- -c-------- ---------- c--------- ---------- ---------- 3dl2_af262966 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af262965 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af263617 .......... .......... .......... .......... .--------- -c-------- ---------- c--------- ---------- ---------- 3dl2_af082963-7 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208683 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208684 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208685 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208686 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208687 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_aj276125 .......... .......... .......... .......... ---------- -ct------- ---------- c--------- ---------- ---------- kirc1_ac006293 .--------- -----a---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------g -----c---- kirc1_af072407-10 .--------- -----a---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------g -----c---- kirc1_af352324 .......... .......... ...------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------g -----c---- 3dl3_al133414 .......... .......... ........-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------g -----c---- 3dl3_ay083462 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir44b_af204912-14 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .....----- ---------g -----c---- kirx_af082931-5 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kirz_ac006293 .......... .......... ......---- ---------- ---------- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- kir15_af204906-8 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .....----- ---------- ---------- kiry_af082940-7 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kirx_al133414 .......... ......--t- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kirx_ac011501 .......... ......--t- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----***** ********** ********** kir48_af204918-20 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .....----- ---------- ---------- kir222_af133901 ..ctgagct- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----***** ********** ********** kir411_af134311-2 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... Consensus -CTGAGCTGG GGCGCGGCCG CCTGTCTGCA CCGGCAGCAC CATGTCGCTC ATGGTCGTCA GCATGGCGTG TGTTGGGTTC TTCTTGCTGC AGGGGGCCTG 101 200 2dl1_u24078 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl1_ac011501 ---------. ---------- ---------- g--------- -----a---c ---------- --c--***-- --t----t-- ---a------ t-c-ta--t- 2dl1_af285431 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl1_l41267 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl1_u24076 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl1_af022045 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl1_af135560 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl1_af285432 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kirg2_af001885-8 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir221_af133901 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds1_al133414 ---------- ---------- ---------- g--------- -----a---c ---------- --c--***-- t-t----t-- ---a------ t-c-ta--t- 2ds1_x98858 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds1_x89892 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds1_af285437 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl2_u24075 ---------- ---------- ---------- g--------- ---------c t--------- --t--***-- --t--c-t-- ---------- --c-ta--t- 2dl2_al133414 ---------. ---------- ---------- g--------- ---------c t--------- --t--***-- --t--c-t-- ---------- --c-ta--t- 2dl2_l76669 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl2_af285433 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl2_af285434 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds2_al133414 ---------- ---------- ---------- g--------- ---------c t--------- --t--***-- --t--c-t-- ---------- --c-ta--t- 2ds2_l41347 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds2_x89893 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds2_af285439 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds2_af285438 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir2d_aj002102 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir2d_aj002103 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir2d_aj002105 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl3_u97173-80 ---------- ---------- ---------- g--------- -----a---c ---------- --c--***-- --t----t-- ---a------ t-c-ta--t- 2dl3_af082936-9 ---------- ---------- ---------- g--------- ---------c t--------- --t--***-- --t--c-t-- ---------- --c-ta--t- 2dl3_af022048 ---------- ---------- ---------- g--------- ---------c t--------- --t--***-- --t--c-t-- ---------- --c-ta--t- 2dl3_af285435 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl3_l76662 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl3_l76663 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl3_u73395 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl3_u96190 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir412_af134312-6 ---------- ---------- ---------- g--------- ---------c t--------- --t--***-- --t--c-t-- ---------- --c-ta--t- kircl23_af133896-900 .......... .--------- ---------- g--------- ---------c t--------- --t--***-- --t--c-t-- ---------- --c-ta--t- 2ds3_x97231 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds3_af022047 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds3_l76670 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_ac011501 ------g--. ---------- ---------- g--t---a-- ---------c t--------- --c--***a- --t------- ---a------ --c-aa--t- 2ds4_af215832 .......... .--------- ---------- g--t---a-- ---------c t--------- --c--***a- --t------- ---a------ --c-aa--t- 2ds4_aj417555 ------g--- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_af002255 ------g--- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_l76671 ------g--- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_af285440 ------g--- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_x94609 ------g--- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_u96188 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_af082961 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417554 ------g--- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds5_al133414 ---------- ---------- ---------- g--t---a-- ---------c t--------- --c--***a- --t------- ---------- --c-aa--t- 2ds5_af272389 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds5_l76672 ---------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl4_bc028137 -g----c-t- ---------- ---------- -tgc------ ---------- ---------- --a------- ---------- ---------- ---------- 2dl4_af285436 -g----c-t- ---------- ---------- -tgc------ ---------- ---------- --a------- ---------- ---------- ---------- 2dl4_af002980 -g----c-t- ---------- ---------- -tgc------ ---------- ---------- --a------- ---------- ---------- ---------- 2dl4_u71199 -g----c-t- ---------- ---------- -tgc------ ---------- ---------- --a------- ---------- ---------- ---------- 2dl4_x97229 -g----c-t- ---------- ---------- -tgc------ ---------- ---------- --a------- ---------- ---------- ---------- 2dl4_ac011501 -g----c-t- ---------- ---------- -tgc------ ---------- ---------- --a------- ---------- ---------- ---------- 2dl4_al133414 -g----c-t- ---------- ---------- -tgc------ ---------- ---------- --a------- ---------- ---------- --g------- 2dl4_af002979 -g----c-t- ---------- ---------- -tgc------ ---------- ---------- --a------- ---------- ---------- ---------- 2dl4_af276292 -g----c-t- ---------- ---------- -tgc------ ---------- ---------- --a------- ---------- ---------- ---------- 2dl4_ay052496 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl4_ay052498 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl4_af002256 -g----c-t- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl4_af034772 -g----c-t- ---------- ---------- -tgc------ ---------- ---------- --a------- ---------- ---------- ---------- 2dl4_af034771 -g----c-t- ---------- ---------- -tgc------ ---------- ---------- --a------- ---------- ---------- ---------- 2dl4_x99480 -g----c-t- ---------- ---------- -tgc------ ---------- ---------- --a------- ---------- ---------- ---------- kir2dl_x99481 -g----c-t- -......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kirg9p_af110032-5 -g----c-t- ---------- ---------- -tgc------ ---------- ---------- --a------- ---------- ---------- --g------- kir2dl_y13054 -g----c-t- ---------- ---------- -tgc------ ---------- ---------- --a------- ---------- ---------- --g------- 2dl5_af217486 -a-------- -----a---- ---------- g--------- ---------- ---------- ---------- --t------- ---t-----g --c-----t- 2dl5_af204903 -a-------- ---------- ---------- g--------- ---------- ---------- ---------- --t------- ---t-----g --c-----t- 2dl5_af260138-41 -a-------- ---------- ---------- g--------- ---------a ---------- ---------- --t------- ---t-----g --c-----t- 2dl5_af217487 ---------- ---------- ---------- g--------- ---------- ---------- ---------- --t------- ---t-----g --c-----t- 2dlx_af271608 -a-------- -----a---- ---------- g--------- ---------- ---------- ---------- --t------- ---t-----g --c-----t- 2dlx_af272157 -a-------- -----a---- ---------- g--------- ---------- ---------- ---------- --t------- ---t-----g --c-----t- 2dlx_af271607 -a-------- -----a---- ---------- g--------- ---------- ---------- ---------- --t------- ---t-----g --c-----t- 3dl1_bc028206 t-----cat- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---c------ ---------- ---------- --------a- 3dl1_ay059417 .......... ---------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_u30274 t-----cat- ---------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_u31416 t-----c-t- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_af022049 t-----c-t- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_u33328 t-----c-t- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_af103010 t-----c-t- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_af104848-56 t-----c-t- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_af103011 t-----c-t- ---------- ---------c ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_af103013 t-----c-t- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_af103012 t-----c-t- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_af082956-9 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af208688 .......... .--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_af208689 .......... .--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_af262968 .......... .......... ..--a----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_af262969 t-----cat- ---------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----a--a- 3dl1_af262970 .......... .......... ..--a----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----a--a- 3dl1_af262971 .......... .......... ..--a----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_af262972 .......... .--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_af262973 t-----c-t- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl1_af262974 t-----c-t- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -----a--a- 3dl_af105231-9 t-----c-t- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3dl_x97230 t-----cat- ---------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3ds1_aj417558 t-----cat- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------a- 3ds1_l76661 t-----cat- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---c------ ---------- ---------- --------a- 3ds1_af022044 t-----cat- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---c------ ---------- ---------- --------a- 3ds1_al133414 t-----cat- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---c------ ---------- ---------- --------a- 3ds1_u73396 t-----cat- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---c------ ---------- ---------- --------a- 3ds1_x97233 t-----cat- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---c------ ---------- ---------- --------a- 3dl2_x93595 -----tcat- ---------- ----a----- ---------- c--------a -------cg- ---------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_ay059418 .......... ---------- ----a----- ---------- c--------a ---------- ---------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_ay059419 .......... ---------- ----a----- ---------- c--------a ---------- ---------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_ay059420 .......... ---------- ----a----- ---------- c--------a ---------- --a------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_l41270 -----tcat- ---------- ----a----- ---------- c--------a ---------- ---------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_al133414 -----tcat- ---------- ----a----- ---------- c--------a ---------- ---------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_l76665 -----tcat- ---------- ----a----- ---------- c--------a ---------- ---------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_l76666 -----tcat- ---------- ----a----- ---------- c--------a ---------- ---------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_u30272 -----tcat- ---------- ----a----- ---------- c--------a ---------- ---------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_x93596 -----tcat- ---------- ----a----- ---------- c--------a -------cg- ---------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_af262966 .......... .......... ..--a----- ---------- c--------a ---------- ---------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_af262965 .......... .......... ..--a----- ---------- c--------a ---------- ---------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_af263617 -----tcat- ---------- ----a----- ---------- c--------a ---------- ---------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_af082963-7 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208683 .......... .--------- ----a----- ---------- c--------a ---------- --a------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_af208684 .......... .--------- ----a----- ---------- c--------a ---------- --a------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_af208685 .......... .--------- ----a----- ---------- c--------a ---------- --a------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_af208686 .......... .--------- ----a----- ---------- c--------a ---------- --a------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_af208687 .......... .--------- ----a----- ---------- c--------a ---------- --a------- ------g--- ---a------ ---------- 3dl2_aj276125 -----tcat- ---------- ----a----- ---------- c--------a ---------- --a------- ------g--- ---a------ ---------- kirc1_ac006293 --------t- ---------- ---------- ---c------ ------g--a --------t- -ga----ca- --t------- ---a-----g --c-----t- kirc1_af072407-10 --------t- ---------- ---------- ---c------ ------g--a --------t- -ga----ca- --t------- ---a-----g --c-----t- kirc1_af352324 --------t- ---------- ---------- ---c------ ------g--a --------t- -ga----ca- --t------- ---a-----g --c--a--t- 3dl3_al133414 --------t- ---------- ---------- ---c------ ------g--a --------t- -ga----ca- --t------- ---a-----g --c-----t- 3dl3_ay083462 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir44b_af204912-14 --------t- ---------- ---------- ---c------ ------g--a --------t- -ga----ca- --t------- ---a-----g --c-----t- kirx_af082931-5 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kirz_ac006293 ---------. ---------- ---------- g--------- ---------t ---------- --c--***-- --t----t-- ---------- t-c-ta--t- kir15_af204906-8 ---------- ---------- ---------- g--------- ---------t ---------- --c--***-- --t----t-- ---------- t-c-ta--t- kiry_af082940-7 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kirx_al133414 ---------- ---------- ---------- ---c------ ---------c --------t- -ga-----a- --t---g--- ---a-----g --c-----t- kirx_ac011501 ********** *--------- ---------- ---c------ ---------c --------t- -ga-----a- --t---g--- ---a-----g --c-----t- kir48_af204918-20 -a-------- ---------- ---------- ---c------ ---------c -c------t- -ga-----a- --t---g--- ---a-----g --c-----t- kir222_af133901 ********** *--------- ---------- ---c------ ---------c --------t- -ga-----a- --t---g--- ---a-----g --c-----t- kir411_af134311-2 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... Consensus GCCACATGAG GGTGGTCAGG ACAAGCCCTT CCTGTCTGCC TGGCCCAGCG CTGTGGTGCC TCGAGGAGGA CACGTGACTC TTCGGTGTCA CTATCGTCGT 201 300 2dl1_u24078 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl1_ac011501 ---------- -c----gt-- ---a--g--- --t--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- -t-------t g-a-c---c- tt-------- ---------- 2dl1_af285431 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl1_l41267 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl1_u24076 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl1_af022045 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl1_af135560 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl1_af285432 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kirg2_af001885-8 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir221_af133901 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds1_al133414 ---------- -c----gt-- ---a--g--- --t--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- -t-------t g-a-c---c- tt-------- ---------- 2ds1_x98858 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds1_x89892 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds1_af285437 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl2_u24075 ---------- -c----gt-- ------g--- -gt--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c---c- tt-------- ---------- 2dl2_al133414 ---------- -c----gt-- ------g--- -gt--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c---c- tt-------- ---------- 2dl2_l76669 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl2_af285433 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl2_af285434 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds2_al133414 ---------- -c----gt-- ------g--- -gt--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c---c- tt-------- ---------- 2ds2_l41347 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds2_x89893 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds2_af285439 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds2_af285438 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir2d_aj002102 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir2d_aj002103 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir2d_aj002105 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl3_u97173-80 ---------- -c----gt-- ---a--g--- --t--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- -t-------t g-a-c---c- tt-------- ---------- 2dl3_af082936-9 ---------- -c----gt-- ---a--g--- -gt--gg-g- ct--c--tga gc-----aa- ---------t g-a-c---c- tt-------- ---------- 2dl3_af022048 ---------- -c----gt-- ------g--- -gt--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c---c- tt-------- ---------- 2dl3_af285435 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl3_l76662 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl3_l76663 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl3_u73395 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl3_u96190 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir412_af134312-6 ---------- -c----gt-- ---a--g--- -gt--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c---c- tt-------- ---------- kircl23_af133896-900 ---------- -c----gt-- ---a--g--- -gt--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c---c- tt-------- ---------- 2ds3_x97231 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds3_af022047 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds3_l76670 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_ac011501 ---------- -c----gt-- ------g--t --t--gg-g- ct--c--tga gc-gt--aa- ---------t g-a-a---c- tt-------- ---------a 2ds4_af215832 ---------- -c----gt-- ------g--t --t--gg-g- ct--c--tga gc-gt--aa- ---------t g-a-a---c- tt-------- ---------- 2ds4_aj417555 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_af002255 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_l76671 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_af285440 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_x94609 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_u96188 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_af082961 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417554 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds5_al133414 ---------- -c----gt-- ------g--t --t--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-a---c- tt-------- ---------- 2ds5_af272389 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds5_l76672 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl4_bc028137 ---------- tc----c--- ------ga-- --t--gg--- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c--t-- -c----ta-- ---------- 2dl4_af285436 ---------- tc----c--- ------ga-- --t--gg--- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c--t-- -c----ta-- ---------- 2dl4_af002980 ---------- tc----c--- ------ga-- --t--gg--- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c--t-- -c----ta-- ---c------ 2dl4_u71199 ---------- tc----c--- ------ga-- --t--gg--- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c--t-- -c----ta-- ---c------ 2dl4_x97229 ---------- tc----c--- ------ga-- --t--gg--- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c--t-- -c----ta-- ---------- 2dl4_ac011501 ---------- tc----c--- ------ga-- --t--gg--- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c--t-- -c----ta-- ---------- 2dl4_al133414 ---------- tc----c--- ------ga-- --t--gg--- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c--t-- -c----ta-- ---------- 2dl4_af002979 ---------- tc----c--- ------ga-- --t--gg--- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c--t-- -c----ta-- ---c------ 2dl4_af276292 ---------- tc----c--- ------ga-- --t--gg--- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c--t-- -c----ta-- ---------- 2dl4_ay052496 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl4_ay052498 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl4_af002256 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl4_af034772 ---------- tc----c--- ------ga-- --t--gg--- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c--t-- -c----ta-- ---------- 2dl4_af034771 ---------- tc----c--- ------ga-- --t--gg--- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c--t-- -c----ta-- ---------- 2dl4_x99480 ---------- tc----c--- ------ga-- --t--gg--- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c--t-- -c----ta-- ---------- kir2dl_x99481 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kirg9p_af110032-5 ---------- tc----c--- ------ga-- --t--gg--- ct--c--tga gc--t--aa- ---------t g-a-c--t-- -c----ta-- ---------- kir2dl_y13054 ---------- tc----c--- ------ga-- --t--gg--- ct--c--tga gcc-t--aa- ---------t g-a-c--t-- -c----ta-- ---------- 2dl5_af217486 -------c-- tc----gt-- ---------- --t--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- -a-------t g-a-----a- -c-------- ---------- 2dl5_af204903 -------c-- tc----gt-- ---------- --t--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- -a-------t g-a-----a- -c-------- ---------- 2dl5_af260138-41 -------c-- tc----gt-- ---------- --t--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- -a-------t g-a-----a- -c-------- ---------- 2dl5_af217487 -------c-- tc----gt-- ---------- --t--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- -a-------t g-a-----a- -c-------- ---------- 2dlx_af271608 -------c-- tc----gt-- ---------- --t--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- -a-------t g-a-----a- -c-------- ---------- 2dlx_af272157 -------c-- tc----gt-- ---------- --t--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- -a-------t g-a-----a- -c-------- ---------- 2dlx_af271607 -------c-- tc----gt-- ---------- --t--gg-g- ct--c--tga gc--t--aa- -a-------t g-a-----a- -c-------- ---------- 3dl1_bc028206 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---------- a-g--g---- --a----a-- ---------a 3dl1_ay059417 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- aca-t--cat ct----tgg- ---------- a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_u30274 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- aca-t--cat ct----tgg- ---------- a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_u31416 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---t------ a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_af022049 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---t------ a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_u33328 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---t------ a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_af103010 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---t------ a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_af104848-56 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---t------ a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_af103011 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---t------ a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_af103013 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---t------ a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_af103012 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---t------ a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_af082956-9 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af208688 a--------- ---------- a----g---- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---t------ a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_af208689 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---t------ a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_af262968 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- aca-t--cat ct----tgg- ---------- a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_af262969 a--------- ---------- a--------- -----a---- aca-t--cat ct----tgg- ---------- a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_af262970 a--------- ---------- a--------- -----a---- aca-t--cat ct----tgg- ---------- a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_af262971 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- aca-t--cat ct----tgg- ---------- a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_af262972 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---t------ a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_af262973 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---t------ a-g------- --a----a-- ---------a 3dl1_af262974 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---t------ a-g------- --a----a-- ---------a 3dl_af105231-9 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---t------ a-g------- --a----a-- ---------a 3dl_x97230 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- aca-t--cat ct----tgg- ---------- a-g------- --a----a-- ---------a 3ds1_aj417558 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---------- a-g--g---- --a----a-- ---------a 3ds1_l76661 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---------- a-g--g---- --a----a-- ---------a 3ds1_af022044 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---------- a-g--g---- --a----a-- ---------a 3ds1_al133414 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---------- a-g--g---- --a----a-- ---------a 3ds1_u73396 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---------- a-g--g---- --a----a-- ---------a 3ds1_x97233 a--------- ---------- a--------- ---a-a---- ac--t--cat ct----tgg- ---------- a-g--g---- --a----a-- ---------a 3dl2_x93595 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_ay059418 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_ay059419 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_ay059420 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_l41270 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_al133414 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_l76665 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_l76666 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_u30272 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_x93596 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_af262966 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_af262965 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_af263617 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_af082963-7 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208683 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_af208684 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_af208685 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_af208686 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_af208687 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- 3dl2_aj276125 ---------- ---------- ---------- ---a-a-g-- ac--t--cat ct-----gg- ---------- a-g------- ---------- ---------- kirc1_ac006293 ---------g -a----gt-- --c------- -----g--g- ct--c--tga gc--t--aa- ---------- 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---------t g-a-----c- tt-------- ---------- kiry_af082940-7 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kirx_al133414 ---------g -a----gt-- --c------- -----g--g- ct--c--tga gc--t--aa- ---g------ gaa-c-c-g- tt----a--- ---------- kirx_ac011501 ---------g -a----gt-- --c------- -----g--g- ct--c--tga gc--t--aa- ---g------ gaa-c-c-g- tt----a--- ---------- kir48_af204918-20 ---------g -a----gt-- --c------- -----g--g- ct--c--tga gc--t--aa- ---g------ gaa-c-c-g- tt----a--- ---------- kir222_af133901 ---------g -a----gt-- --c------- -----g--g- ct--c--tga gc--t--aa- ---g------ gaa-c-c-g- tt----a--- ---------- kir411_af134311-2 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... Consensus GGGTTTAACA ATTTCATGCT GTACAAAGAA GACGG-ATCC --GT-CC--- --TCCAC--C AGAATATTCC -G-AGAGCTT CATCATGGGC CCTGTGACCC 301 400 2dl1_u24078 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2dl1_ac011501 -------c-- ---------t -c-------- -------a-- -----a---- -g-------- ---------- ---------- -a-----c-- ---------- 2dl1_af285431 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2dl1_l41267 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2dl1_u24076 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2dl1_af022045 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2dl1_af135560 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2dl1_af285432 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- kirg2_af001885-8 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir221_af133901 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds1_al133414 -------c-- ---------t -c-------- -------a-- -----a---- -g-------- ---------- ---------- -a-----c-- ---------- 2ds1_x98858 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2ds1_x89892 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2ds1_af285437 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2dl2_u24075 -c-----*a- ------a--- ---------- --------a- ---------- -g-------- -a-------- ---------- ------g--- ---t------ 2dl2_al133414 -c-----*a- ------a--- ---------- --------a- ---------- -g-------- -a-------- ---------- ------g--- ---t------ 2dl2_l76669 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2dl2_af285433 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2dl2_af285434 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2ds2_al133414 -c-----*a- ------a--- ---------- --------a- ---------- -g-------- -a-------- ---------- ------g--- ---t------ 2ds2_l41347 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2ds2_x89893 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2ds2_af285439 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2ds2_af285438 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- kir2d_aj002102 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- kir2d_aj002103 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- kir2d_aj002105 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2dl3_u97173-80 -------c-- ---------t -c-------- -------a-- -----a---- -g-------- ---------- ---------- -a-----c-- ---------- 2dl3_af082936-9 -c-----ca- ------a--- ---------- --------a- ---------- -g-------- -a-------- ---------- ------g--- ---t------ 2dl3_af022048 -c-----ca- ------a--- ---------- --------a- ---------- -g-------- -a-------- ---------- ------g--- ---t------ 2dl3_af285435 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2dl3_l76662 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2dl3_l76663 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2dl3_u73395 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2dl3_u96190 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir412_af134312-6 -c-----ca- ------a--- ---------- --------a- ---------- -g-------- -a-------- ---------- ------g--- ---t------ kircl23_af133896-900 -c-----ca- ------a--- ---------- --------a- ---------- -g-------- -a-------- ---------- ------g--- ---t------ 2ds3_x97231 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......--t- 2ds3_af022047 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......--t- 2ds3_l76670 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......--t- 2ds4_ac011501 -gt------- ---------t -----c---- --------a- ---------- -g-------- ---------- ---------- ------g--- ---------- 2ds4_af215832 -gt------- ---------t -----c---- --------a- ---------- -g-------- ---------- ---------- ---------- ------.... 2ds4_aj417555 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2ds4_af002255 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2ds4_l76671 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2ds4_af285440 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2ds4_x94609 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2ds4_u96188 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_af082961 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417554 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 2ds5_al133414 -gt----ca- ---------t -----c---- --------a- ---------- -g----g--- ---------- ---------- ------g--- --------t- 2ds5_af272389 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......--t- 2ds5_l76672 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......--t- 2dl4_bc028137 -------c-- ---------- --------a- ---tt----- g--------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ------**** 2dl4_af285436 -------c-- ---------- --------a- ---tt----- g--------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ------**** 2dl4_af002980 -t-----c-- ---------- --------a- ---tt----- g--------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ------**** 2dl4_u71199 -t-----c-- ---------- --------a- ---tt----- g--------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ------**** 2dl4_x97229 -------c-- ---------- --------a- ---tt----- g--------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ------**** 2dl4_ac011501 -------c-- ---------- --------a- ---tt----- g--------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ------**** 2dl4_al133414 -------c-- ---------- --------a- ---tt----- g--------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ------**** 2dl4_af002979 -------c-- ---------- --------a- ---tt----- g--------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ------**** 2dl4_af276292 -------c-- -------a-- --------a- ---tt-g--- g--------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ------**** 2dl4_ay052496 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......**** 2dl4_ay052498 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......**** 2dl4_af002256 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......**** 2dl4_af034772 -------c-- ---------- --------a- ---tt----- g--------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ------**** 2dl4_af034771 -------c-- ---------- --------a- ---tt----- g--------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ------**** 2dl4_x99480 -------c-- ---------- --------a- ---tt----- g--------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ------**** kir2dl_x99481 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......**** kirg9p_af110032-5 -------c-- ---------- --------a- ---tt----- g--------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ------**** kir2dl_y13054 -------c-- ---------- --------a- ---tt----- g--------- ----a----- ---------- ---------- ---------- ------**** 2dl5_af217486 -t-----c-- ---------- ---------- ---------- g-g------- -t--a----- ---------- ---------- ------g--- ------**** 2dl5_af204903 -t-----c-- ---------- ---------- ---------- --g------- -t--a----- -a-------- ---------- ------g--- ------**** 2dl5_af260138-41 -t-----c-- ---------- ---------- ---------- --g------- -t--a----- -a-------- ---------- ------g--- ------**** 2dl5_af217487 -t-----c-- ---------- ---------- ---------- --g------- -t--a----- -a-------- ---------- ---------- ------**** 2dlx_af271608 -t-----c-- ---------- ---------- ---------- g-g------- -t--a----- ---------- ---------- ------g--- ------**** 2dlx_af272157 -t-----c-- ---------- ---------- ---------- g-g------- -t--a----- ---------- ---------- ------g--- ------**** 2dlx_af271607 -t-----c-- ---------- ---------- ---------- g-g------- -t--a----- ---------- ---------- ------g--- ------**** 3dl1_bc028206 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------a-- ---------- --------aa 3dl1_ay059417 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_u30274 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_u31416 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_af022049 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_u33328 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_af103010 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_af104848-56 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_af103011 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_af103013 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_af103012 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_af082956-9 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- 3dl1_af208688 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_af208689 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_af262968 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_af262969 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- t--------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_af262970 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- t--------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_af262971 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_af262972 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_af262973 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl1_af262974 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl_af105231-9 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl_x97230 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3ds1_aj417558 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------a-- ---------- --------aa 3ds1_l76661 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------a-- ---------- --------aa 3ds1_af022044 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------a-- ---------- --------aa 3ds1_al133414 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------a-- ---------- --------aa 3ds1_u73396 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------a-- ---------- --------aa 3ds1_x97233 ---------- -----a---- -c-------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------a-- ---------- --------aa 3dl2_x93595 ---------- ---------- ---------- ------g--- --------t- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl2_ay059418 ---------- ---------- ---------- ------g--- --------t- ---------- ---------- ---------- ---------- --------aa 3dl2_ay059419 ---------- ---------- ---------- ------g--- --------t- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl2_ay059420 ---------- ---------- ---------- ------g--- --------t- ---------- ---------- ---------- ---------- --------aa 3dl2_l41270 ---------- ---------- ---------- ------g--- --------t- ---------- ---------- ---------- ---------- --------aa 3dl2_al133414 ---------- ---------- ---------- ------g--- --------t- ---------- --a------- ---------- ---------- --------aa 3dl2_l76665 ---------- ---------- ---------- ------g--- --------t- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl2_l76666 ---------- ---------- ---------- ------g--- --------t- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl2_u30272 ---------- ---------- ---------- ------g--- --------t- ---------- ---------- ---------- ---------- --------aa 3dl2_x93596 ---------- ---------- ---------- ------g--- --------t- ---------- ---------- -------g-- ---------- --------aa 3dl2_af262966 ---------- ---------- ---------- ------g--- --------t- ---------- --a------- ---------- ---------- --------aa 3dl2_af262965 ---------- ---------- ---------- ------g--- --------t- ---------- --a------- ---------- ---------- --------aa 3dl2_af263617 ---------- ---------- ---------- ------g--- --------t- ---------- ---------- ---------- ---------- --------aa 3dl2_af082963-7 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......