WARNING: C Toolkit is deprecated, please use C++ Toolkit instead

NCBI Home
IEB Home
C Toolkit docs
C++ Toolkit source browser

NCBI C Toolkit Cross Reference

Source navigation
Identifier search
General search

Identifier search

Type the full name of an identifier to look for (a function name, variable name, typedef, etc).
Matches are case-sensitive. As a convenience,extra N line numbers denote case-insensitive occurrences..

      


Definitions for CharPtr

Type Member of File Line
macro (un)definition /corelib/ncbistd.h 124
macro (un)definition /corelib/ncbiwin.h 117
typedef /demo/testcgi.c 83
typedef /demo/trna2tbl.c 80

4 declarations in 4 files.

References to CharPtr

File Line
/access/cddapi.c 59 72 74 86 240 265
/access/cddapi.h 89 108 132
/access/ent2api.c 54 56 57 58 59 128 133 150 178 179 184 191 203 204 208 217 233 234 235 236 237 246 258 298 299 300 301 302 312 313 314 315 316 317 318 319 323 337 387 388 389 390 391 398 409 443 458 473 474 486 540 548 647 684 708 715 722 782 863 899 976 1013 2102 2106 2107 2146 2158 2183 2196 2238 2240 2241 2247 2251 2255 2258 2262 2280 2581 2735 2756 2765
/access/ent2api.h 65 66 69 70 71 72 73 80 81 82 83 84 90 91 92 93 94 95 96 97 100 101 102 103 104 112 113 118 123 373 378 379
/access/mla2api.c 192 223 239 274 275 276 277 279 433 450 451 452 453 457 553 558 602 615 631 639 670 759
/access/mla2api.h 115 127 128 129 130 132 167
/access/objegkludge.h 22
/access/objent2.h 34 53 104 105 127 128 182 183 184 201 202 221 222 223 242 262 282 301 302 303 304 414 474 475 476 501 502 503 528 529 530 531 550 551 589 590 608 629
/access/objentgene.h 41 114 115 116 117 147 191 193 194 215 216 235 236 237 238
/access/objmim.h 72 74 75 76 77 123 124 143 144 163 182 183 204 234 235 236 238 240 241 242 243 244 245 246 249 270 289 308 309
/access/objtax3.h 118 120 159
/access/pmfapi.c 64 82 83 84 85 89 186 191 245 253 292 320 343 379 389 412 458 481 517 525 549 584 595 604 634 645 654 685 726 729 738 739 748 906 913 942 952 968 973 986 996 1012 1017 1041 1131 1141 1157 1162 1189 1197 1235 1239 1241 1353 1392 1399 1425 1432 1443 1550 1554 1590 1620 1631 1693 1701 1712 1773 1781 1790 1825 1833 1842 1878 1887 1893 1938 1944 1979 1980 1985 1994 2160 2222 2254 2255 2256 2257 2258 2286 2298 2308 2473 2523 2526 2718 2730 2732 2847 2849 2850 3041 3045 3047 3069 3101 3103 3322 3340 3340 3365 3366 3367 3368 3369 3559 3570 3688 3689 3760 3760 3763 3784 3784 3787
/access/pmfapi.h 78 90 106 114 125 129 141 158 173 176 188 191 197 204 211 212 278 296 302 334 344 403 416 427
/access/qblastapi.c 139 139 143 144 260 261 313 316 383 451 455 531 532 707 793 801 814 858 863 899 900 915 930 930 941 959 973 985 985
/access/qblastapi.h 128 129 155 185 196 207 208 210 211 217 217 218 218
/access/tax3api.c 65 67 101 104 114 273 298 394 395 824 824 824 826 835 842 842 842 844 846 870 916 918 919 960 962 995 1130 1130 1147 1247 1250 1250 1252 1253 1292 1292 1294 1303 1303 1305 1330 1342 1376 1379 1398 1420 1429 1578 1580 1590 1994 2007 2114 2228 2229 2273 2285 2285 2287 2292 2300 2300 2303 2304 2348 2383 2389 2409 2450 2460 2462 2490 2549 2551 2564 2564 2566 2603 2668 2674 2682 2699 2724 2751 2751 2755 2765 2766 2804 2920 2922 3009 3014 3067 3068 3071 3071 3109 3110 3111 3163 3325 3451 3610 3617 3618 3619 3620 3622 3623 3631
/access/tax3api.h 123 135 136 171 172 173 189 190 191 201 207
/access/vecscnapi.c 52 52 56 57 75 152 153 154 239 240 241 363
/access/vecscnapi.h 85 99
/algo/blast/api/blast_seqalign.c 38
/api/a2fstruc.h 94 105 107 155 156 157 158 159 160 161 162
/api/acerdapi.c 100 145 197 200 387 408 468 479 757
/api/alignmgr.c 597 597 597 597 2716 2716 2719 2719 2746 2746 2746 2746 2750
/api/alignmgr2.c 5652
/api/alignval.c 79 97 97 100 1577 1577 1614 2468
/api/aliparse.c 54 55 61 65 72 75 116 118 137 139 266 268 541 543 590 592 630 631 690 809 993 1084 1380 1471 1823 1824 1827 1856 1857 1861 1862 1866 1867 1872 1875 1881 1884 1890 1894 1895 1901 1906 1911 1917 1924 1929 1930 1935 1936 1941 1943 1948 1949 1955 1962 1968 2027 2028 2029 2055 2059 2093 2124 2376 2585 2588 2591 2617 2638 2638 2655 2663 2663 2666 2667 2670 2686 2718 2718 2719 2719 2807 2892 3004 3006 3045 3056 3061 3140 3145 3145 3220 3232 3233
/api/aliread.c 25 26 27 29 30 37 39 42 44 44 46 48 84 174 175 176 233 281 373 379 380 390 431 469 474 475 486 487 599 642 645 647 655 662 663 877 880 889 958 958 960 961 980 1004 1007 1008 1062 1085 1108 1140
/api/aliread.h 17 23 25 26 34 35 41 42 50 51 65 66 67 80 81 82 89 95 98 112
/api/asn2ff.h 164 178
/api/asn2ff1.c 107 108 120 127 130 135 135 285 400 688 693 694 711 711 755 760 761 802 802 2111 2114 2121 2157 2159 2197 2211 3354 3356 3365 3367 3369 3484 3804 3809 3820 3928 3929 3949 3950 3970 3989 4008 4031 4048 4090 4093 4099 4143 4176 4178 4199 4225 4271 4275 4314 4318 4382 4498 4579 4711 4714 4720 4897 4954 4974 5028 5095 5321 5418
/api/asn2ff2.c 228 229 230 230 231 272 291 297 314 321 337 343 355 361 373 379 391 397 409 441 464 481 516 520 531 533 541 545 548 558 562 564 576 587 599 603 607 611 615 619 635 637 639 649 654 683 685 711 712 713 714 716 721 743 747 769 772 776 952 1082 1085 1143 1167 1193 1196 1229 1251 1254 1292 1295 1327 1330 1388 1635 1638 1649 1683 1703 1955 2522 2522 2524
/api/asn2ff3.c 53 59 61 64 67 67 70 71 73 75 78 83 91 103 134 216 454 457 483 485 486 534 537 560 622 854 954 1145 1146 1147 1149 1153 1166 1189 1208 1249 1276 1400 1537 1541 1563 1563 1591 1594 1719 1808 1833 1941 1943 2118 2135 2137 2182 2357 2371 2423 2492 2512 2593 2614 2735 2957 2957 2959 2983 2983 2985 3015 3019 3097 3266 3270 3365 3368 3413 3495 3496 3498 3518 3736 3790 3835 3885 3910 3919 4046 4051 4054 4294 4299 4498 4502 4536
/api/asn2ff4.c 287 287 288 288 289 290 292 293 293 293 294 294 294 294 296 296 296 297 297 297 298 298 298 300 310 313 314 378 379 433 438 512 516 632 635 636 810 836 838 849 863 864 864 879 880 880 880 882 896 924 925 925 928 941 941 941 944 1062 1063 1063 1066 1158 1297 1298 1370 1661 1706 2067 2068
