Noncontiguous finished genome sequence and description of Bacillus andreraoultii strain SIT1(T) sp. nov

S I Traore; T Cimmino; J-C Lagier; S Khelaifia; S Brah; C Michelle; A Caputo; B A Diallo; P-E Fournier; D Raoult; J M Rolain

doi:10.1016/j.nmni.2015.12.005

Noncontiguous finished genome sequence and description of Bacillus andreraoultii strain SIT1(T) sp. nov

New Microbes New Infect. 2015 Dec 23:10:25-35. doi: 10.1016/j.nmni.2015.12.005. eCollection 2016 Mar.

Authors

S I Traore¹, T Cimmino², J-C Lagier², S Khelaifia², S Brah³, C Michelle², A Caputo², B A Diallo⁴, P-E Fournier², D Raoult⁵, J M Rolain²

Affiliations

¹ Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, Inserm U1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France; Département d'Epidémiologie des Affections Parasitaires, Faculté de médecine et de pharmacie de Bamako, Mali.
² Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, Inserm U1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
³ Hôpital National de Niamey, Niamey, Niger.
⁴ Laboratoire de Microbiologie, Département de Biologie, Université Abdou Moumouni de Niamey, Niamey, Niger.
⁵ Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes, UM 63, CNRS 7278, IRD 198, Inserm U1095, Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée-Infection, Faculté de médecine, Aix-Marseille Université, Marseille, France; Special Infectious Agents Unit, King Fahd Medical Research Center, King Abdulaziz University, Jeddah, Saudi Arabia.

Abstract

Bacillus andreraoultii strain SIT1(T) (= CSUR P1162 = DSM 29078) is the type strain of B. andreraoultii sp. nov. This bacterium was isolated from the stool of a 2-year-old Nigerian boy with a severe form of kwashiorkor. Bacillus andreraoultii is an aerobic, Gram-positive rod. We describe here the features of this bacterium, together with the complete genome sequencing and annotation. The 4 092 130 bp long genome contains 3718 protein-coding and 116 RNA genes.

Keywords: Culturomics; genome.