--aa 3dl2_af208683 ---------- ---------- ---------- ----g-g--- --------t- ---------- ---------- ---------- ---------- --------aa 3dl2_af208684 ---------- ---------- ---------- ------gg-- --------t- ---------- ---------- ---------- ---------- --------aa 3dl2_af208685 ---------- ---------- ---------- ------gg-- --------t- g--------- ---------- ---------- ---------- --------aa 3dl2_af208686 ---------- ---------- ---------- ------gg-- -----t--t- ---------- ---------- ---------- ---------- --------aa 3dl2_af208687 ---------- ---------- ---------- ------g--- --------t- ---------- ---------- ---------- ---------- --------aa 3dl2_aj276125 ---------- ---------- ---------- ------g--- --------t- ---------- ---------- ---------- ---------- --------aa kirc1_ac006293 ---------- ---------- ------t-ca ---------- ---------- ---------- ---------- ------tg-- ---------- ---------- kirc1_af072407-10 ---------- ---------- ------t-ca ---------- ---------- ---------- ---------- ------tg-- ---------- ---------- kirc1_af352324 ---------- ---------- ------t-ca ---------- ---------- ---------- ---------- ------tg-- ---------- ----g----- 3dl3_al133414 ---------- ---------- ------t-ca ---------- ---------- ---------- ---------- ------tg-- ---------- ---------- 3dl3_ay083462 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir44b_af204912-14 ---------- ---------- ------t-ca ---------- ---------- ---------- ---------- ------tg-- ---------- ---------- kirx_af082931-5 ---------- ---------- ------t-ca ---------- ---------- ---------- ---------- ---*--tg-- ---------- ---------- kirz_ac006293 -------ca- ------g--- ---------- ---------- -----a---- -g-------- ---------- ----a----- ---------- c--------- kir15_af204906-8 -------ca- ------g--- ---------- ---------- ---------- -g-------- ---------- ---------- ---------- c--------- kiry_af082940-7 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- kirx_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- -----t--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- ---------- kirx_ac011501 ---------- ---------- ---------- ---------- -----t--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- ---------- kir48_af204918-20 ---------- ---------- ---------- ---------- -----t--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- ---------- kir222_af133901 ---------- ---------- ---------- ---------- -----t--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- -------t-- kir411_af134311-2 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... Consensus CAGCACATGC AGGGACCTAC AGATGTCGGG GTTCACACCC ACACTCCCCC ACTGGGTGGT CGGCACCCAG CAACCCCCTG GTGATCATGG TCACAGGAGT 401 500 2dl1_u24078 ---------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------g ---------- ---------- ---a------ 2dl1_ac011501 ---------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------g ---------- ---------- ---a------ 2dl1_af285431 ---------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------g ---------- ---------- ---a------ 2dl1_l41267 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---a------ 2dl1_u24076 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---a------ 2dl1_af022045 ---------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---a------ 2dl1_af135560 ---------- ------t--- ---------- -----a---- ---------- ---------- ---------g ---------- ---------- ---a------ 2dl1_af285432 ---------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---a------ kirg2_af001885-8 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir221_af133901 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds1_al133414 ---------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---a------ 2ds1_x98858 ---------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---a------ 2ds1_x89892 ---------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---a------ 2ds1_af285437 ---------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---a------ 2dl2_u24075 ---------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- 2dl2_al133414 ---------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- 2dl2_l76669 ---------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- 2dl2_af285433 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- -c-------- 2dl2_af285434 ---------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- 2ds2_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- 2ds2_l41347 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- 2ds2_x89893 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- 2ds2_af285439 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- 2ds2_af285438 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- kir2d_aj002102 ---------- ---------- -----t---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- kir2d_aj002103 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- kir2d_aj002105 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- 2dl3_u97173-80 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- -c-------- 2dl3_af082936-9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- -c-------- 2dl3_af022048 ---------- ---------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- 2dl3_af285435 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- -c-------- 2dl3_l76662 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- -c-------- 2dl3_l76663 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- -c-------- 2dl3_u73395 ---------- ---------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- 2dl3_u96190 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- -c-------- kir412_af134312-6 ---------- ---------- -------a-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- -c-------- kircl23_af133896-900 ---------- ---------- -------a-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- -c-------- 2ds3_x97231 --g------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds3_af022047 --g------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds3_l76670 --g------- ---------- ---------- -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_ac011501 ---------- ------t--- ------t--- -----a---- ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- 2ds4_af215832 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417555 ---------- ------t--- ------t--- -----a---- ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- 2ds4_af002255 ---------- ------t--- ------t--- -----a---- ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- 2ds4_l76671 ---------- ------t--- ------t--- -----a---- ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- 2ds4_af285440 ---------- ------t--- ------t--- -----a---- ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- 2ds4_x94609 ---------- ------t--- ------t--- -----a---- ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- 2ds4_u96188 ---------- ------t--- ------t--- -----a---- ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- 2ds4_af082961 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417554 ---------- ------t--- ------t--- -----a---- ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- 2ds5_al133414 --g------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds5_af272389 --g------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds5_l76672 --g------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl4_bc028137 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl4_af285436 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl4_af002980 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl4_u71199 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl4_x97229 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl4_ac011501 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl4_al133414 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl4_af002979 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl4_af276292 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl4_ay052496 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl4_ay052498 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl4_af002256 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl4_af034772 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl4_af034771 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl4_x99480 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** kir2dl_x99481 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** kirg9p_af110032-5 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** kir2dl_y13054 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl5_af217486 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl5_af204903 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl5_af260138-41 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dl5_af217487 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dlx_af271608 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dlx_af272157 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 2dlx_af271607 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** 3dl1_bc028206 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_ay059417 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_u30274 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_u31416 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_af022049 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_u33328 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_af103010 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_af104848-56 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_af103011 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- --c------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_af103013 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_af103012 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ----t----- ---------- --a------- ---------- 3dl1_af082956-9 ---------- ---------- ---------- -a-gt---ct -----..... .......... .......... .......... ...------- ---------- 3dl1_af208688 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_af208689 ---------- ---------- ---g------ ---------- ----g----- gg----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_af262968 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_af262969 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_af262970 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_af262971 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_af262972 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_af262973 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl1_af262974 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl_af105231-9 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl_x97230 ---------- ---------- ----t----- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---a------ 3ds1_aj417558 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3ds1_l76661 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3ds1_af022044 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3ds1_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3ds1_u73396 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3ds1_x97233 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g-----g--- ---------- ---------- --a------- ---------- 3dl2_x93595 ---------- ---------- ---------- ---g------ c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_ay059418 ---------- ---------- ---------- ---g------ c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_ay059419 ---------- ---------- ---------- ---g------ c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_ay059420 ---------- ---------- ---------- ---g------ c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_l41270 ---------- ---------- ---------- ---g------ c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_al133414 ---------- ---------- ---------- ---g------ c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_l76665 ---------- ---------- ---------- ---g------ c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_l76666 ---------- ---------- ---------- ---g------ c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_u30272 ---------- ---------- ---------- ---g------ c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_x93596 ---------- ---------- ---------- ---g------ c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_af262966 ---------- ---------- ---------- ---g------ c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_af262965 ---------- ---------- ---------- ---g------ c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_af263617 ---------- ---------- ---------- ---g------ c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ------t--- 3dl2_af082963-7 ---------- ---------- ---------- ---g------ c--------- g-----.... .......... .......... ........-- ---------- 3dl2_af208683 ---------- ---------- ---------- ---ga----- c--------- g--------- ---------c ---------- ---------- ---------- 3dl2_af208684 ---------- ---------- ---------- ---ga----- c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_af208685 ---------- ---------- ---------- ---ga----- c--------- g--------- ---------- ---c------ ---------- ---------- 3dl2_af208686 ---------- ---------- ---------- ---ga----- c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- c--------- 3dl2_af208687 ---------- ---------- ---g------ ---ga----- c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_aj276125 ---------- ---------- ---------- ---ga----- c--------- g--------- ---------- ---------- ---------- ---------- kirc1_ac006293 ---------- ---------- ---------- ---------- --------g- g------g-- ---------- ---------- ------g--- -----g---- kirc1_af072407-10 ---------- ---------- ---------- ---------- --------g- g------g-- ---------- ---------- ------g--- -----g---- kirc1_af352324 ---------- ---------- ---------- ---------- --------g- g------g-- ---------- ---------- ------g--- -----g---- 3dl3_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- --------g- g------g-- ---------- ---------- ------g--- -----g---- 3dl3_ay083462 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir44b_af204912-14 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g------g-- ---------- ---------- ------g--- -----g---- kirx_af082931-5 ---------- ---------- ---------- ---------- ------.... .......... .......... ......---- ------g--- -----g---- kirz_ac006293 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- -c-------- kir15_af204906-8 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- kiry_af082940-7 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------.... .......... .......--- ------g--- -c-------- kirx_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kirx_ac011501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kir48_af204918-20 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kir222_af133901 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kir411_af134311-2 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... Consensus CCACAGAAAA CCTTCCCTCC TGGCCCACCC AGGTCCCCTG GTGAAATCAG AAGAGACAGT CATCCTGCAA TGTTGGTCAG ATGTCATGTT TGAGCACTTC 501 600 2dl1_u24078 ---------- ---------- --t---c--- ---------- ---------- a-a------- ---------- ---------- -------a-- -g-----c-- 2dl1_ac011501 ---------- ---------- --t---c--- ---------- ---------- a-a------- ---------- ---------- -------a-- -g-----c-- 2dl1_af285431 ---------- ---------- --t---c--- ---------- ---------- a-a------- ---------- ---------- -------a-- -g-----c-- 2dl1_l41267 ---------- ---------- --t---c--- ---------- ---------- a-a------- ---------- ---------- -------a-- -g-----c-- 2dl1_u24076 ---------- ---------- --t---c--- ---------- ---------- a-a------- ---------- ---------- -------a-- -g-----c-- 2dl1_af022045 ---------- ---------- --t---c--- ---------- ---------- a-a------- ---------- ---------- -------a-- -g-----c-- 2dl1_af135560 ---------- ---------- --t---c--- ---------- ---------- a-a------- ---------- ---------- -------a-- -g-----c-- 2dl1_af285432 ---------- ---------- --t---c--- ---------- ---------- a-a------- ---------- ---------- -------a-- -g-----c-- kirg2_af001885-8 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir221_af133901 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds1_al133414 ---------- ---------- --t---c--- ---------- ---------- a-a------- ---------- ---------- -------a-- -g-----a-- 2ds1_x98858 ---------- ---------- --t---c--- ---------- ---------- a-a---c--- ---------- ---------- -------a-- -g-----a-- 2ds1_x89892 ---------- ---------- --t---c--- ---------- ---------- a-a------- ---------- ---------- -------a-- -g-----g-- 2ds1_af285437 ---------- ---------- --t---c--- ---------- ---------- a-a------- ---------- ---------- -------a-- -g-----a-- 2dl2_u24075 ---------- ----a----a --t------- -------a-- ---------- --a------- ---------- -a-------- ---------- ---------- 2dl2_al133414 ---------- ----a----a --t------- -------a-- ---------- --a------- ---------- -a-------- ---------- ---------- 2dl2_l76669 ---------- ----a----a --t------- -------a-- ---------- --a------- ---------- -a-------- ---------- ---------- 2dl2_af285433 ---------- c---a----a --t------- -------a-- ---------- --a------- ---------- ---------- ------t--- ---------- 2dl2_af285434 ---------- ----a----a --t------- -------a-- ---------- --a------- ---------- -a-------- ---------- ---------- 2ds2_al133414 ---------- ---------a --a------- -------a-- ---------- --a------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_l41347 ---------- ---------a --a------- -------a-- ---------- --a------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_x89893 ---------- ---------a --a------- -------a-- ---------- --a------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_af285439 ---------- ---------a --a------- -------a-- ---------- --a------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_af285438 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---t-----a t-----g--- -------ca- kirc1_af072407-10 ---------- ---------- ca--g----- c-c------- --------c- ------c--- -c--gt---c ---t-----a t-----g--- -------ca- kirc1_af352324 ---------- ---------- ca--g----- c-c------- --g-----c- ------c--- -c--gt---c ---t-----a t-----g--- -------ca- 3dl3_al133414 ---------- ---------- ca--g----- c-c------- --------c- ------c--- -c--gt---c ---t-----a t-----g--- -------ca- 3dl3_ay083462 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir44b_af204912-14 ---------- ---------- ca--g----- c-c------- --g-----c- ------c--- -c--gt---c ---t-----a t-----g--- -------ca- kirx_af082931-5 ---------- ---------- ca--g----- c-c------- --g-----c- ------c--- -c--gt---c ---t-----a t-----g--- -------ca- kirz_ac006293 ---------- ----a----a --t---c--- -------a-- ---c------ --a------- -----t---- ---------- ---------- ---------g kir15_af204906-8 ---------- ---------c a-t---c--- -------a-- ---c------ --a------- 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Consensus CTTCTGCACA GAGAGGGGAT GTCTAAGGAC ACTTTGCGCC TCATTGGAGA GCTCCATGAT GGGGTCTCCA AGGCCAACTT CTCCATCGGT CCCATGATGC 601 700 2dl1_u24078 -a-----g-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---t------ 2dl1_ac011501 -a-----g-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---t------ 2dl1_af285431 -a-----g-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---t------ 2dl1_l41267 -a-----g-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---t------ 2dl1_u24076 -a-----g-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---t------ 2dl1_af022045 -a-----g-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---t------ 2dl1_af135560 -a-----g-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---t---c-- 2dl1_af285432 -a-----g-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---t------ kirg2_af001885-8 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- kir221_af133901 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds1_al133414 -a-----g-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---t------ 2ds1_x98858 -a-----g-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---t------ 2ds1_x89892 -a-----g-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---t------ 2ds1_af285437 -a-----g-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---t------ 2dl2_u24075 -a-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------c- ---------- 2dl2_al133414 -a-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------c- ---------- 2dl2_l76669 -a-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------c- ---------- 2dl2_af285433 -a-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------c- ---------- 2dl2_af285434 -a-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------c- ---------- 2ds2_al133414 -a-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------c- ---------- 2ds2_l41347 -a-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------c- ---------- 2ds2_x89893 -a-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------c- ---------- 2ds2_af285439 -a-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------c- ---------- 2ds2_af285438 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---------- ---------- ---t--c--- ---------g ---------- 3ds1_al133414 g--c------ ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- ---------- ---t--c--- ---------g ---------- 3ds1_u73396 g--c------ ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- ---------- ---t--c--- ---------g ---------- 3ds1_x97233 g--c------ ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- ---------- ---t--c--- ---------g ---------- 3dl2_x93595 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_ay059418 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_ay059419 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_ay059420 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_l41270 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_al133414 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_l76665 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_l76666 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_u30272 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_x93596 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_af262966 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_af262965 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_af263617 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_af082963-7 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_af208683 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_af208684 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_af208685 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_af208686 c--t------ ---------- -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_af208687 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- -a-------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- 3dl2_aj276125 c--t------ ---a------ -----t--t- --------c- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---------- kirc1_ac006293 c--c------ ---------- -------tt- -------c-- -----ta--- ---g------ -g-------- ---------- ---------g --gt------ kirc1_af072407-10 c--c------ ---------- -------tt- -------c-- -----ta--- ---g------ -g-------- ---------- ---------g --gt------ kirc1_af352324 c--c------ ---------- -------tt- -------c-- -----ta--- ---g------ -g-------- ---------- ---------g --gt------ 3dl3_al133414 c--c------ ---------- -------tt- -------c-- -----ta--- ---g------ -g-------- ---------- ---------g --gt------ 3dl3_ay083462 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ......---- kir44b_af204912-14 c--c------ ---------- -------tt- -------c-- -----ta--- ---g------ -g-------- ---------- ---------g --gt------ kirx_af082931-5 c--c------ ---------- -------tt- -------c-- -----ta--- ---g------ -g-------- ---------- ---------g --gt--.... kirz_ac006293 -a-----g-- ---------- ---------- ---------- ---------- *--------- ---------- ---------- --------c- ---------- kir15_af204906-8 -a-----g-- ---------- ---------- ---------- ---------- *--------- ---------- ---------- --------c- ---------- kiry_af082940-7 -a-----g-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------c- ---------- kirx_al133414 -a-------- ---------- ---------- --------c- ---t------ ---------- ---------- ---------- ---------- -t-------- kirx_ac011501 -a-------- ---------- ---------- --------c- ---t------ ---------- ---------- ---------- ---------- -t-------- kir48_af204918-20 -a-------- ---------- ---------- --------c- ---t------ ---------- ---------- ---------- ---------- -t-------- kir222_af133901 -a-------- ---------- ---------- --------c- ---t------ ---------- ---------- ---------- ---------- -t-------- kir411_af134311-2 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... Consensus ATGACCTTGC AGGGACCTAC AGATGCTACG GTTCTGTTAC TCACTCCCCC TATCAGTTGT CAGCTCCCAG TGACCCTCTG GACATCGTGA TCACAGGTCT 701 800 2dl1_u24078 ---------- ---------- ---------t ---------- ----t----- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_ac011501 ---------- ---------- ---------t ---------- ----t----- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_af285431 ---------- ---------- ---------t ---------- ----t----- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_l41267 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_u24076 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_af022045 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_af135560 ---------- ---------- ---------t ---------- ----t----- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_af285432 ---------- ---------- ---------t ---------- ----t----- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- kirg2_af001885-8 ---------- ---------- ---------t ---------- ----t----- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- kir221_af133901 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds1_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds1_x98858 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds1_x89892 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds1_af285437 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl2_u24075 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl2_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl2_l76669 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl2_af285433 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl2_af285434 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- ---tt----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_l41347 ---------- ---------- ---------- ---------- ---tt----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_x89893 ---------- ---------- ---------- ---------- ---tt----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_af285439 ---------- ---------- ---------- ---------- ---tt----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_af285438 ---------- ---------- ---------- ---------- ---tt----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- kir2d_aj002102 ---------- ---------- ---------- --***----- ---tt----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- kir2d_aj002103 ---------- ---------- ---------- ---------- ---tt----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- kir2d_aj002105 ---------- ---------- ---------- ---------- ---tt----- ------g--- ---------- ---------- -----g---- ---------- 2dl3_u97173-80 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_af082936-9 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_af022048 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_af285435 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_l76662 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_l76663 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_u73395 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_u96190 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- kir412_af134312-6 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- kircl23_af133896-900 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds3_x97231 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------t ---------- ---------- 2ds3_af022047 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------t ---------- ---------- 2ds3_l76670 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------t ---------- ---------- 2ds4_ac011501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_af215832 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417555 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_af002255 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_l76671 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_af285440 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------t-- -t-------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_x94609 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_u96188 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_af082961 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417554 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- -------*** ********** *********- 2ds5_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds5_af272389 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds5_l76672 ---------- ---------c ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl4_bc028137 ---------- -----g--ta ------g--- ---------- ----gc---- ---------- ---------- ---------- a--------t ------c--- 2dl4_af285436 ---------- -----g--ta ------g--t ---------- ----gc---- ---------- ---------- ---------- a--------t ------c--- 2dl4_af002980 ---------- -----g--ta ------g--- ---------- ----gca--- ---------- ---------- ---------- a--------t ------c--- 2dl4_u71199 ---------- -----g--ta ------g--- ---------- ----gca--- ---------- ---------- ---------- a--------t ------c--- 2dl4_x97229 ---------- -----g--ta ------g--- ---------- ----gc---- ---------- ---------- ---------- a--------t ------c--- 2dl4_ac011501 ---------- -----g--ta ------g--- ---------- ----gc---- ---------- ---------- ---------- a--------t ------c--- 2dl4_al133414 ---------- -----g--ta ------g--- ---------- ----gc---- ---------- ---------- ---------- a--------t ------c--- 2dl4_af002979 ---------- -----g--ta ------g--- ---------- ----gc---- ---------- ---------- ---------- a--------t ------c--- 2dl4_af276292 ---------- -----g--ta ------g--- ---------- ----gc---- ---------- ---------- ---------- a--------t ------c--- 2dl4_ay052496 .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....------ ---------- a--------t ------c--- 2dl4_ay052498 .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....------ ---------- a--------t ------c--- 2dl4_af002256 ---------- -----g--ta ------g--- ---------- ----gc---- ---------- ---------- ---------- a--------- ------c--- 2dl4_af034772 ---------- -----g--ta ------g--- ---------- ----gc---- ---------- ---------- ---------- a--------t ------c--- 2dl4_af034771 ---------- -----g--ta ------g--- ---------- ----gca--- ---------- ---------- ---------- a--------t ------c--- 2dl4_x99480 ---------- -----g--ta ------g--- ---------- ----gca--- ---------- ---------- ---------- a--------t ------c--- kir2dl_x99481 ---------- -----g--ta ------g--- ---------- ----gc---- ---------- ---------- ---------- a--------t ------c--- kirg9p_af110032-5 ---------- -----g--ta ------g--- ---------- ----gc---- ---------- ---------- ---------- a--------t ------c--- kir2dl_y13054 ---------- -----g--ta ------g--- ---------- ----gc---- ---------- ---------- ---------- a--a-----t ------c--- 2dl5_af217486 --t--g---- -----a---- ---------- ---------- ----gca--- ---------- ---------- ---------a -------a-t ---------- 2dl5_af204903 --t--g---- -----a---- ---------- ---------- ----gca--- ---------- ---------- ---------a -------a-t ---------- 2dl5_af260138-41 --t--g---- -----a---- ---------- ---------- ----gca--- ---------- ---------- ---------a -------a-t ---------- 2dl5_af217487 --t--g---- -----a---- ---------- ---------- ----gca--- ---------- ---------- ---------a -------a-t ---------- 2dlx_af271608 --t--g---- -----a---- ---------- ---------- ----gca--- ---------- -g-------- ---------a -------a-t ---------- 2dlx_af272157 --t--g---- -----a---- ---------- ---------- ----gca--- ---------- -g-------- ---------a -------a-t ---------- 2dlx_af271607 --t--g---- -----a---- ---------- ---------- ----gca--- ---------- ---------- ---------a -------a-t ---------- 3dl1_bc028206 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl1_ay059417 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl1_u30274 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl1_u31416 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af022049 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_u33328 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af103010 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl1_af104848-56 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl1_af103011 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl1_af103013 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl1_af103012 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af082956-9 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af208688 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af208689 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af262968 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl1_af262969 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl1_af262970 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl1_af262971 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl1_af262972 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl1_af262973 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl1_af262974 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl_af105231-9 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl_x97230 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- 3ds1_aj417558 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3ds1_l76661 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3ds1_af022044 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3ds1_al133414 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3ds1_u73396 ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3ds1_x97233 ---------- ---------- --c-g----- --------a- ---------- ------g--- ---------- --t------- ---------- ---------- 3dl2_x93595 ---------- ---------- --c-g----- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- -----cc--- 3dl2_ay059418 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_ay059419 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_ay059420 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_l41270 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_l76665 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_l76666 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_u30272 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_x93596 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_af262966 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_af262965 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_af263617 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_af082963-7 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_af208683 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_af208684 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_af208685 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_af208686 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_af208687 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- 3dl2_aj276125 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --t------t ---------- ------c--- kirc1_ac006293 -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- ------tg-t ------t--- kirc1_af072407-10 -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- ------tg-t ------t--- kirc1_af352324 -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- ------tg-t ------t--- 3dl3_al133414 -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- ------tg-t ------t--- 3dl3_ay083462 -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- ------tg-t ------t--- kir44b_af204912-14 -----g---- ---------- ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- ------tg-t ------t--- kirx_af082931-5 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kirz_ac006293 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- kir15_af204906-8 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- kiry_af082940-7 ---------- ---------- ---------- ---------- ----t----- ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- kirx_al133414 --g--g---- ---------- ---------- -c------t- ---a------ ------g--- ---------- ---------- ---------- ------c--- kirx_ac011501 --g--g---- ---------- ---------- -c------t- ---a------ ------g--- ---------- ---------- ---------- ------c--- kir48_af204918-20 --g--g---- ---------- ---------- -c------t- ---a------ ------g--- ---------- ---------- ---------- ------c--- kir222_af133901 --g--g---- ---------- ---------- -c------t- ---a------ ------g--- ---------- ---------- ---------- ------c--- kir411_af134311-2 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... Consensus ATATGAGAAA CCTTCTCTCT CAGCCCAGCC GGGCCCCACG GTTCAGGCAG GAGAGAACGT GACCTTGTCC TGCAGCTCCC GGAGCTCCTA TGACATGTAC 801 900 2dl1_u24078 ---------- ----a----- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ----t----- ---------- ---------- 