/api/asn2ff5.c 188 189 189 189 189 189 190 190 191 191 193 195 196 197 198 199 201 201 202 202 203 203 203 203 203 204 217 275 294 296 338 339 341 362 363 363 363 363 365 391 407 408 414 451 504 506 535 540 562 666 669 687 705 708 712 814 817 856 899 899 899 902 922 929 930 1048 1054 1203 1209 1229 1229 1285 1290 1292 1297 1318 1318 1373 1375 1399 1405 1406 1407 1408 1459 1459 1586 1592 1593 1627 1627 1660 1673 1747 1747 1792 1814 1814 1814 1814 1814 1848 1848 1848 1849 1849 1849 1852 1881 1882 1882 1882 1882 1883 1883 1886 1939 1946 1947 1966 1966 1986 2100 2101 2103 2157 2157 2166 2491 2492 2494 2496 2593 2597 2909 2974 2981 3002 3006 3173 3174 3246 3250 3319 3322
/api/asn2ff6.c 404 404 418 418 419 419 557 557 563 563 570 570 613 614 618 619 620 621 722 838 838 849 849 860 885 891 1049 1246 1246 1246 1246 1251 1268 1289 1289 1289 1310 1315 1325 1325 1359 1400 1400 1426 1426 1436 1438 1451 1453 1465 1526 1610 1693 1701 1794 1812 1814 1835 1840 1854 1863 2019 2020 2146 2295 2296 2397 2546 2546 2550 2675 2682 2683 2751 2778 2778 2778 2778 2778 2883 2883 2928 2928 3012 3016 3066 3066 3075 3076 3245 3247 3259 3487
/api/asn2ff6.h 152 222 222 222 222 225 225 226 226 227 227 228 228 228 229 229 230 230 232 232 233 233 234 235 235 236 237 238 244
/api/asn2ffg.h 218 226 235 237 268 329 330 331 334 335 351 437
/api/asn2ffp.h 77 113 113 115 123 136 137 148 150 151 152 155 156 159 161 161 167 168 169
/api/asn2gnb1.c 67 72 140 161 167 168 169 176 185 195 196 197 202 204 205 221 257 258 259 263 290 291 292 298 299 300 304 339 356 375 380 404 433 439 440 579 595 614 616 640 642 676 713 743 811 817 972 972 972 977 987 1008 1016 1736 1839 1843 1863 1864 1865 1881 1889 1890 1891 1896 1910 1918 2016 2033 2053 2057 2105 2152 2199 2264 4363 4381 4446 4450 4461 4500 4501 5317 5330 5365 5398 5411 5502 5513 5515 5516 5523 5524 5555 5560 5563 5573 5578 5588 5632 5636 5649 5656 5663 5670 5684 5738 5744 5809 5817 6208 6209 6214 6227 6275 6291 6301 6302 6314 6315 6360 6370 6403 6418 6425 6496 6635 6650 6657 6694 6728 6883 6896 6942 7008 7039 7057
/api/asn2gnb2.c 70 72 74 76 78 79 81 83 84 86 88 90 92 94 101 102 114 118 125 130 139 143 148 175 214 260 264 269 402 407 423 425 479 514 518 527 528 1593 1661 1684 1684 1686 1709 1713 1747 1753 1761 1789 1801 1830 1841 1844 1848 1849 2101 2158 2384 2398 2399 2405 2406 2445 2446 2452 2453 2488 2489 2495 2496 2531 2532 2538 2539 2575 2576 2617 2617 2621 2626 2629 2635 2636 2643 2644 2686 2688 2805 2830 2846 2849 3120 3127 3130 3132 3134 3135 3304 3313 3319 3321 3341 3356 3527 3531 3668 3721 3722 3725 3727 3754 3801 3822 3822 3825 3830 3839 3846 3961 4222 4229 4233 4239 4241 4260 4286 4293 4300 4301 4316 4317 4324 4363 4364 4382 4392 4398 4400 4648 4662 4672 4689 4796 4832 4848 4986 5009 5030 5031 5711 5717 5718 5719 5725 6551 6555 6606 6608 6610 6612 6752 6753 6784 6786 6854 6858 6905 6907 7017 7021 7067 7069 7159 7170 7224 7226 7484 7511
/api/asn2gnb3.c 66 68 70 72 74 75 83 84 97 198 250 257 343 344 352 353 357 383 385 448 449 457 458 462 489 491 552 553 561 562 566 592 594 654 661 712 719 749 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 789 794 811 837 842 866 890 891 895 918 939 944 949 1093 1099 1161 1175 1184 1186 1188 1190 1192 1194 1196 1198 1200 1202 1204 1256 1262 1291 1297 1316 1317 1318 1340 1345 1357 1359 1381 1393 1448 1453 1489 1513 1514 1515 1528 1544 1581 1582 1672 1688 1768 1797 1950 1952 1968 1969 1970 1990 1998 2014 2039 2066 2114 2125 2126 2160 2208 2274 2363 2364 2365 2366 2368 2374 2376 2379 2383 2392 2394 2428 2439 2440 2451 2466 2482 2499 2502 2503 2504 2505 2506 2530 2565 2565 2600 2606 2614 2628 2631 2633 2634 2638 2641 2642 2643 2662 2670 2674 2676 2680 2684 2685 2690 2695 2697 2698 2700 2701 2711 2712 2715 2765 2767 2774 2777 2793 2916 2930 2975 3003 3038 3403 3423 3978 4375 4452 4457 4502 4509 4530 4537 4659 4888 5097 5144 5169 5183 5475 5958 6002 6004 7630 7668
/api/asn2gnb4.c 67 69 71 73 75 76 78 79 87 271 419 476 523 550 582 586 590 592 610 621 622 814 823 854 885 1626 1645 1649 1662 1662 1673 1686 1692 1730 1731 1739 1808 1816 1823 1856 1865 1866 1867 1879 1881 1882 1890 1903 1976 2052 2057 2089 2094 2095 2096 2098 2134 2142 2175 2180 2183 2193 2198 2368 2376 2379 2380 2385 2386 2403 2408 2411 2421 2426 2500 2546 2549 2550 2557 2564 2571 2578 2585 2599 2619 2625 2667 2712 2743 2763 2801 2806 2807 2809 2847 2935 2941 2942 2943 3017 3020 3035 3074 3086 3087 3089 3091 3102 3103 3105 3251 3264 3277 3287 3321 4293 4336 4573 4623 4688 5003 5107 5301 5325 5458 5494 5693 5701 5727 5728 5729 5745 5859 5862 5868 5878 5881 5887 5900 5908 5936 6155 6167 6207 6209 6213 6219 6220 6221 6290 6298 6322 6345 6432 6433 6452 6486 6487 6490 6519 6520 6521 6522 6545 6553 6556 6573 6576 7071 7289 7467 7468 7506 7507 7614 7615 7722 7844 7852 7856 7926 7928 7938 7940 7981 8040 8041 8058 8201 8441 8455 8593 8607 8643 8645 8658 8659 8662 8664 8718 8734 8739 8740 8784 8846 8859
/api/asn2gnb5.c 69 71 73 75 93 95 120 131 204 205 345 379 380 385 688 689 693 722 726 761 770 771 772 892 894 895 896 897 906 907 908 909 988 991 1007 1008 1061 1076 1114 1141 1145 1167 1180 1193 1206 1207 1275 1310 1321 1325 1370 1371 1381 1704 1705 1706 1711 1712 1752 1794 1819 1832 1834 1835 1836 1837 1838 1840 1866 1894 1961 1967 1968 2006 2012 2156 2162 2170 2176 2179 2180 2181 2182 2183 2186 2216 2300 2308 2309 2310 2314 2315 2336 2336 2419 2430 2431 2432 2433 2494 2503 2533 2545 2549 2550 2552 2553 2773 2782 2787 2788 2790 2791 2792 2865 2927 2933 2939 2982 3001 3166 3184 3196 3197 3202 3203 3236 3236 3241 3242 3246 3247 3366 3367 3372 3373 3394 3404 3411 3415 3416 3420 3561 3578 3583 3608 3610 3613 3623 3625 3627 4065
/api/asn2gnb6.c 68 70 71 73 74 76 78 80 82 454 587 622 644 645 648 682 686 810 836 862 868 871 874 875 878 879 882 884 896 898 900 902 903 904 1092 1141 1151 1157 1161 1165 1167 1168 1169 1345 1346 1361 1361 1362 1386 1391 1418 1419 1420 1425 1482 1490 1494 1528 1538 1541 1544 1545 1546 1547 1548 1549 1550 1566 1573 1580 1585 1604 1619 1638 1741 1758 1765 1768 1769 1770 1783 1790 1822 1856 1880 1887 1913 1965 1981 2004 2018 2025 2029 2030 2031 2032 2075 2102 2107 2269 2271 2276 2643 2848 2866 3185 3212 3231 3232 3237 3238 3261 3267 3270 3271 3272 3273 3368 3476 3477 3478 3479 3505 3512 3540 3541 3542 3543 3544 3551 3561 3570 3581 3596 3604 3605 3671 3672 3673 3704 3714 3765 3766 3779 3814 3821 3823 3824 3889 3889 3892 3986 3987 3990 3991 3992 4097 4102 4136 4137 4138 4142 4143 4174 4175 4181 4224 4229 4273 4279 4281 4282 4284 4344 4374 4387 4407 4412 4421 4432 4434 4786 5213 5287 5294 5324 5338 5405 5407 5450 5450 5454 5455 5503 5705 5722 5728 5879 5884 5885 5887 5904 5919 5933 5947 5966 5982 5998 6004 6041 6042 6165 6187 6196 6197 6402
/api/asn2gnbi.h 111 112 113 188 379 382 383 402 403 433 434 786 787 794 799 803 808 845 861 862 863 864 865 869 870 871 873 877 878 882 893 894 894 894 933 940 944 949 950 951 956 964 966 974 975 976 990 996 1067 1070 1071 1076 1077 1078 1082 1083 1084 1087 1088 1090 1096 1099 1100 1105 1113 1118 1130 1141 1143 1147 1161 1168 1182 1185 1195 1215 1222 1223 1225 1225 1226 1227 1230 1232 1233 1234 1236 1237 1239 1240 1241 1244 1248 1353 1357 1361 1365 1369 1373 1377 1381 1385 1389 1393 1397 1406 1416 1434 1454
/api/asn2gnbk.h 219
/api/asn2gnbp.h 93 136 160 180 184 185 186 187 188 189 262 277 278 325 336 342
/api/codon.c 35 38 77 252 258 263 474 671 671 693 693 702 773 773 781
/api/codon.h 71 122 136 153 153 157 169 169 185 185 190 190
/api/edutil.c 704 705 5463 6997
/api/edutil.h 637 715
/api/explore.h 118 399 427 440 688
/api/fdlobj.h 55
/api/ffprint.c 186 187 196 197 216 230 234 250 255 384 384 387 420 420 420 422 424 431 431 434 450 470 474 517 521 570 572 575 605 607 610 642 670 693 722 761 764 765 767 939 977 1005 1038 1038 1041 1048 1092 1098 1140
/api/ffprint.h 71 75 80 83 100 101 102 104 104 105 105 106 107 108 109 110 113 114 115 120 120 121 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 149 149 151 152 153
/api/findrepl.c 55 66 67 96 97 98 133 142 143 144 154 156 194 200 213 221 222 224 258 305 312 313 360 383 505 508 532 546 612 627 638 689 710 716 722 728 761 787 808 823 900 922 1371 1397 1471 1474 1481 1504 1592 1594 1696 1698 1796 1809 1811 1832 1835 1861 1916 2110 2111 2256 2392 2393 2394
/api/findrepl.h 71 97 98 99 100 101 105 106 121 122 123 130
/api/ftusrstr.c 85 116 118 149 149 153
/api/ftusrstr.h 40 42 44 44
/api/gather.c 5424 5767 6884 6902
/api/gather.h 562
/api/gbfeat.c 16 27 47 68 92 261 551 551 553 613 712 741 743 780 780 782 825 930 1009 1012 1076 1120 1122 1217 1327 1384 1384 1417 1417 1433 1433 1436
/api/gbfeat.h 47 52 54 67 81 81 87 91 91 96 107 114 114 116 116 118 118
/api/gbftdef.h 169 177 196 197 198 199
/api/gbftglob.c 81 83 85 88
/api/gbparint.c 120 120 123 207 209 220 223 421 519 1114 1359 1862 1864 1911 1913 2300 2302 2685 2686
/api/jzcoll.c 256 256 462 513 531 615 619 684 710 811 819 819 839 839 880 881 882 962 963 965 1080 1085 1096 1125 1201 1308 2344 3491 3494 3507 3512 3530
/api/jzcoll.h 294 295 453 478 679 686
/api/jzmisc.c 33 33 84 109 109 132 144 190 190 190 255 272 483 510 557 570 570 580 676 676 1712 1712 1740 1755 1755 1858 1862 2022 2259
/api/jzmisc.h 110 110 111 111 113 114 115 118 118 118 119 120 123 155 155 156 156 160 166 197
/api/lsqfetch.c 57 59 80 80 107 155 159 194 268 270 359 373 435 520 585 585 606 683 692 694 773 773 797 885 887 891 900 900 950 992 997 1082 1083 1084 1086 1087 1092 1145 1154 1197 1198 1262 1265 1266 1282 1340 1380 1383 1388 1412 1460 1528 1543 1570 1637 1648 1713 1726 1729 1730 1732 1734 1743 1805 1816 1820 1822 1824 1825 1826 1914 1916 1932 2018 2064 2169 2170 2182 2271 2283 2284 2294 2368 2380 2381 2396 2402 2410 2420 2421 2531 2532
/api/lsqfetch.h 145 190 191 263 269 274 279 283 289 289 291 291
/api/macroapi.c 103 105 122 124 141 143 158 160 682 1273 1402 1404 1419 1419 1449 1450 1454 1454 1470 1486 1528 1529 1545 1546 1560 1580 1689 1702 1739 1760 1776 1789 1961 1983 1996 2111 2113 2114 2122 2132 2134 2135 2136 2137 2149 2152 2160 2162 2163 2170 2186 2401 2403 2418 2626 2683 2696 2731 2753 2793 2806 2836 2891 2896 3045 3076 3089 3129 3141 3565 3599 3612 3641 3689 3702 3731 3761 3774 3803 3831 3844 3873 3899 3912 3941 3968 3981 4006 4008 4035 4037 4038 4070 4109 4176 4215 4244 4306 4349 4349 4383 4383 4404 4406 4429 4429 4439 4439 4453 4454 4459 4557 4559 4593 4594 4642 4644 4659 4659 4662 4679 4679 4681 4692 4694 4697 4902 4917 4930 4944 4944 4947 4975 4988 5008 5025 5027 5686 5692 5701 5712 5712 5714 5715 5718 5719 5736 5802 5802 5805 5807 5874 5874 5876 5877 5923 5932 5932 5934 5952 5954 5983 5985 6030 6030 6034 6062 6072 6082 6092 6102 6112 6122 6132 6142 6152 6171 6171 6173 6174 6193 6205 6205 6208 6217 6222 6229 6232 6256 6256 6259 6284 6284 6286 6288 6307 6317 6333 6333 6337 6351 6354 6357 6360 6363 6366 6373 6376 6401 6401 6404 6432 6436 6462 6481 6492 6496 6562 6562 6605 6605 6607 6620 6648 6651 6668 6681 6685 6713 6715 6787 6790 6801 6817 6820 6822 6823 6864 6869 6904 6906 6946 6946 6948 6962 6964 6977 6980 7054 7058 7076 7098 7114 7144 7177 7183 7238 7240 7265 7270 7297 7313 7338 7342 7414 7420 7615 7636 7640 7681 7759 7847 7882 7894 7924 7950 7980 8015 8015 8089 8091 8159 8215 8217 8218 8219 8232 8238 8248 8253 8283 8368 8373 8409 8415 8433 8437 8451 8453 8732 8767 8782 9187 9268 9335 9408 9414 9774 9787 9802 9808 9842 10117 10121 10370 10389 10399 10401 10406 10421 10438 10440 10447 10460 10502 10544 10578 10612 10646 10680 10701 10722 10832 10836 10864 10888 10890 10891 10900 10951 10953 11097 11279 11467 11472 11902 11904 12414 12689 12691 12863 12934 12939 12983 12987 12990 13010 13030 13033 13062 13062 13062 13081 13081 13083 13117 13120 13161 13238 13242 13243 13244 13264 13281 13293 13309 13366 13380 