2dl1_ac011501 ---------- ----a----- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ----t----- ---------- ---------- 2dl1_af285431 ---------- ----a----- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ----t----- ---------- ---------- 2dl1_l41267 ---------- ----a----- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ----t----- ---------- ---------- 2dl1_u24076 ---------- ----a----- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ----t----- ---------- ---------- 2dl1_af022045 ---------- ----a----- ---------- ---------- ------g-a- ---------- ---------- -----a---- ---------- ---------- 2dl1_af135560 ---------- ----a----- ---------g ---------- ---------g --gca----- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_af285432 ---------- ----a----- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ----t----- ---------- ---------- kirg2_af001885-8 ---------- ----a----- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ----t----- ---------- ---------- kir221_af133901 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds1_al133414 ---------- ----a----- ---------- ---------- ------g-a- ---------- ---------- -----a---- ---------- ---------- 2ds1_x98858 ---------- ----a----- ---------- ---------- ------g-a- ---------- ---------- -----a---- ---------- ---------- 2ds1_x89892 ---------- ----a----- ---------- ---------- ------g-a- ---------- ---------- -----a---- ---------- ---------- 2ds1_af285437 ---------- ----a----- ---------- ---------- ------g-a- ---------- ---------- -----a---- ---------- ---------- 2dl2_u24075 ---------- ---------- ---------- t-----t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl2_al133414 ---------- ---------- ---------- t-----t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl2_l76669 ---------- ---------- ---------- t-----t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl2_af285433 ---------- ---------- ---------- t-----t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- 2dl2_af285434 ---------- ---------- ---------- t-----t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_al133414 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_l41347 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_x89893 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_af285439 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_af285438 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kir2d_aj002102 ---------- ---------- ---------- ---g--t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kir2d_aj002103 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kir2d_aj002105 ---------- ----a----- ---------- ------t--t ------g--- --------g- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_u97173-80 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ----t----- ---------- ---------- 2dl3_af082936-9 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_af022048 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_af285435 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_l76662 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_l76663 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_u73395 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_u96190 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kir412_af134312-6 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kircl23_af133896-900 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds3_x97231 ---------- c--------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds3_af022047 ---------- c--------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds3_l76670 ---------- c--------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_ac011501 ---------- ----a----- ---------- ---------- ---------g --gca----- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_af215832 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417555 ---------- ----a----- ---------- ---------- ---------g --gca----- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_af002255 ---------- ----a----- ---------- ---------- ---------g --gca----- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_l76671 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------g --gca----- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_af285440 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------g --gca--c-- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_x94609 ---------- ----a----- ---------- ---------- ---------g --gca----- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_u96188 ---------- ----a----- ---------- ---------- ---------g --gca----- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_af082961 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417554 ---------- ----a----- ---------- ---------- ---------g --gca----- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds5_al133414 ---------- ----a----- ---------- ---------- ------g--- ---------- a--------- ---------- --------a- ---------- 2ds5_af272389 ---------- ----a----- ---------- ---------- ------g--- ---------- ---------- ---------- --------a- ---------- 2ds5_l76672 ---------- ----a----- ---------- ---------- ------g--- ---------- a--------- ---------c --------a- ---------- 2dl4_bc028137 ---------- ---------- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- 2dl4_af285436 ---------- ---------- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- 2dl4_af002980 ---------- ---------- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- 2dl4_u71199 ---------- ---------- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- 2dl4_x97229 ---------- ----a----- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- 2dl4_ac011501 ---------- ---------- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- 2dl4_al133414 ---------- ---------- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- 2dl4_af002979 ---------- ---------- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- 2dl4_af276292 ---------- ---------- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- 2dl4_ay052496 ---------- ----a----- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- 2dl4_ay052498 ---------- ---------- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- 2dl4_af002256 ---------- ---------- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---g------ c--------t ---------- 2dl4_af034772 ---------- ---------- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- 2dl4_af034771 ---------- ---------- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- 2dl4_x99480 ---------- ----a----- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- kir2dl_x99481 ---------- ----a----- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- kirg9p_af110032-5 ---------- ---------- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- kir2dl_y13054 ---------- ----a----- a--------- -t-------- ---------- --gca----t ---------- ---------- c--------t ---------- 2dl5_af217486 ---------- --------ag ---------- -c-------- ---------- --gc---g-t ---------- ----t----- ---------- ---------- 2dl5_af204903 ---------- --------ag ---------- -c-------- ---------- --gc-----t ---------- ----t----- ---------- ---------- 2dl5_af260138-41 ---------- --------ag ---------- -c-------- ---------- --gc-----t ---------- ----t----- ---------- ---------- 2dl5_af217487 ---------- --------ag ---------- -c-------- ---------- --gc-----t ---------- ----t----- ---------- ---------- 2dlx_af271608 ---------- --------ag ---------- -c-------- ---------- --gc---g-t ---------- ----t----- ---------- ---------- 2dlx_af272157 ---------- --------ag ---------- -c-------- ---------- --gc---g-t ---------- ----t----- ---------- ---------- 2dlx_af271607 ---------- --------ag ---------- -c-------- ---------- --gc---g-t ---------- ----t----- ---------- ---------- 3dl1_bc028206 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_ay059417 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_u30274 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_u31416 ---------- -----c---g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af022049 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_u33328 ---------- -----c---g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af103010 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af104848-56 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af103011 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af103013 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af103012 ---------- -----c---g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af082956-9 .......... ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af208688 ---------- -----c---g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af208689 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af262968 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af262969 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af262970 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af262971 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af262972 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af262973 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl1_af262974 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl_af105231-9 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl_x97230 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3ds1_aj417558 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3ds1_l76661 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3ds1_af022044 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3ds1_al133414 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3ds1_u73396 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3ds1_x97233 ---------- ---------g a--------- ---------- ---------g ---------- a--------- ----a--t-- c--------- ---------- 3dl2_x93595 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_ay059418 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_ay059419 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_ay059420 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_l41270 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_al133414 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_l76665 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_l76666 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_u30272 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_x93596 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_af262966 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_af262965 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_af263617 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_af082963-7 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ------*--- ---------- 3dl2_af208683 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_af208684 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_af208685 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_af208686 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_af208687 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------t a--------- ----a----- ---------- ---------- 3dl2_aj276125 -----g---- ----a----- ---------- ---------- g--------- ---------- a--------- ----a----- ---------- ---------- kirc1_ac006293 ---------- ------ca-- ----gg---- -t-------a ----g----t g-g------t ---------- -----a---- c--------- ----tg---- kirc1_af072407-10 ---------- ------ca-- ----gg---- -t-------a ----g----t g-g------t ---------- -----a---- c--------- ----tg---- kirc1_af352324 ---------- ------ca-- ----gg---- -t-------a ----g----t g-g------t ---------- -----a---- c--------- ----tg---- 3dl3_al133414 ---------- ------ca-- ----gg---- -t-------a ----g----t g-g------t ---------- -----a---- c--------- ----tg---- 3dl3_ay083462 ---------- ------ca-- ----gg---- -t-------a ----g----t g-g------t ---------- -----a---- c--------- ----tg---- kir44b_af204912-14 ---------- ------c--- ----gg---- -t-------a ---------t g-g------t ---------- -----a---- c--------- ----tg---- kirx_af082931-5 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kirz_ac006293 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ----t----- ---------- ---------- kir15_af204906-8 ---------- c--------- ---------- ------t--t ------g-a- ---------- ---------- ----t----- ---------- ---------- kiry_af082940-7 ---------- ---------- ---------- ------t--t ------g--- ---------- ---------- ----t----c ----a----- ---------- kirx_al133414 --------a- ----c----- ---t------ -t----t--- ---------- ---------t -----c---- -----a---- ---------- ---------- kirx_ac011501 --------a- ---------- ---t------ -t----t--- ---------- ---------t -----c---- -----a---- ---------- ---------- kir48_af204918-20 --------a- ---------- ---t------ -t----t--- ---------- ---------t -----c---- -----a---- ---------- ---------- kir222_af133901 --------a- ---------- ---t------ -t----t--- ------a--- ---------t -----c---- -----a---- ---------- ---------- kir411_af134311-2 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... Consensus CATCTATCCA GGGAGGGGGA GGCCCATGAA CGTAGGCTCC CTGCAGTGCC CAAGGTCAAC GGAACATTCC AGGCCGACTT TCCTCTGGGC CCTGCCACCC 901 1000 2dl1_u24078 ---------- ---------- ---------- ---a------ ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_ac011501 ---------- ---------- ---------- ---a------ ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_af285431 ---------- ---------- ---------- ---a------ ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_l41267 ---------- ---------- ---------- ---a------ ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_u24076 ---------- ---------- ---------- ---a------ ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_af022045 -t-------- ---------- ---------- ---------- ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- ---------- 2dl1_af135560 ---------- ---------- ---------- ---a------ ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- .......... 2dl1_af285432 ---------- ---------- ---------- ---a------ ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- ---------- kirg2_af001885-8 ---------- ---------- ---------- ---a------ ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- ---------- kir221_af133901 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ---------- 2ds1_al133414 -t-------- ---------- ---------- ---------- ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- ---------- 2ds1_x98858 -t-------- ---------- ---------- ---------- ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- ---------- 2ds1_x89892 -t-------- ---------- ---------- ---------- ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- ---------- 2ds1_af285437 -t-------- ---------- ---------- ---------- ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- ---------- 2dl2_u24075 -------a-- ---------- ---------- ---------- ---a------ ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- 2dl2_al133414 -------a-- ---------- ---------- ---------- ---a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl2_l76669 -------a-- ---------- ---------- ---------- ---a------ ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- 2dl2_af285433 -------a-- g--------- ---------- ---------- ---a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl2_af285434 -------a-- ---------- ---------- ---------- ---a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_al133414 -------a-- ---------- ---------- ---------- ------t--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_l41347 -------a-- ---------- ---------- ---------- ------t--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_x89893 -------a-- ---------- ---------- ---------- ------t--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_af285439 -------a-- ---------- ---------- ---------- ------t--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds2_af285438 -------a-- ---------- ---------- ---------- ------t--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kir2d_aj002102 -------a-- ---------- ---------- ---------- ------t--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kir2d_aj002103 -------a-- ---------- ---------- ---------- ------t--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kir2d_aj002105 -------a-- ---------- ---------- ---------- ------t--- ---------- ---------- ---------- ---------- .......... 2dl3_u97173-80 -------a-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_af082936-9 -------a-- ---------- ---------- ---------- ---a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_af022048 ---------- ---------- ---------- ---------- ---a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_af285435 -------a-- ---------- ---------- ---------- ---a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_l76662 -------a-- ---------- ---------- ---------- ---a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_l76663 -------a-- ---------- ---------- ---------- ---a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_u73395 -------a-- ---------- ---------- ---------- ---a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_u96190 -------a-- ---------- ---------- ---------- ---a------ ---------- ---------- ---------- ---------- .......... kir412_af134312-6 -------a-- ---------- ---------- ---------- ---a------ ---------- ---------- ---------- ---------- .......... kircl23_af133896-900 -------a-- ---------- ---------- ---------- ---a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds3_x97231 -a-----a-- ---------- ---------- ---a------ ---------- --------g- -a-------- ---------- ---------- ---------- 2ds3_af022047 -a-----a-- ---------- ---------- ---a------ ---------- --------g- -a-------- ---------- ---------- ---------- 2ds3_l76670 -a-----a-- ---------- ---------- ---a------ ---------- --------g- -a-------- ---------- ---------- ---------- 2ds4_ac011501 ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- -------t-- ---------- --c------- ---------- 2ds4_af215832 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417555 ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- -------t-- ---------- --c------- ---------- 2ds4_af002255 ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- -------t-- ---------- --c------- ---------- 2ds4_l76671 ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- -------t-- ---------- --c------- ---------- 2ds4_af285440 ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- -------t-- ---------- --c------- ---------- 2ds4_x94609 ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- -------t-- ---------- --c------- ---------- 2ds4_u96188 ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- .......... 