13382 13397 13417 13420 13421 13423 13435 13462 13464 13476 13504 13505 13518 13564 13568 13569 13570 13571 13585 13596 13596 13655 13655 13680 13697 13701 13702 13780 13782 13798 13807 13827 13833 13835 13867 13879 13887 13942 13942 13944 13945 14015 14031 14050 14055 14095 14098 14288 14304 14306 14437 14498 14500 14534 14551 14553 14615 14654 14656 14696 14718 14720 14799 14849 14857 15042 15279 15305 15522 15524 15596 15747 15757 15972 16042 16044 16158 16166 16305 16410 16694 16736 16742 16758 16836 16878 17157 17241 17305 17597 17674 17674 17676 17714 17754 17755 17759 17830 17871 17902 18184 18215 18217 18230 18282 18324 18351 18362 18591 18609 18771 18803 18937 19014 19082 19145 19147 19186 19196 19268 19356 19358 19360 19376 19698 19698 19700 19728 19752 19752 19755 19801 20617 20663 20699 20730 20757 20787 20790 20803 20811 20817 20823 20827 20828 20842 20872 20887 20920 20955 21013 21226 21248 22259 22344 22374 22478 22481 22550 22575 22575 22580 22621 22626 22682 22766 22800 22847 22888 22896 22941 22981 22989 22991 22991 22994 23050 23188 23200 23202 23229 23416 23462 23667 23667 23669 23686 23686 23738 23742 23782 23787 23938 23940 23957 23960 23975 23993 24192 24573 24574 24582 24586 24695 24798 24919 24960 24995 25009 25222 25281 25427 25431 25457 25727 25850 26448 26508 26632 26721 26724 26743 26760 26815 26817 26837 26906 26927 26927 26936 26936 26985 26986 27080 27126 27128 27251 27441 27577 27660 27661 27662 27674 27690 27691 27692 27698 27764 27766 27854 27854 28261 28263 28297 28300 28319 28333 28537 28595 28691 28722 28750 28757 28759 28760 28766 28774 29069 29087 29141 29149 29152 29164 29176 29190 29206 29218 29221 29222 29272 29302 29305 29321 29342 29343 29371 29405 29408 29424 29507 29725 29745 29756 29769 29777 29790 29912 29928 30016 30020 30041 30044 30076 30195 30196 30215 30231 30241 30243 30314 30345 30402 30404 30418 30555 30558 30559 30565 30571 30573 30595 30597 30598 30609 30618 30620 30621 30622 30623 30624 30637 30652 30666 30668 30676 30682 30684 30685 30694 30705 30707 30714 30714 30722 30730 30732 30733 30734 30740 30747 30749 30750 30751 30752 30760 30763 30773 30776 30777 30785 30793 30796 30822 30824 30825 30826 30827 30853 30880 30882 30883 30884 30925 30932 30934 30935 30936 30960 30969 30971 30988 30990 30991 30992 31013 31022 31024 31041 31043 31044 31045 31063 31072 31074 31088 31090 31107 31109 31110 31116 31123 31125 31126 31127 31129 31139 31144 31155 31157 31158 31159 31160 31161 31220 31224 31240 31241 31243 31245 31247 31248 31258 31263 31270 31284 31286 31287 31294 31302 31304 31475 32089 32091 32093 32094 32104 32110 32118 32118 32120 32121 32122 32123 32134 32137 32146 32149 32150 32151 32255 32261 32415 32417 32467 32469 32484 32486 32487 32488 32522 32564 32590 32593 32595 32596 32612 32624 32626 32627 32662 32685 32687 32688 32689 32722 32742 32742 32749 32750 32751 32752 32753 32769 32785 32798 32849 32864 32882 32884 32885 32886 32887 32897 32900 32909 32911 32912 32913 32914 32928 32938 32940 32941 32942 32943 32944 32960 32972 32974 32975 32976 32985 32993 32995 32996 32997 33006 33014 33016 33017 33018 33026 33034 33036 33065 33068 33069 33070 33071 33085 33097 33106 33110 33120 33132 33134 33135 33136 33147 33157 33159 33160 33161 33169 33177 33179 33218 33229 33231 33232 33233 33234 33245 33260 33262 33282 33284 33285 33286 33287 33288 33313 33341 33343 33344 33345 33346 33354 33357 33367 33369 33371 33372 33375 33403 33432 33444 33446 33447 33464 33479 33481 33507 33509 33510 33511 33512 33513 33514 33538 33555 33557 33577 33579 33580 33586 33595 33597 33635 33689 33691 33734 33735 33737 33739 33742 33761 33794 33796 33797 33798 33799 33800 33802 33806 33842 33907 33913 33950 33967 33969 33969 33971 33972 33978 33985 33987 33988 33989 33990 33991 33992 34035 34071 34073 34074 34075 34076 34077 34078 34079 34115 34118 34121 34126 34129 34133 34136 34149 34151 34152 34153 34159 34162 34172 34174 34175 34176 34177 34178 34179 34180 34194 34197 34200 34205 34208 34212 34215 34227 34228 34230 34230 34232 34234 34245 34257 34259 34260 34266 34272 34283 34285 34293 34295 34296 34298 34299 34300 34301 34302 34303 34304 34394 34460 34461 34463 34465 34466 34476 34483 34485 34486 34495 34502 34504 34533 34562 34564 34565 34566 34574 34584 34586 34587 34588 34595 34604 34606 34607 34608 34627 34654 34656 34657 34663 34669 34671 34672 34673 34674 34675 34676 34677 34726 34803 34805 34806 34813 34853 34857 34873 35191 35271 35331 35381 35407 35425 35440 35469 35484 35505 35523 35528 35703 35760 35765 35784 35790 35818 35874 36021 36023 36075 36112 36166 36174 36187 36202 36270 37053 37055 37057 37058 37059 37060 37061 37068 37078 37090 37103 37112 37117 37129 37130 37132 37297 37298 37299 37300 37301 37338 37348 37361 37366 37371 37388 37389 37390 37415 37425 37457 37494 37496 37499 37516 37517 37571 37817 37819 37820 37821 37822 37896 37919 37931 37979 37981 37982 37986 38060 38063 38089 38090 38091 38092 38093 38096 38097 38168 38207 38213 38220 38238 38239 38240 38241 38243 38279 38320 38336 38351 38352 38353 38354 38394 38422 38443 38456 38471 38797 38799 38800 38801 38802 38803 38804 38817 38827 38837 38842 38845 38858 38860 38862 38863 38864 38865 38881 38890 38900 38918 38920 38928 38930 38931 38932 38943 38954 38956 38957 38958 38959 38960 38961 38977 38985 38988 39025 39064 39070 39072 39076 39107 39107 39109 39140 39140 39140 39143 39201 39203 39232 39250 39250 39275 39275 39275 39291 39292 39292 39306 39308 39343 39345 39371 39371 39373 39390 39390 39411 39413 39455 39504 39529 39572 39644 39649 39701 39719 39754 39758 39792 39970 40004 40005 40006 40007 40008 40024 40043 40257 40257 40259 40286 40311 40355 40357 40400 40423 40446 40447 40448 40452 40507 40509 40573 40616 40750 40758 40958 40998 40999 41029 41063
/api/macroapi.h 78 81 82 85 86 89 90 91 101 102 106 111 112 117 120 121 125 128 131 134 138 142 159 164 166 167 168 170 173 174 175 175 179 179 180 180 181 186 187 190 191 192 193 195 196 197 198 199 202 209 210 213 214 215 220 221 223 227 228 234 234 236 240 241 242 243 243 285 286 286 287 289 295 325 339 340 340 343 345 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 378 380 385 386 387 388 469 471 475 476 492 493 495 496 497 498 507 508 509 510 511 512 515 516 517 518 518 519 520 521 521 523 530
/api/maputil.c 38 285 295 344 422 431 664 688 898 938 989 1183 1324 2073 2106 2260 2734
/api/maputil.h 131 148 149 199 237 257 383 392 436 445 562 637
/api/needleman.c 137
/api/objmgr.c 2906 3068 3068 3071 3114 3114 3152 3186 3330 3335 3336 3503 3504 3504 3574 3574 4541 4744 4754 4758 4764 4875 4947
/api/objmgr.h 164 341 384 666 666 669 670 670 731 731 747 747 750 761 769 1005 1135 1168 1169
/api/parsegb.h 73 73 76 77 78 78 80 81 82 83 93 93 96
/api/pgppop.c 95 171 171 171 173 179 203 203 205 315 315 318 348 436 436 439 470 551 552 559 572 1056 1110 1201 1201 1204 1214 1294 1297 1307 1370 1374 1422 1667 1704 1704 1705 1710 1715 1764 1767 1774 1784 1808 1808 1811 1818 1841 1923 1923 1924 1925 1929 1946 2114 2167 2229 2272 2275 2309 2379 2380 2381 2382 2389 2399 2399 2400 2400 2404 2405 2434 2617 2621 2627 2637 2664 2729 2749 2770 2770 2771 2815 2834 2850 2881 2882 2882 2901 2907 2924 2948 2952 2968 2974 3019 3020 3020 3066 3067 3277 3281 3289
/api/pgppop.h 129 130 132 141 142 252 252 252 254 256 256 269 273 273 274 275 276 276 279
/api/prtutil.c 87 87 96 122 129 190 205 205 218 428 441 861 871 1079 1094 1219 1221 1419 1422 1551 1577 1638 1648 1664 1672 1698 1724 1724 1726 1775 1824
/api/prtutil.h 88 89 90 90 126 150 151 169 170 176 177 178 180 192 193 194
/api/salpacc.c 844
/api/salpacc.h 121
/api/salpedit.c 2939 3850 3968
/api/salprop.c 73 75 76 136 189 200 506 525 649 716 746 1183
/api/salprop.h 50
/api/salsa.h 349
/api/salsap.c 1697 1713 1731 1740 1790 1800 1842 1856 3807 4180 4181 4182 4210 4264 4267 4270 4500 4569
/api/salsap.h 128
/api/salstruc.c 259 354 354 358 370 375 579 584 586 588 652 654 673 685 685 687 703 703 705 785 787 864 1080 1369 1487 1487 1491 1529 1529 1529 1546 1612 1717 2196 2198 2267 2275 2299 2302
/api/salstruc.h 76 82
/api/salutil.c 79 122 122 122 225 266 307 307 317 317 328 330 341 365 406 423 423 425 448 448 464 464 466 482 482 484 509 509 555 560 581 595 609 757 759 766 766 1016 1021 1057 1059 1063 1063 1066 1815 1866 3326 3356 3376 3378 3381
/api/salutil.h 58 59 59 59 66 67 69 69 70 70 71 72 73 74 75 75 76 76 77 77 78 78 79 79 80 82 94 118 120 188 189 262 263 264
/api/seqmgr.c 78 80 224 226 249 253 676 1109 1333 1334 2317 2319 2324 2749 2924 2929 5286 5291 5295 5298 5494 5762 5765 5967 5971 8487 9133 9150 9253 9261 9271 10476 10695 11567 12057 12059 12065 12080 12112 12241 12369
/api/seqmgr.h 97 101 263 564 638 695 725 745
/api/seqport.c 1127 1496 1546 1548 1552 1554 2034 2194 2204 2210 2221 2227 2229 2233 2326 2326 2332 2346 2352 2354 2358 2431 2436 2438 2446 2451 2452 2454 2651 2689 2699 3344 3556 3572 3863 3908 3978 4005 4007 4174 5913 5914 5922 5923 5937 5946 5956 5957 5974 5992 5997 6014 6029 6029 6051 6054 6114 6419 6428 6434 6483 6486 6667 6746 7065 7066 7073 7074 7165 7166 7198 7199 7207 7296 7455 7457 7516 7549 7550 7577 7578 7582 7590 7649 7650 7779 7785 7950 7951 7956 7957 8045 8046 8074 8075 8081 8169 8310 8347 8380 8381 8404 8405 8407 8415 8473 8474 8566 8572 8726 8730 8744 8748 8762 8765 8777 8777 8782 8805 8811 8817 8823 8823 8831 8831 8840 8851 8887 8978 8985 9024 9256
/api/seqport.h 181 265 388 562 648 683 683 705 706 749 749 765 766 806 810 812 816 820 824 829 831 836 841 846 847 851 883
/api/sequtil.c 266 273 1728 1729 1755 2005 2048 2051 2144 2147 2337 2344 2634 2634 2651 2651 2658 2741 2770 2778 2788 3171 3465 3467 3476 3485 3494 3523 3547 3551 3556 3567 3579 3598 3604 4217 4220 4320 7497 7520 8277 8280 8283 8296 8307 8312 8317 8318 8319 8321 8486 8497 8499 8525 8530 8586 8596 8599 8682 8682 8684 8685 8685 8804 8804 8806 8855 9237 9269 9300 9330 9387 9654 9881 9881 9881 9882 9963 9963 9972 9972 10193 10197 10227 10228 10229 10230 10231 10232 10239 10243 10246 10293 10315 10335 10356 10379 10417 10437 10483 11315 11345 11487
/api/sequtil.h 82 98 100 203 396 451 451 452 452 454 456 458 459 477 478 501 502 616 617 703 703 734 734 806 807 808 855 855 855 865 865 870 870 874 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889
/api/simple.c 77 244 312 333 385
/api/simple.h 93 96
/api/sqnutil1.c 210 334 392 398 404 416 435 549 607 612 647 651 1563 1564 1572 1573 1585 1586 1594 1595 1607 1608 1616 1617 1630 1631 1639 1640 1655 1656 1664 1665 1679 1688 1689 1698 1707 1708 1718 1721 1725 1730 1736 1749 1752 1756 1761 1767 1779 1782 1786 1791 1797 1934 1942 1945 1962 1988 2151 2177 2180 2181 2867 2898 2898 2901 2903 2904 2954 2955 2961 2964 3024 3024 3027 3029 3030 3084 3084 3108 3143 3154 3166 3177 3189 3205 3205 3209 3210 3211 3355 3422 3425 3456 3456 3459 3478 3479 3486 3598 3599 3609 3619 3649 3825 3842 3843 4044 4065 4069 4271 4272 4277 4293 4317 4394 4593 4619 4620 4621 4707 4745 4746 4747 4767 4793 4821 4833 4834 4837 4838 4839 4840 4905 4918 4919 4920 4946 4947 4953 4973 4974 4975 5031 5034 5058 5138 5144 5159 5199 5202 5203 5608 5609 5615 5616 5620 5621 5719 5736 5799 5799 5820 5821 5832 5833 5845 5846 5853 5854 5894 5896 5931 5981 5984 5985 5986 5987 5998 6025 6042 6051 6053 6054 6216 6217 6229 6230 6242 6243 6252 6253 6295 6295 6299 6300 6336 6336 6336 6340 6359 6383 6399 6401 6629 6674 6683 6689 6694 6695 6709 6710 6743 6750 6751 6753 6754 7074 7076 7205 7206 7207 7215 7255 7255 7258 7302 7304 7305 7313 7360 7362 7405 7422 7438 7454 7454 7492 7496 7518 7522 7528 7538 7556 7558 7560 7573 7626 7628 7630 7643 7691 7692 7703 7704 7734 7774 7777 7778 7930 7948 7949 8005 8006 8018 8019 8060 8071 8115 8228 8228 8266 8270 8287 8291 8316 8351 8445 8445 8450 8451 8475 8482 8486 8494 8683 8690 8700 8794 