2ds4_af082961 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417554 ---------- ---------- ---------- --------g- ---------- ---------- -------t-- ---------- --c------- ---------- 2ds5_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- -----t---- 2ds5_af272389 ---------- ---------- ---------- ---------- ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- -----t---- 2ds5_l76672 --------g- ---------- ---------- ---------- ---a------ --------g- -a-------- ---------- ---------- -----t---- 2dl4_bc028137 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--c ---------- -----c---- ---------- ---------- 2dl4_af285436 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--c ---------- -----c---- ---------- ---------- 2dl4_af002980 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--g ---------- -----c---- ---------- ---------- 2dl4_u71199 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--g ---------- -----c---- ---------- ---------- 2dl4_x97229 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--c ---------- -----c---- ---------- ---------- 2dl4_ac011501 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--c ---------- -----c---- ---------- ---------- 2dl4_al133414 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--c ---------- -----c---- ---------- ---------- 2dl4_af002979 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--c ---------- -----c---- ---------- ---------- 2dl4_af276292 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--c ---------- -----c---- ---------- ---------- 2dl4_ay052496 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--c ---------- -----c---- ---------- ---------- 2dl4_ay052498 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--c ---------- -----c---- ---------- ---------- 2dl4_af002256 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--c ---------- -----c---- ---------- ---------- 2dl4_af034772 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--c ---------- -----c---- ---------- ---------- 2dl4_af034771 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--g ---------- -----c---- ---------- ---------- 2dl4_x99480 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------a ------g--g ---------- -----c---- ---------- ---------- kir2dl_x99481 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--c ---------- -----c---- ---------- .......... kirg9p_af110032-5 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--c ---------- -----c---- ---------- ---------- kir2dl_y13054 ------a--- ---------- ---------- ---a--ga-- ---------- ------g--c -----a---- -----c---- ---------- ---------- 2dl5_af217486 ---------- -----c---- ---a-----c ---a------ a-----t--- ------g--c ---------- ---------- ---------- -----t---- 2dl5_af204903 ---------- -----c---- ---------c ---a------ a-----t--- ------g--c ---------- ---------- ---------- -----t---- 2dl5_af260138-41 ---------- -----c---- ---------c ---a------ .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl5_af217487 ---------- -----c---- ---------c ---a------ a-----t--- ------g--c ---------- ---------- ---------- -----t---- 2dlx_af271608 ---------- -----c---- ---a-----c ---a------ a-----t--- ------g--c ---------- ---------- ---------- -----t---- 2dlx_af272157 ---------- -----c---- ---a-----c ---a------ a-----t--- ------g--c ---------- ---------- ---------- -----t---- 2dlx_af271607 ---------- -----c---- ---a-----c ---a------ a-----t--- ------g--c ---------- ---------- ---------- -----t---- 3dl1_bc028206 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_ay059417 ---------- ---------- --t------- -----c---- ---------- -t----g--c -a-------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_u30274 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_u31416 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af022049 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_u33328 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- .......... 3dl1_af103010 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af104848-56 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af103011 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af103013 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af103012 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c -------t-- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af082956-9 ---------- -------... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af208688 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- .......... 3dl1_af208689 ---------- -a-------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---a------ ---------- .......... 3dl1_af262968 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af262969 ---------- ---------- --t------- -----c---- ---------- -t----g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af262970 ---------- ---------- --t------- -----c---- ---------- -t----g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af262971 ---------- ---------- --t------- -----c---- ---------- -t----g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af262972 ---------- ---------- ---------- --t--c---- ---------- -t----g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af262973 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af262974 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl_af105231-9 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl_x97230 -------a-- ---------- ---------- ---------- ---a------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3ds1_aj417558 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3ds1_l76661 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3ds1_af022044 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3ds1_al133414 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3ds1_u73396 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3ds1_x97233 ---------- ---------- ---------- -----c---- ---------- ------g--c ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_x93595 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_ay059418 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_ay059419 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_ay059420 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_l41270 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_al133414 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- .......... 3dl2_l76665 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_l76666 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_u30272 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_x93596 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- .......... 3dl2_af262966 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_af262965 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_af263617 ---------- ---------- ---------- ---a--c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- ---------- 3dl2_af082963-7 ------.... .......... .......... ..----c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- .......... 3dl2_af208683 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- .......... 3dl2_af208684 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- .......... 3dl2_af208685 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a--c----- ---------- ---------- .......... 3dl2_af208686 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- .......... 3dl2_af208687 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- .......... 3dl2_aj276125 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g----g--t- ---------- -a-------- ---------- ---------- ---------- kirc1_ac006293 ---------a ---------- ---------- ------c-ct g---c---c- ------g--c ---------- -----cc--- ---------* ********** kirc1_af072407-10 ---------a ---------- ---------- ------c-ct g---c---c- ------g--c ---------- -----cc--- ---------* ********** kirc1_af352324 ---------a ---------- ---------- ------c-ct g---c---c- ------g--c ---------- -----cc--- ---------- ********** 3dl3_al133414 ---------a ---------- ---------- ------c-ct g---c---c- ------g--c ---------- -----cc--- ---------- ********** 3dl3_ay083462 ---------- ---------- ---------- ------c-ct g---c---c- ------g--c ---------- -----cc--- ---------- ********** kir44b_af204912-14 ---------a ---------- ---------- ---....... .......... .......... .......... .......... .......... ********** kirx_af082931-5 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ********** kirz_ac006293 -------a-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kir15_af204906-8 -------a-- ---------- ---------- ---....... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kiry_af082940-7 ------.... .......... .......... ......---- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kirx_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--c tt-------- ---------- ---------- ********** kirx_ac011501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--c tt-------- ---------- ---------- ********** kir48_af204918-20 ---------- ---------- ---------- ---....... .......... .......... .......... .......... .......... ********** kir222_af133901 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------g--c tt-------- ---------- ---------- ********** kir411_af134311-2 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ---------- Consensus ACGGAGGGAC CTACAGATGC TTCGGCTCTT TCCGTGACTC TCCCTACGAG TGGTCAAACT CGAGTGACCC ACTGCTTGTT TCTGTCACAG GAAACCCTTC 1001 1100 2dl1_u24078 --a------- ---------- ---------- ---------g ---------c ---------- -a-------- ---------- ---------- --------.. 2dl1_ac011501 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------c ---------- -a-------- ---------- ---------- --------.. 2dl1_af285431 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------c ---------- -a-------- ---------- ---------- --------.. 2dl1_l41267 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------c ---------- -a-------- ---------- ---------- --------.. 2dl1_u24076 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------c ---------- -a-------- ---------- ---------- --------.. 2dl1_af022045 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------c ---------- -a-------- ---------- ---------- --------.. 2dl1_af135560 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl1_af285432 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------c ---------- -a-------- ---------- ---------- --------.. kirg2_af001885-8 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------c ---------- -a-------- ---------- ---------- --------.. kir221_af133901 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------c ---------- -a-------- ---------- ---------- --------.. 2ds1_al133414 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------- -------a-- t--------- ---------- ------aa-- --ct------ 2ds1_x98858 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------- -------a-- t--------- ---------- ------aa-- --ct------ 2ds1_x89892 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------- -------a-- t--------- ---------- ------aa-- --ct------ 2ds1_af285437 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------- -------a-- t--------- ---------- ------aa-- --ct------ 2dl2_u24075 --a------- ---------- ---------- ---t-----c ---------c ---------- -a-------- ---------- ---------- --------.. 2dl2_al133414 --a------- ---------- ---------- ---t-----c ---------c ---------- -a-------- ---------- ---------- --------.. 2dl2_l76669 --a------- ---------- ---------- ---t-----c ---------c ---------- -a-------- ---------- ---------- --------.. 2dl2_af285433 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------c ---------- -a-------- ---------- ---------- --------.. 2dl2_af285434 --a------- ---------- ---------- ---t-----c ---------c ---------- -a-------- ---------- ---------- --------.. 2ds2_al133414 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------- ---------- t--------- ---------- ------aa-- --ct------ 2ds2_l41347 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------- ---------- t--------- ---------- ------aa-- --ct------ 2ds2_x89893 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------- ---------- t--------- ---------- ------aa-- --ct------ 2ds2_af285439 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------- -------a-- ---------- ---------- ------aac- --ct------ 2ds2_af285438 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------- ---------- ---------- ---------- ------aa-- --ct------ kir2d_aj002102 --a------- ---------- ---------- ---------c ------t--- --t------- --c------- ---------- ---------- --c---tg-t kir2d_aj002103 --a------- ---------- ---------- ---------c ------t--- --t------- --c------- ---------- ---------- --c---tg-t kir2d_aj002105 .......... .......... .......... .......... .-----t--- --t------- --c------- ---------- ---------- --c---tg-t 2dl3_u97173-80 --a------- -t-------- ---------- ----g----c ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- --------t- 2dl3_af082936-9 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- --------t- 2dl3_af022048 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- --------t- 2dl3_af285435 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- --------t- 2dl3_l76662 --a------- -t-------- ---------- ----g----c ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- --------t- 2dl3_l76663 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- --------t- 2dl3_u73395 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------- t--------- t--------- ---------- ---------- --------t- 2dl3_u96190 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir412_af134312-6 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kircl23_af133896-900 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- --------t- 2ds3_x97231 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------- -------a-- ---------- ---------- ------aac- --ct------ 2ds3_af022047 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------- -------a-- ---------- ---------- ------aac- --ct------ 2ds3_l76670 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------- -------a-- ---------- ---------- ------aac- --ct------ 2ds4_ac011501 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------- -------a-- t--------- ---------- ------aa-- --ct------ 2ds4_af215832 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417555 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------- -------a-- t--------- ---------- ------aa-- --ct------ 2ds4_af002255 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------- -------a-- t--------- ---------- ------aa-- --ct------ 2ds4_l76671 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------- -------a-- t--------- ---------- ------aa-- --ct------ 2ds4_af285440 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------- -------a-- t--------- ---------- ------aa-- --ct------ 2ds4_x94609 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------- -------a-- t--------- ---------- ------aa-- --ct------ 2ds4_u96188 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_af082961 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417554 --a------- ---------- ---------- ---------c ---------- -------a-- t--------- ---------- ------aa-- --ct------ 2ds5_al133414 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------- -------a-- ---------- ---------- ------aac- --ct------ 2ds5_af272389 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------- -------a-- ---------- ---------- ------aac- --ct------ 2ds5_l76672 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------- -------a-- ---------- ---------- ------aac- --ct------ 2dl4_bc028137 t--------- ---------- ---------- --t------- ----t-g--- ---------- t-c-g----- a--ta----- ---c------ ------t--- 2dl4_af285436 t--------- ---------- -a-------- --t------- ----t-g--- ---------- t-c-g----- a--ta----- ---c------ ---------- 2dl4_af002980 t--------- ---------- -a-------- --t------- ----t-g--- ---------- t-c-g----- a--ta----- ---c------ ---------- 2dl4_u71199 t--------- ---------- -a-------- --t------- ----t-g--- ---------- t-c-g----- a--ta----- ---c------ ---------- 2dl4_x97229 t--------- ---------- ---------- --t------- ----t-g--- ---------- t-c-g----- a--ta----- ---c------ ------t--- 2dl4_ac011501 t--------- ---------- ---------- --t------- ----t-g--- ---------- t-c-g----- a--ta----- ---c------ ------t--- 2dl4_al133414 t--------- ---------- ---------- --t------- ----t-g--- ---------- t-c-g----- a--ta----- ---c------ ---------- 2dl4_af002979 t--------- ---------- -a-------- --t------- ----t-g--- ---------- t-c-g----- a--ta----- ---c------ ---------- 2dl4_af276292 t--------- ---------- ---------- --t------- ----t-g--- ---------- t-c-g----- a--ta----- ---c------ ------t--- 2dl4_ay052496 t--------- ---------- ---------- --t------- ----t-g--- ---------- t-c-g----- a--ta----- ---c------ ------t--- 2dl4_ay052498 t--------- ---------- ---------- --t------- ----t-g--- ---------- t-c-g----- a--ta----- ---c------ ---------- 2dl4_af002256 t--------- ---------- ---------- --t------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl4_af034772 t--------- ---------- ---------- --t------- ----t-g--- ---------- t-c-g----- a--ta----- ---c------ ------t--- 2dl4_af034771 t--------- ---------- ---------- --t------- ----t-g--- ---------- t-c-g----- a--ta----- ---c------ ---------- 2dl4_x99480 t--------- ---------- ---------- --t------- ----t-g--- ---------- t-c-g----- a--ta----- ---c------ ------t--- kir2dl_x99481 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kirg9p_af110032-5 t--------- ---------c ---------- --t------- ----t-g--- ---------- t-c-g----- a--ta----- ---c------ ------t--- kir2dl_y13054 t--------- ---------- ---------- --t------- -......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl5_af217486 --------ca t--------- ---------- ---------- ----t--g-- ---------- -a-------- ---------- ---ct----- --------t- 2dl5_af204903 --------ca t--------- ---------- ---------- ----t--g-- ---------- -a-------- ---------- ---ct----- --------t- 2dl5_af260138-41 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl5_af217487 --------ca t--------- ---------- ---------- ----t--g-- ---------- -a-------- ---------- ---ct----- --------t- 2dlx_af271608 --------ca t--------- ---------- ---------- ----t--g-- ---------- -a-------- ---------- ---ct----- --------t- 2dlx_af272157 --------ca t--------- ---------- ---------- ----t--g-- ---------- -a-------- ---------- ---ct----- --------t- 2dlx_af271607 --------ca t--------- ---------- ---------- ----t--g-- ---------- -a-------- ---------- ---ct----- --------t- 3dl1_bc028206 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ---------- ---------- -a-------- ---------- ---------- --------t- 3dl1_ay059417 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ----t-tg-- ---------- t--------- ---------- --------t- --------t- 3dl1_u30274 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ---------- ---------- -a-------- ---------- ---------- --------t- 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3dl1_af082956-9 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af208688 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af208689 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af262968 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ---------- ---------- -a-------- ---------- ---------- --------t- 3dl1_af262969 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ---------- ---------- t-----c--- ---------- ---------- --------t- 3dl1_af262970 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ---------- ---------- t-----c--- ---------- ---------- --------t- 3dl1_af262971 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ---------- ---------- -a-------- ---------- ---------- --------t- 3dl1_af262972 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ---------- ---------- -a-------- ---------- ---------- --------t- 3dl1_af262973 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------t- 3dl1_af262974 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ---------- ---------- -a-------- ---------- ---------- --------t- 3dl_af105231-9 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --------t- 3dl_x97230 --a------- ---------- ---------- ----g----c ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- --------t- 3ds1_aj417558 ---------- ---------- -a-------- -------t-- -------t-- ---------- -a-------- ---------- ------aa-- --ct------ 3ds1_l76661 ---------- ---------- -a-------- -------t-- -------t-- ---------- -a-------- ---------- ------aa-- --ct------ 3ds1_af022044 ---------- ---------- -a-------- -------t-- -------t-- ---------- -a-------- ---------- ------aa-- --ct------ 3ds1_al133414 ---------- ---------- -a-------- -------t-- -------t-- ---------- -a-------- ---------- ------aa-- --ct------ 3ds1_u73396 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---------- -a-------- -------t-- ----t-tg-- ---------- t--------- ---------- --------t- --------t- 3dl2_l76666 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ----t-tg-- ---------- t--------- ---------- --------t- --------t- 3dl2_u30272 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ----t-tg-- ---------- t--------- ---------- --------t- --------t- 3dl2_x93596 .......... .......... .......... .......... .