8795 8838 8842 8957 8958 9036 9344 9352 9412 9425 9459 9476 9552 9563 9564 9567 9696 9706 9709 9721 9739 9756 9835 9846 9862 9881 9904 9926 9931 9936 9955 9956 9957 9959 9965 9995 9996 9997 9999 10005 10071 10073 10075 10126 10130 10140 10170 10175 10178 10188 10193 10294 10317 10329 10386 10387 10393 10423 10428 10500 10502 10532 10533 10538 10617 10623 10628 10629 10630 10636 10781 10816 10847 10869 10903 10918 10942 10943 10944 10945 10946 10950 10977 11073 11124 11183 11200 11201 11210 11211 11290 11392 11393 11405 11406 11500 11506 11543 11566 11572 11573 11574 11583 11584 11585 11602 11640 11737 11737 11753 11753 11780 11783 11798 11803 12309 12332 12334 12336 12350 12377 12379 12382 12395 12403 12406 12420 12420 12447 12447 12450 12467 12474 12488 12571 12573 12576 12603 12661 12710 12716 12728 12762 12816 12829 12837 12845 12935 12935 12937 12938 12987 12991 12992 12993 13122 13178 13227 13228 13298 13309 13314 13509 13649 14175 14179 14425 14426 14427 14431 14553 14579 14580 14581 14582 14583 14590 14631 14634 14635 14642 14646 14668 14672 14674 14680 14683 14686 14687 14689 14691 14692 14693 14695 14697 14698 14764 14810 15072 15105 15106 15215 15334 15827 15827 15827 15859 15859 15866 15866 15873 15873 15873 15874 15874 15890 16149 16152 16162 16171 16175 16778 16798 17896 18165 18175 18176 18247 18248 18272 18279 18286 18293 18336 18342 18374 18375 18376 18377 18385 18386 18387 18388 18416 18422 18428 18434 18466 18467 18468 18469 18490 18496 18523 18524 18525 18530 18547 18548 18552 18564 18568 18590 18598
/api/sqnutil2.c 80 80 84 85 123 123 127 132 141 146 192 220 220 221 239 239 240 240 1069 1092 1100 1101 1106 1267 1367 1367 1369 1381 1381 1397 1436 1441 1485 1488 1580 1580 1580 1580 1628 1632 1634 1635 1636 1666 1666 1693 1725 1731 1763 1769 1769 1785 1802 1802 1818 1843 1860 1885 1904 1913 1953 1965 1967 2143 2149 2153 2168 2191 2233 2281 2317 2354 2355 2364 2415 2452 2453 2454 2455 2532 2579 2611 2616 2617 2618 2662 2663 2664 2665 2715 2751 2752 2753 2754 2804 2805 2807 2808 2859 2865 2866 2867 2904 2905 2909 2917 2922 2922 2926 2948 2974 2977 2996 3001 3001 3005 3028 3031 3047 3052 3052 3056 3079 3105 3106 3107 3112 3113 3114 3115 3116 3173 3191 3200 3201 3203 3271 3273 3278 3407 3424 3442 3460 3477 3479 3483 3597 3602 3676 3681 3694 3751 3755 3782 3783 3786 3880 4018 4018 4018 4022 4023 4106 4114 4207 4224 4233 4256 4257 4365 4365 4377 4476 4476 4528 4530 4599 4599 4603 4604 4605 4606 4607 4630 4644 4714 4723 4724 4726 4732 4733 4734 4917 4917 4959 4961 4975 4977 4977 4978 4982 4992 5011 5012 5089 5122 5136 5141 5164 5170 5195 5195 5220 5249 5262 5285 5355 5376 5383 5385 5496 5500 5511 5515 5547 5549 5565 5565 5575 5672 5697 5697 5742 5778 5778 5782 5802 5837 5837 5841 5860 5895 5895 5899 5920 5924 5947 5947 5950 5954 6009 6017 6034 6068 6076 6077 6160 6161 6162 6163 6226 6229 6231 6258 6279 6295 6303 6321 6321 6355 6358 6359 6948 6948 7100 7100 7104 7126 7132 7133 7134 7190 7190 7193 7212 7222 7229 7243 7243 7252 7262 7266 7277 7288 7289 7290 7666 7755 7755 7762 7762 7766 7777 7779 7784 7968 7968 7983 8094 8095 8096 8130 8139 8168 8169 8247 8370 8372 8387 8784 8803 9235 9443 9475 9554 10052 10549 10831 10868 10869 10870 10871 11704 11715 11885 11900 11901 11902 12100 12109 12193 12279 12453 12612 12622 12628 12634 12709 12787 12792 12809 12839 12957 12982 12999 13023 13158 13185 13652 14058 14059 14138 14141 14195 14215 14220 14272 14275 14294 14312 14315 14330 14351 14370 14379 14401 14422 14424 14426 14564 14567 14613 14628 14631 14637 14649 14651 14698 14701 14706 15109 15110 15778 15895 15909 16338 16340 16359 16370 16372 16383 16396 16409 16438 16440 16441 16442 16443 16444 16456 16471 16472 16473 16475 16481 16511 16516 16654 16656 16660 16669 16669 16669 16674 16753 16753 16753 16753 16755 16777 16795 16815 16815 16817 16819 16870 16899 16939 16940 16941 16943 16953 16963 16977 16979 17049 17167 17308 17348 17375 17402 17442 17463 17478 17530 17534 17564 17582 17586 17659 17662 17664 17704 17830 17885 17885 17901 17901 17905 17938 18003 18005 18037 18045 18047 18051 18053 18075 18085 18108 18123 18141 18166 18171 18261 18300 18313 18313 18333 18333 18335 18367 18367 18369 18379 18388 18388 18390 18400 18409 18411 18421 18452 18457 18458 18511 18544 18545 18546 18583 18602 18608 18609 18610 18620 18622 18663 19021 19074 19312 19313 19328 19328 19341 19341 19354 19357 19358 19378 19384 19392 19403 19430 19438 19454 19476 19480 19509 19528 19532 19541 19550 19555 19561 19574 19579 19585 19600 19619 19683 19752 19758 19788 19788 19803 19803 19818 19821 19863 19944 20110 20188 20207 20207 20327 20330 20443 20448 20452 20527 20702 21508 21545 21690 21793 21835 21850 21966 22265 22275 22285 22286 22317 22320 22337 22358 22378 22444 22489 22612 22618 22637 22648 22704 22709 22740 22759 22800 22863 22866 22942 22945 23514 23714 23743 23821 24069 24124 24127 24156 24236 24265 24269 24274 24278 24280 24295 24332 24361 24363 24378 24380 24743 24743 24743 24745 24748 24749 24777 24777 24801 24801 24801 24803 24830 24830 24852 25072 25076 25077 25078 25079 25080 25081 25093 25392 25392 25395 25404 25417 25428 25440 25442 25443 25452 25553 25568 25583 25598 25615 25616 25647 25648 25679 25704 25720 25828 25838 25839 25870 25881 25920 25920 25927 25928 25933 25934 25987 26002 26031 26033 26034 26183 26202 26784 26784 26784 26790 26882 26942 26942 26945 27034 27140 27158 27271 27285 27315 27331
/api/sqnutil3.c 926 927 1278 1392 1393 1553 1679 1688 1718 1718 1936 1941 2004 2030 2274 2379 2405 2513 2516 2543 2546 2585 2588 2594 2621 2633 2675 2679 2796 2796 2800 2801 2822 2830 2893 2931 3127 3167 3526 3560 3587 3591 3592 3595 3712 3830 3837 3838 3844 3850 3854 3859 3884 3999 4072 4146 4205 4423 4423 4425 4427 4430 4460 4509 4589 4591 4592 4624 4637 4639 4658 4660 4662 4672 4676 4701 4705 4706 4708 4724 4803 5505 5513 5530 5555 5578 5590 5669 5686 5694 5971 5975 5976 5982 5988 6014 6204 6243 6244 6330 6374 6398 6423 6425 6502 6503 6512 6528 6543 6553 6555 6620 6622 6640 6666 6671 6687 6712 6717 6733 6755 6762 6937 6979 7051 7052 7061 7141 7147 7176 7270 7318 7319 7389 7389 7435 7519 7543 7597 7657 7708 7760 7760 7920 7922 7935 7937 8009 8016 8067 8089 8090 8096 8101 8101 8128 8144 8154 8173 8221 8224 8251 8254 8330 8371 8428 8470 8504 8539 8576 8578 8581 8616 8617 8635 8687 8728 8743 8756 8918 8919 8924 8924 8929 9142 9156 9268 9347 9705 9706 9707 9708 9709 9776 9776 9778 9886 9887 9935 9936 9937 10057 10220 10310 10311 10312 10399 10412 10424 10437 10439 10450 10474 10477 10492 10493 10509 10509 10509 10512 10534 10535 10564 10575 10583 10584 10601 10613 10682 10953 10961 10999 11018 11411 11413 11433 11438 11533 11552 11569 11594 11625 11683 11684 11687 11735 11757 11778 11795 11817 11831 11889 11903 11956 11970 12002 12173 12174 12206 12222 12286 12304 12318 12325 12379 12384 12386 12392 12395 12395 12453 12563 12564 12585 12647 12715 12864 12865 12866 12867 13019 13029 13127 13142 13160 13225 13240 13287 13302 13393 13396 13398 13399 13400 13401 13435 13440 13445 13454 13460 13470 13473 13514 13517 13552 13565 13587 13588 13589 13604 13626 13871 13871 13873 13909 13909 13910 13910 13910 13926 13956 13959 13964 13964 13979 13979 13994 14003 14003 14016 14016 14022 14022 14028 14028 14045 14045 14057 14057 14075 14075 14087 14087 14097 14097 14107 14107 14117 14125 14125 14144 14144 14154 14154 14160 14160 14166 14166 14172 14172 14195 14195 14197 14217 14217 14223 14223 14236 14242 14242 14244 14269 14269 14282 14282 14282 14288 14288 14288 14294 14294 14294 14306 14306 14306 14319 14319 14319 14322 14336 14346 14346 14346 14349 14363 14374 14374 14374 14383 14383 14383 14385 14409 14409 14409 14424 14424 14424 14435 14465 14465 14467 14468 14469 14470 14471 14477 14480 14487 14490 14493 14993 14998 14999 15019 15039 15048 15141 15141 15144 15145 15146 15163 15174 15174 15180 15180 15183 15194 15205 15205 15208 15219 15321 15322 15376 15506 15508 15573 15590 15590 15594 15628 15650 15661 15669 15742 15745 15766 15785 15947 15949 15973 16029 16095 16222 16222 16226 16248 16263 16297 16297 16300 16307 16314 16317 16323 16339 16344 16392 16393 16424 16428 16468 16469 16470 16485 16508 16569 16617 16662 16665 16684 16880 16903 16904 16905 16962 16997 17107 17110 17199 17231 17234 17276 17278 17285 17308 17309 17338 17395 17396 17397 17398 17399 17400 17555 17673 17709 17716 17861 17867 17889 18000 18001 18044 18089 18090 18091 18092 18093 18094 18095 18096 18097 18098 18143 18150 18218 18219 18220 18237 18246 18272 18281 18738 18739 18780 18792 19064 19120 19124 19157 19160 19163 19164 19165 19179 19195 19202 19212 19279 19307 19322 19370 19372 19372 19416 19417 19419 19419 19423 19537 19579 19580 19585 19585 19604 19849 19875 19876 19880 19881 19882 19884 19893 19908 19909 20026 20027 20042 20051 20164 20165 20167 20167 20169 20302 20628 20860 20889 20945 20989 21242 21244 21253 21271 21272 21273 21288 21407 21407 21448 21454 21455 21456 21482 21495 21508 21522 21666 21675 21676 21677 21678 21764 21784 21792 21884 21890 21891 21900 21902 21920 21929 21967 21984 21986 22044 22045 22143 22175 22407 22408 22497 22500 22526 22529 22657 22848 22903 22943 23096 23148 23148 23150 23151 23154 23166 23170 23209 23237 23273 23290 23292 23341 23343 23456 23537 23543 23549 23587 23591 23780 23909 23919 23956 24019 24333 24334 24674 24732 24739 24814 24865 24912 24921 24924 24934 24997 25001 25028 25030 25048 25262 25343 25386 25403 25453 25475 25559 25857 25857 26173 26174 26177 26180 26219 26269 26269 26272 26276 26276 26285 26285 26295 26295 26297 26358 26422 26452 26546 26579 26582 26583 26600 26600 26601 26607 26611 26611 26612 26639 26648 26716 26820 27016 27017 27062 27063 27064 27094 27094 27133 27134 27161 27233 27240 27412 27413 27414 27420 27421 27422 27430 27434 27438 27446 27446 27448 27450 27451 27452 27453 27454 27461 27466 27470 27477 27481 27499 27520 27523 27524 27525 27526 27527 27528 27529 27543 27549 27554 27597 27617 27620 27621 27629 27642 27644 27645 27670 27675 27771 27792 27839 27862 27916 27919 27974 27977 28129 28142 28151 28218 28220 28668 28805 28806 28964 29008 29032 29034 29081 29116 29147 29172 29175 29389 29473 29506 29601 29604 29629 29659 29661 29694 29742 29763 29879 29926 29962 30011 30111 30112 30577 30664 30669 30674 30942 30970 30983 30986 31027 31029 31044 31044 31046 31050 31051 31053 31054 31055 31056 31057 31108 31119 31144 31150 31155 31160 31166 31171 31183 31198 31220 31220 31221 31223 31231 31236 31253 31267 31273 31274 31276 31277 31287 31300 31309 31314 31316 31356 31356 31359 31433 31487 31488 31492 31492 31524 31600 31613 31616 31673 31768 31804 31845 31845 31847 31849 31873 31910 31911 31912 31968 31968 31999 32073 32093 32094 32111 32166 32207 32280 32291 32300 32352 32352 32354 32357 32378 32451 32452 32495 32499 32579 32580 32581 32582 32583 32584 32585 32586 32587 32616 32632 32651 32702 32707 32719 32759 32841 32843 32846 32868 32927 32964 32998 33123 33207 33208 33228 33235 33405 33419 33421 33432 33677 33994 33994 34010 34010 34026 34026 34041 34072 34076 34097 34097 34101 34122 34144 34144 34144 34144 34149 34150 34249 34255 34321 34328 34336 34355 34362 34370 34443 34447 34517 34567 34567 34570 34586 34594 34601 34609 34614 34621 34684 34685 34693 34704 34719 34819 34852 34856 34889 34893 34912 34934 34938 34962 35176 35188 35369 35400 35425 35446 35461 35465 35484 35505 35521 35521 35546 35554 35665 35668 35702 35727 35755 35778 35846 35899 35901 35973 35975 35999 36005 36089 36096 36189 36189 36235 36235 36237 36329 36329 36329 36332 36351 36391 36391 36393 36412 36412 36416 36417 36418 36419 36422 36423 36426 36427 36796 36807 36856 36890 36892 36897 36907 36911 37037 37037 37037 37037 37039 37418 37418 37421 37437 37437 37440 37453 37453 37455 37457 37486 37492 37508 37508 37508 37510 37511 37513 37557 37652 37652 37652 37654 37663 37671 37673 37709 37710 37711 37739 37828 37923 37927 37940 38057 38108 38349 38356 38363 38367 38371 38380 38384 38392 38396 38414 38421 38657 38690 38690 38715 38730 38733 38755 38770 38777 38796 38828 38839 38839 38883 38892 38977 38979 39069 39165 39194 39198 39199 39200 39201 39202 39204 39236 39240 39255 39269 39354 39357 39372 39372 39372 39372 39506 39506 39509 39528 39528 39531