---t-tg-- ---------- t--------- ---------- --------t- --------t- 3dl2_af262966 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ----t-tg-- ---------- t--------- ---------- --------t- --------t- 3dl2_af262965 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ----t-tg-- ---------- t--------- ---------- --------t- --------t- 3dl2_af263617 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ----t-tg-- ---------- t--------- ---------- --------t- --------t- 3dl2_af082963-7 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208683 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208684 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208685 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208686 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208687 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_aj276125 ---------- ---------- -a-------- -------t-- ----t-tg-- ---------- t--------- ---------- --------t- --------t- kirc1_ac006293 ********** ********** ********** ********** ------t--- ---------- ---------- ---------- ---------- --c---tg-t kirc1_af072407-10 ********** ********** ********** ********** ------t--- --a------- ---------- ---------- ---------- --c---tg-t kirc1_af352324 ********** ********** 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.--------- ---------- ---------- ---------- -------*-- ----g----- ---------- t-------a- ---------c ---t--c--- 2dl1_l41267 .--------- ---------- ---------- ---------- -------*-- ----g----- ---------- t-------a- ---------c ---t--c--- 2dl1_u24076 .--------- ---------- ---------- ---------- -------*-- ----g----- ---------- t-------a- ---------c ---t--c--- 2dl1_af022045 .--------- ---------- ----t----- ---------- -------*-- ----g----- ---------- t-------a- ---------c ---t--c--- 2dl1_af135560 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl1_af285432 .--------- ---------- ---------- ---------- -------*-- ----g----- ---------- t--------- ---------c ---t--c--- kirg2_af001885-8 .--------- ---------- ---------- ---------- -t-------- ----g----- ---------- t-------a- ---------c ---t--c--- kir221_af133901 .--------- ---------- ---------- ---------- -------*-- ----g----- ---------- t-------a- ---------c ---------- 2ds1_al133414 ---------- ---------- ---------- ------g--- -------*-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- 2ds1_x98858 ---------- ---------- ---------- ------g--- -------*-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- 2ds1_x89892 ---------- ---------- ---------- ------g--- -------*-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- 2ds1_af285437 ---------- ---------- ---------- ------g--- -------*-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- 2dl2_u24075 .--------- ---------- ---------- ---------- -------*-- ----g----- ---------- t--------- ---------c ---t--c--- 2dl2_al133414 .--------- ---------- ---------- ---------- -------*-- ----g----- ---------- t--------- ---------c ---t--cc-- 2dl2_l76669 .--------- ---------- ---------- ---------- -------*-- ----g----- ---------- t--------- ---------c -------c-- 2dl2_af285433 .--------- ---------- ---------- ---------- -------*-- ---------- ---------- t-------a- ---------c ---t-tc--- 2dl2_af285434 .--------- ---------- ---------- ---------- -------*-- ----g----- ---------- t--------- ---------c ---t--c--- 2ds2_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- -------*.. .......... .......... .......... .......... .......... 2ds2_l41347 ---------- ---------- ---------- ---------- -------*-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- 2ds2_x89893 ---------- ---------- ---------- ---------- -------*-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- 2ds2_af285439 ---------- ---------- ---------- ------g--- -------*-- -at------- --------g- -----g---- ---------- ---------- 2ds2_af285438 ---------- ---------- ---------- ---------- -------*-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- kir2d_aj002102 ---------- ---------- ---------- --tg------ -------*-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- kir2d_aj002103 ---------- ---------- ---------- --tg------ -------*-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- kir2d_aj002105 ---------- 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir412_af134312-6 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kircl23_af133896-900 c--------- ---------- ---------- ----g----- -------*-- ---t------ ---------- ---------- ---------- ---------- 2ds3_x97231 ---------- ---------- ---------- ------g--- -------*-- -at------- --------g- -----g---- -------g-- ---------- 2ds3_af022047 ---------- ---------- ---------- ------g--- -------*-- -at------- --------g- -----g---- ---------- ---------- 2ds3_l76670 ---------- ---------- ---------- ------g--- -------*-- -at------- --------g- -----g---- ---------- ---------- 2ds4_ac011501 ---------- ---------- ---------- ------g--- -------*-- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- 2ds4_af215832 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417555 ---------- ---------- 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-----*g--- ---------- -a-------- -----g--ac ---------- ---------- 2dl4_al133414 -----t-c-- ---------- ---------- --------a- -------*-- ---------- -a-------- -----g--ac ---------- ---------- 2dl4_af002979 -----t-c-- ---------- ---------- --------a- -------*-- ---------- -a-------- -----g--ac ---------- ---------- 2dl4_af276292 -----t-c-- ---------- ---------- --------a- ------**-- ---------- -a-------- -----g--ac ---------- ---------- 2dl4_ay052496 -----t-c-- ---------- ---------- ------.-a- -------*-- ---------- -a-------- -----g--ac ---------- -------... 2dl4_ay052498 -----t-c-- ---------- ---------- --------a- -------*-- ---------- -a-------- -----g--ac ---------- -------... 2dl4_af002256 .......... .......... .......... .......... .......--- ---------- -a-------- -----g--ac ---------- ---------- 2dl4_af034772 -----t-c-- ---------- ---------- --------a- -------*-- ---------- -a-------- -----g--ac ---------- ---------- 2dl4_af034771 -----t-c-- ---------- ---------- --------a- -------*-- ---------- -a-------- -----g--ac ---------- ---------- 2dl4_x99480 -----t-c-- ---------- ---------- --------a- -------*-- ---------- -a-------- -----g--ac ---------- ---------- kir2dl_x99481 .......... .......... .......... .......... .......--- ---------- -a-------- -----g--ac ---------- ---------- kirg9p_af110032-5 -----t-c-- ---------- ---------- --------a- -------*-- ---------- -a-------- -----g--ac ---------- ---------- kir2dl_y13054 .......... .......... .......... .......... .......--- ---------- -a-------- -----g--ac ---------- ---------- 2dl5_af217486 ------t--- ---------- ----t----c ---------- ----*g---- ---------- ---------- -----c---g ---------- ---------- 2dl5_af204903 ------t--- ---------- ----t----c ---------- ----*g---- ---------- ---------- -----c---g ---------- ---------- 2dl5_af260138-41 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl5_af217487 ------t--- ---------- ----t----c ---------- 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.......... .......... .......... .......... 2ds1_x89892 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t-----. .......... .......... .......... .......... 2ds1_af285437 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* --------g- ---------- 2dl2_u24075 ---------- ---------- ---------- ------a--- -----a---- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 2dl2_al133414 ---------- ---------- ---------- ------a--- -----a---- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 2dl2_l76669 ---------- ---------- ---------- ------a--- -----a---- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 2dl2_af285433 ---------- ---------- ---------- ------a--- -----a---- ---------- ---------- ---------* a--------- ---------- 2dl2_af285434 ---------- ---------- ---------- ------a--- -----a---- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 2ds2_al133414 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* ---------- ---------- 2ds2_l41347 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------g ---------* --------g- ---------- 2ds2_x89893 --t------- ---------a ---------- t--------t -a........ .......... .......... .......... .......... .......... 2ds2_af285439 --t------- ----g----a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* c--------- ---------- 2ds2_af285438 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* --------g- ---------- kir2d_aj002102 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------g ---------* --------g- ---------- kir2d_aj002103 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------g ---------* --------g- ---------- kir2d_aj002105 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------g ---------* --------g- ---------- 2dl3_u97173-80 ---------- ---------- ---....... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl3_af082936-9 ---------- ---------- ---------- -----t---- -----a---- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 2dl3_af022048 ---------- ---------- ---------- -----t---- -----a---- ---------- ---------- ---------* a--------- ---------- 2dl3_af285435 ---------- ---------- ---------- -----t---- -----a---- ---------- ---------- ---------* a--------- ---------- 2dl3_l76662 ---------- ---------- ---------- -----t---- -----a---- ---------- ---------- ---------* a--------- ---------- 2dl3_l76663 ---------- ---------- ---------- ------a--- -----a---- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 2dl3_u73395 ---------- ---------- ---------- -----t---- -----a---- ---------- ---------- ---------* a--------- ---------- 2dl3_u96190 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir412_af134312-6 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kircl23_af133896-900 ---------- ---------- ---------- -----t---- -----a---- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 2ds3_x97231 --t------- ----g----a ---------- t--------t -a-------- ---t-----. .......... .......... .......... .......... 2ds3_af022047 --t------- ----g----a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* c--------- ---------- 2ds3_l76670 --t-----c- ----g----a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* c--------- ---------- 2ds4_ac011501 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* --------g- ---------- 2ds4_af215832 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417555 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* --------g- ---------- 2ds4_af002255 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* --------g- ---------- 2ds4_l76671 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* --------g- ---------- 2ds4_af285440 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* c--------- ---------- 2ds4_x94609 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t-----. .......... .......... .......... .......... 2ds4_u96188 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_af082961 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* --------g- ---------- 2ds4_aj417554 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* --------g- ---------- 2ds5_al133414 --t------- ----g----a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* c--------- ---------- 2ds5_af272389 --t------- ----g----a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* c--------- ---------- 2ds5_l76672 --t------- ----g----a ---------- t--------t -a-------- ---t------ ---------- ---------* c--------- ---------- 2dl4_bc028137 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- 2dl4_af285436 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- 2dl4_af002980 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- 2dl4_u71199 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- 2dl4_x97229 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- 2dl4_ac011501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- 2dl4_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- 2dl4_af002979 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- 2dl4_af276292 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- 2dl4_ay052496 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl4_ay052498 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl4_af002256 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- 2dl4_af034772 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- 2dl4_af034771 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- 2dl4_x99480 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- kir2dl_x99481 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- kirg9p_af110032-5 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- kir2dl_y13054 --t------- ---------- ---------- ---------- ---------- ----a----- ---------- --------g* ---------- ----ag---- 2dl5_af217486 ---------- -t-------- ---------- -----t---- ---------- ---------- -------c-- --------t* c--------- ---------- 2dl5_af204903 ---------- -t-------- ---------- -----t---- ---------- ---------- -------c-- --------t* c--------- ---------- 2dl5_af260138-41 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl5_af217487 ---------- -t-------- ---------- -----t---- ---------- ---------- -------c-- --------t* c--------- ---------- 2dlx_af271608 ---------- -t-------- ---------- -----t---- ---------- ---------- -------c-- --------t* c--------- ---------- 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---------- ---------- -g-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl1_af104848-56 ---------- ---------- -g-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl1_af103011 ---------- ---------- -g-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl1_af103013 ---------- ---------- -g-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl1_af103012 ---------- ---------- ---------- -----t---- ---------c ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl1_af082956-9 ---------- ---------- -g-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl1_af208688 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af208689 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af262968 ---------- ---------- -g-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl1_af262969 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl1_af262970 --t------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl1_af262971 ---------- ---------- -g-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl1_af262972 ---------- ---------- -g-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl1_af262973 ---------- ---------- ---------- -----t---- ---------- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl1_af262974 ---------- ---------- -g-------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl_af105231-9 ---------- ---------- ---------- -----t---- ---------- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl_x97230 ---------- ---------- ---------- -----t---- -----a---- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3ds1_aj417558 --t------- ---------a ---------- ---------t -a-----a-- ---t------ ---------- ---------* ---------- ---------- 3ds1_l76661 --t------- ---------a ---------- ---------t -a-----a-- ---t------ ---------- ---------* ---------- ---------- 3ds1_af022044 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-----a-- ---t------ ---------- ---------* ---------- ---------- 3ds1_al133414 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-----a-- ---t------ ---------- ---------* ---------- ---------- 3ds1_u73396 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-----a-- ---t------ ---------- ---------* ----c----- ---------- 3ds1_x97233 --t------- ---------a ---------- t--------t -a-----a-- ---t------ ---------- ---------g ---------- ---------- 3dl2_x93595 ---------- ---------- ---------- --g------- ---------- ---------- -t-------- ------g--* ---------- ---------- 3dl2_ay059418 ---------- ---------- ---------- -tg------- ---------- ---------- -t-------- ------g--* ---------- ---------- 3dl2_ay059419 ---------- ---------- ---------- -tg------- ---------- ---------- -t-------- ------g--* ---------- ---------- 3dl2_ay059420 ---------- ---------- ---------- --g------- ---------- ---------- -t-------- ------g--* ---------- ---------- 3dl2_l41270 ---------- ---------- ---------- --g------- ---------- ---------- -t-------- ------g--* ---------- ---------- 3dl2_al133414 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_l76665 ---------- ---------- ---------- --g------- ---------- ---------- -t-------- ------g--* ---------- ---------- 3dl2_l76666 ---------- ---------- ---------- --g------- ---------- ---------- -t-------- ------g--* ---------- ---------- 3dl2_u30272 ---------- ---------- ---------- --g------- ---------- ---------- -t-------- ------g--* ---------- ---------- 3dl2_x93596 ---------- ---------- ---------- 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208687 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_aj276125 ---------- ---------- ---------- --g------- ---------- ---------- -t-------- ------g--* ---------- ---------- kirc1_ac006293 ---------- ---------- ---------- ---------- -----a---- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- kirc1_af072407-10 ---------- ---------- ---------- ---------- -----a---- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- kirc1_af352324 ---------- ---------- ---------- ---------- -----a---- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl3_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- -----a---- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- 3dl3_ay083462 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir44b_af204912-14 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kirx_af082931-5 ---------- ---------- ---------- ---------- -----a---- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- kirz_ac006293 ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- kir15_af204906-8 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kiry_af082940-7 ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- ---------- ---------* ---------- ---------- kirx_al133414 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** kirx_ac011501 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** kir48_af204918-20 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** kir222_af133901 ********** 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.......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds2_af285439 ---------- ------g--- -a---*---t a--------- ---------t ---------- --c-----t- --t---c--- ---------- ---------- 2ds2_af285438 ---------- ---------- -a---*---t a--------- ---------- ---------- --------t- --t---c--- ---------- ---------- kir2d_aj002102 ---------- ---------- -a---*---t a--------- ---------- ---------- --------t- --t---c--- ---------- ---------- kir2d_aj002103 ---------- ---------- -a---*---t a--------- ---------- ---------- --------t- --t---c--- ---------- ---------- kir2d_aj002105 ---------- ---------- -a---*---t a--------- ---------- ---------- --------t- --t---c--- ---------- ---------- 2dl3_u97173-80 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2dl3_af082936-9 ---------- ------t--t -----*---- ---------- ---------- --t------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_af022048 ---------- ------t--t -----*---- ---------- ---------- --t------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_af285435 ---------- ------t--t -----*---- ---------- ---------- --t------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_l76662 ---------- ------t--t -----*---- ---------- ---------- --t------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_l76663 ---------- ------t--t -----*---- ---------- ---------- --t------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_u73395 ---------- ------t--t -----*---- ---------- ---------- --t------- ---------- ---------- ---------- ---------- 2dl3_u96190 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir412_af134312-6 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kircl23_af133896-900 ---------- ------t--t -----*---- ---------- ---------- --t------- ------tc-t gc--at---- ---------- ---------- 2ds3_x97231 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds3_af022047 ---------- ------g--- -a---*---t a--------- ---------t ---------- --c-----t- --t---c--- ---------- ---------- 2ds3_l76670 ---------- ------g--- -a---*---t a--------- ---------t ---------- --c-----t- --t---c--- ---------- ---------- 2ds4_ac011501 ---------- ---------- -a---*---t a--------- ---------- ---------- --------t- --t---c--- ---------- ---------- 2ds4_af215832 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 2ds4_aj417555 ---------- ---------- -a---*---t a--------- ---------- ---------- --------t- --t---c--- ---------- ---------- 2ds4_af002255 ---------- ---------- -a---*---t a--------- ---------- ---------- --------t- --t---c--- ---------- ---------- 2ds4_l76671 ---------- ---------- -a---*---t a--------- ---------- ---------- --------t- --t---c--- ---------- ---------- 2ds4_af285440 ---------- ---------- -a---*---t 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---------- -----g-*** *--------- ---------- ---------- ---------t 2dl4_af285436 -g----t--- ---------- -----*gt-t a--------- ---------- -----g-*** *--------- ---------- ---------- ---------t 2dl4_af002980 -g----t--- ---------- -----*gt-t a--------- ---------- -----g-*** *---a----- ---g------ ---------- ---------t 2dl4_u71199 -g----t--- ---------- -----*gt-t a--------- ---------- -----g-*** *---a----- ---g------ ---------- ---------t 2dl4_x97229 -g----t--- ---------- -----*gt-t a--------- ---------- -----g-*** *--------- ---------- ---------- ---------t 2dl4_ac011501 -g----t--- ---------- -----*gt-t a--------- ---------- -----g-*** *--------- ---------- ---------- ---------t 2dl4_al133414 -g----t--- ---------- -----*gt-t a--------- ---------- -----g-*** *--------- ---------- ---------- ---------t 2dl4_af002979 -g----t--- ---------- -----*gt-t a--------- ---------- -----g-*** *--------- ---g------ ---------- ---------t 2dl4_af276292 -g----t--- ---------- -----*gt-t a--------- ---------- 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---------- ---------. .......... .......... 3dl1_af103011 --------t- ---------t -t---*---- ---------- ------a--- ---------- ---------- ---------. .......... .......... 3dl1_af103013 --------t- ---------t -t---*---- ---------- ------a--- ---------- ---------- ---------. .......... .......... 3dl1_af103012 --------t- ---------t -t---*---- ---------- ------a--- ---------- ---------- ---------. .......... .......... 3dl1_af082956-9 --------t- ---------t -t---*---- ---------- ------a--- ---------- ---------- ---------- ------.... .......... 3dl1_af208688 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af208689 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl1_af262968 --------t- ---------t -t---*---- ---------- ------a--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af262969 --------t- ---------t -t---*---- ---------- ------a--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af262970 --------t- ---------t -t---*---- ---------- ------a--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af262971 --------t- ---------t -t---*---- ---------- ------a--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af262972 --------t- ---------t -t---*---- ---------- ------a--- ---------- ---------- ---------- t--------- ---------- 3dl1_af262973 --------t- ---------t -t---*---- ---------- ------a--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl1_af262974 --------t- ---------t -t---*---- ---------- ------a--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl_af105231-9 --------t- ---------t -t---*---- ---------- ------a--- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3dl_x97230 ---------- ------t--t -----*---- ---------- ---------- --t------- ---------- ---------- ---------- ---------- 3ds1_aj417558 ---------- ---------- -a---*---t a--------- ---------- ---------- --------t- --t---c--- ---------- ---------- 3ds1_l76661 ---------- ---------- -a---*---t a--------- ---------- ---------- --------t- --t---c--- ---------- ---------- 3ds1_af022044 ---------- ---------- -a---*---t a--------- ---------- ---------- --------t- --t---c--- ---------- ---------- 3ds1_al133414 ---------- ---------- -a---*---t a--------- ---------- ---------- --------t- --t---c--- ---------- ---------- 3ds1_u73396 ------a--- ---------- -a---*---t a--------- ------a--- -------... .......... .......... .......... .......... 3ds1_x97233 ---------- ---------- -a---*---t a--------- ---------- ---------- --------t- --t---c--- ---------- ---------- 3dl2_x93595 -------t-- ---------- -----*---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---t------ 3dl2_ay059418 -------t-- ---------- -----*---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---t------ 3dl2_ay059419 -------t-- ---------- -----*---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---t------ 3dl2_ay059420 -------t-- ---------- -----*---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---t------ 3dl2_l41270 -------t-- ---------- -----*---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---t------ 3dl2_al133414 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_l76665 -------t-- ---------- -----*---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---t------ 3dl2_l76666 -------t-- ---------- -----*---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---t------ 3dl2_u30272 -------t-- ---------- -----*---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---t------ 3dl2_x93596 -------t-- ---------- -----*---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---t------ 3dl2_af262966 -------t-- ---------- -----*---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---t------ 3dl2_af262965 -------t-- ---------- -----*---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---t------ 3dl2_af263617 -------t-- ---------- -----*---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---t------ 3dl2_af082963-7 -------t-- ---------- -----*---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---t------ 3dl2_af208683 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208684 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208685 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208686 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_af208687 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... 3dl2_aj276125 ---------- ---------- -----*---- ---------- ---------- ---------- ---------- ------c--- ---------- ---t------ kirc1_ac006293 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g--------- --------t- --t---ct-- ---------- ---------t kirc1_af072407-10 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g--------- --------t- --t---ct-- ---------- ---------t kirc1_af352324 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g--------- --------t- --t---cc-- ---------- ---------t 3dl3_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g--------- --------t- --t---cc-- ---------- ---------t 3dl3_ay083462 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kir44b_af204912-14 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kirx_af082931-5 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g--------- --------t- --t---ct-- ---------- ---------t kirz_ac006293 ---------- ---------- a----*---- ---------- ---------t ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kir15_af204906-8 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... kiry_af082940-7 ---------- ---------- a----*---- ---------- ---------t ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- kirx_al133414 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** kirx_ac011501 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** kir48_af204918-20 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** kir222_af133901 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** kir411_af134311-2 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- g--------- --------t- --t---ct-- ---------- ---------t Consensus ACACCCCCAA CAGATACCAG CGTGTAACAC GGAACTTCCA AATGCTGAGC CCAGATCCAA AGTTGTCTCC TGCCCATGAG CACCACAGTC AGGCCTTGAG 1401 1477 2dl1_u24078 --cg------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 2dl1_ac011501 --cg------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 2dl1_af285431 --cg------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 2dl1_l41267 --cg------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 2dl1_u24076 --cg------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 2dl1_af022045 --cg------ -------... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2dl1_af135560 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2dl1_af285432 --cg------ -------... .......... .......... .......... .......... .......... ....... kirg2_af001885-8 --cg------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. kir221_af133901 --cg------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 2ds1_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 2ds1_x98858 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2ds1_x89892 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2ds1_af285437 ---------- -------... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2dl2_u24075 --cg------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 2dl2_al133414 --cg------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------- 2dl2_l76669 --c------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 2dl2_af285433 --tg------ -------... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2dl2_af285434 --cg------ -------... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2ds2_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 2ds2_l41347 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 2ds2_x89893 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2ds2_af285439 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 2ds2_af285438 ---------- -------... .......... .......... .......... .......... .......... ....... kir2d_aj002102 ---------- ---------- ---------- --------.. .......... .......... .......... ....... kir2d_aj002103 ---------- ---------- ---------- --------.. .......... .......... .......... ....... kir2d_aj002105 ---------- ---------- ---------- -a---c-... .......... .......... .......... ....... 2dl3_u97173-80 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2dl3_af082936-9 ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- --a------- ---------- ------. 2dl3_af022048 ---------- -------... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2dl3_af285435 ---------- -------... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2dl3_l76662 ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- --a------- ---------- ------. 2dl3_l76663 ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- --........ .......... ....... 2dl3_u73395 ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- --a------- ---------- ------. 2dl3_u96190 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... kir412_af134312-6 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... kircl23_af133896-900 ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- --a------- ---------- ------. 2ds3_x97231 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2ds3_af022047 ---------- -------... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2ds3_l76670 ---------- ---------- ---------- -......... .......... .......... .......... ....... 2ds4_ac011501 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------- 2ds4_af215832 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2ds4_aj417555 ---------- ---------- ---------- ---------. .......... .......... .......... ....... 2ds4_af002255 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 2ds4_l76671 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- --........ .......... ....... 2ds4_af285440 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 2ds4_x94609 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2ds4_u96188 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2ds4_af082961 --........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2ds4_aj417554 ---------- ---------- ---------- ---------. .......... .......... .......... ....... 2ds5_al133414 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 2ds5_af272389 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------- 2ds5_l76672 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- t--g------ ------. 2dl4_bc028137 ---------- ---------- ---------- -----c--a- c--------- -ta------- ---------- ------. 2dl4_af285436 ---------- ---------- ---------- -----c--a- c--------- -ta------- ---------- ------. 2dl4_af002980 ---------- ---------- ---------- -----c--a- c--------- ---------- ---------- ------. 2dl4_u71199 ---------- ---------- ---------- -----c--a- c--------- ---------- ---------- ------. 2dl4_x97229 ---------- ---------- ---------- -----c--a- c--------- -ta------- ---------- ------. 2dl4_ac011501 ---------- ---------- ---------- -----c--a- c--------- -ta------- ---------- ------. 2dl4_al133414 ---------- ---------- ---------- -----c--a- c--------- -ta------- ---------- ------. 2dl4_af002979 ---------- ---------- ---------- -----c--a- c--------- ---------- ---------- ------. 2dl4_af276292 ---------- ---------- ---------- -----c--a- c--------. .......... .......... ....... 2dl4_ay052496 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2dl4_ay052498 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 2dl4_af002256 ---------- ---------- ---------- -----c--a- c---g----- -ta------- ---------- ------. 2dl4_af034772 ---------- ---------- ---------- -----c--a- c--------- -ta------- ---------- ------. 2dl4_af034771 ---------- ---------- ---------- -----c--a- c--------- -ta------- ---------- ------. 2dl4_x99480 ---------- ---------- ---------- -----c--a- c--------- -ta------- ---------- ------. kir2dl_x99481 ---------- ---------- ---------- -----c--a- c--------- -ta------- ---------- 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3dl1_af082956-9 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl1_af208688 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl1_af208689 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl1_af262968 -acg------ --........ .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl1_af262969 --cg------ --........ .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl1_af262970 --cg------ --........ .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl1_af262971 --cg------ --........ .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl1_af262972 --cg------ --........ .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl1_af262973 --cg------ --........ .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl1_af262974 -acg------ --........ .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl_af105231-9 -acg------ ---------- ---------- ---------a ---------- ---------- ---------- ------. 3dl_x97230 ---------- ---------- ---------- --------.. .......... .......... .......... ....... 3ds1_aj417558 ---------- ---------- ---------- -------t-. .......... .......... .......... ....... 3ds1_l76661 ---------- ---------- ---------- -------t-- --------t- ---------- ---------- ------. 3ds1_af022044 ---------- -------... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3ds1_al133414 ---------- ---------- ---------- -------t-- ---------- ---------- ---------- ------. 3ds1_u73396 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3ds1_x97233 ---------- ---------- ---------- -------t.. .......... .......... .......... ....... 3dl2_x93595 ---g-t---- ---------- ---------- --------a- --------a- --a---a--- ---------- ------. 3dl2_ay059418 ---g-t---- --........ .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl2_ay059419 ---g-t---- --........ .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl2_ay059420 ---g-t---- --........ .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl2_l41270 ---g-t---- ---------- ---------- --------a- --------a- --a---a--- ---------- ------. 3dl2_al133414 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl2_l76665 ---g-t---- ---------- ---------- --------a- --------a- --a---a--- ---------- ------. 3dl2_l76666 ---g-t---- ---------- ---------- -......... .......... .......... .......... ....... 3dl2_u30272 ---g-t---- ---------- ---------- --------a- --------a- --a---a--- ---------- ------. 3dl2_x93596 ---g-t---- ---------- ---------- --------a- --------a- --a---a--- ---------- ------. 3dl2_af262966 ---g-t---- --........ .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl2_af262965 ---g-t---- --........ .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl2_af263617 ---g-t---- --........ .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl2_af082963-7 ---g-t-... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl2_af208683 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl2_af208684 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl2_af208685 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl2_af208686 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl2_af208687 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... 3dl2_aj276125 ---g-t---- ---------- ---------- --------.. .......... .......... .......... ....... kirc1_ac006293 ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- ---------- ---------- c-----. kirc1_af072407-10 ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- ---------- ---------- c-----. kirc1_af352324 ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 3dl3_al133414 ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------. 3dl3_ay083462 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... kir44b_af204912-14 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... kirx_af082931-5 ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- ---------- ---------- c-----. kirz_ac006293 ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- ------- kir15_af204906-8 .......... .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... kiry_af082940-7 --........ .......... .......... .......... .......... .......... .......... ....... kirx_al133414 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ******* kirx_ac011501 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ******* kir48_af204918-20 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ******* kir222_af133901 ********** ********** ********** ********** ********** ********** ********** ******* kir411_af134311-2 ---------- ---------- t--------- ---------- ---------- ---------- ---------- c-----. Consensus GGGATCTTCT AGGGAGACAA CAGCCCTGTC TCAAAACCGG GTTGCCAGCT CCCATGTACC AGCAGCTGGA ATCTGAA
From: The KIR Gene Cluster
NCBI Bookshelf. A service of the National Library of Medicine, National Institutes of Health.