/api/sqnutil4.c 113 117 118 119 129 139 190 202 203 204 211 212 255 273 277 281 395 782 1833 2059 2062 2101 2115 2115 2117 2189 2194 2195 2231 2235 2236 2316 2320 2364 2366 2614 2629 2630 2632 2636 3131 3149 3153 3154 3195 3196 3295 3299 3306 3346 3410 3413 3414 3461 3497 3522 3526 3607 3607 3652 3757 3843 3865 3891 3938 4000 4001 4033 4034 4048 4048 4050 4114 4114 4116 4134 4134 4154 4157 4159 4179 4259 4265 4276 4279 4322 4327 4345 4364 4387 4387 4432 4435 4553 4592 4660 4682 4687 4688 4692 4695 4719 4721 4804 4808 4810 4926 4926 4928 4929 4941 5888 5889 5991 6104 6203 6229 6335 6340 6341 6345 6495 6501 6502 6504 6542 6649 6656 6677 6739 6840 6846 6850 6923 7142 7143 7144 7153 7255 7263 7268 7270 7302 7304 7322 7329 7459 7553 7573 7583 7586 7587 7620 7653 7681 7688 7713 7727 7734 7742 7750 7779 8126 8216 8218 8318 8345 8361 8470 8489 8527 8574 8582 8907 9093 9340 9402 9429 9902 9952 10059 10060 10148 10178 10290 10347 10674 10764 10936 10938 10942 10944 11039 11040 11060 11062 11075 11090 11220 11494 11494 11496 11542 11547 11564 11588 11609 11613 11624 11628 11633 11638 12014 12014 12017 12017 12020 12021 12022 12023 12025 12026 12037 12043 12072 12072 12091 12091 12091 12091 12091 12091 12127 12127 12127 12127 12146 12146 12146 12167 12167 12167 12174 12174 12181 12181 12181 12181 12181 12205 12205 12205 12205 12239 12239 12245 12252 12252 12252 12274 12274 12277 12278 12331 12331 12348 12373 12376 12384 12393 12395 12396 12433 12451 12574 12574 12577 12611 12612 12613 12614 12624 12625 12673 12700 12704 12715 12731 12773 12775 12777 12816 12843 13013 13017 13029 13061 13092 13166 13167 13168 13169 13170 13171 13172 13173 13174 13175 13176 13177 13178 13179 13180 13181 13182 13183 13184 13185 13186 13187 13188 13189 13190 13191 13192 13193 13194 13195 13196 13197 13198 13199 13200 13201 13202 13203 13204 13207 13208 13209 13211 13212 13213 13214 13215 13216 13218 13219 13220 13234 13248 13261 13412 13415 13423 13423 13436 13519 13520 13722 13734 13744 13756 13769 13779 13790 13797 14059 14240 14404 14427 14445 14487 15062 15063 15064 15195 15213 15241 15245 15268 15272 15284 15297 15301 15319 15332 15332 15334 15336 15352 15388 15423 15434 15455 15458 15463 15464 15507 15517 15593 15602 15629 15633 15652 15653 15661 15689 15713 15730 15733 15770 15985 16128 16194 16264 16266 16268 16269 16332 16355 16510 17595 17596 17597 17599 17788 17828 17842 17849 17876 17889 17904 17904 17952 18018 18078 18120 18120 18122 18124 18125 18127 18128 18342 18365 18367 18368 18395 18395 18397 18399 18400 18402 18403 18532 19306 19342 19408 19442 19471 19534 19767 19770 19776 19778 19822 19826 19827 19852 19855 19917 19937 19957 19985 20013 20052 20062 20066 20089 20092 20152 20178 20181 20224 20243 20249 20272 20276 20321 20323 20339 20398 20398 20426 20446 20450 20496 20510 20514 20574 20587 20588 24290 24291 27710 27778 27780 27792 27794 27855 27891 27946 27972 27973 28003 28022 28023 28173 28197 28220 28331 28368 28629 28846 28851 28865 28876 28883 28887 28899 28901 29000 29016 29063 29071 29175
/api/sqnutils.h 79 80 96 97 98 105 125 126 128 128 129 130 130 131 131 223 224 226 227 301 303 304 308 311 311 312 313 313 315 316 318 318 319 320 321 322 328 364 383 384 407 419 420 421 443 447 448 449 450 451 451 452 453 455 504 510 511 529 533 563 574 591 591 683 683 687 687 688 688 765 773 774 775 776 782 783 784 785 893 928 937 950 961 978 978 980 997 997 1013 1022 1026 1039 1059 1065 1317 1318 1319 1334 1336 1338 1338 1348 1349 1349 1352 1354 1360 1361 1403 1408 1411 1412 1414 1420 1421 1426 1430 1432 1439 1440 1441 1442 1443 1444 1445 1446 1447 1448 1449 1451 1452 1504 1505 1508 1509 1510 1538 1540 1558 1559 1564 1581 1590 1597 1597 1618 1620 1620 1621 1621 1621 1627 1634 1635 1635 1636 1640 1640 1640 1642 1644 1645 1646 1657 1665 1666 1669 1670 1672 1673 1674 1676 1731 1731 1742 1748 1748 1769 1806 1809 1848 1858 1902 1920 1922 2011 2016 2017 2018 2023 2038 2039 2046 2048 2049 2053 2057 2063 2063 2090 2091 2092 2092 2095 2096 2120 2126 2126 2127 2127 2128 2129 2130 2130 2131 2132 2136 2136 2137 2141 2183 2183 2209 2226 2226 2227 2227 2228 2230 2231 2235 2241 2242 2242 2243 2245 2254 2267 2272 2273 2284 2299 2308 2314 2314 2316 2324 2339 2360 2361 2371 2382 2389 2401 2408 2417 2417 2441 2443 2444 2445 2448 2449 2460 2469 2470 2481 2491 2496 2497 2498 2499 2505 2505 2506 2506 2531 2532 2533
/api/subutil.c 68 69 70 78 80 80 93 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 216 229 230 231 232 233 303 328 377 447 448 449 463 622 623 624 675 676 677 847 848 849 907 908 909 1155 1339 1340 1341 1425 1426 1427 1522 1523 1524 1615 1619 1637 1641 1652 1658 1685 1691 1725 1764 1809 1827 1849 1926 1947 1953 2036 2046 2053 2063 2070 2071 2072 2073 2074 2075 2076 2114 2115 2116 2117 2118 2119 2120 2121 2195 2196 2197 2198 2199 2200 2201 2202 2256 2257 2258 2261 2297 2298 2299 2300 2301 2373 2409 2653 2673 2674 2675 2676 2677 2739 2740 2741 2742 2743 2815 2816 2817 2818 2819 2820 2821 2962 2993 3198 3198 3255 3354 3423 3427 3483 3484 3485 3550 3551 3552 3601 3602 3603 3608 3723 3763 3764 3765 3766 3768 3769 3770 3771 3772 3817 3818 3819 3820 3821 3822 3823 3824 3825 3826 3832 3889 3925 3948 3949 4008 4104 4185 4261 4305 4349 4393 4394 4395 4554 4555 4630 4685 4686 4687 4689 4690 4816 4817 4855 4906 4915 4931 4975 5018 5019 5079 5126 5272 5301 5302 5327 5328 5384 5448 5449 5453 5489 5489 5503 5513 5524 5534 5544 5569 5570 5604 5990 5991
/api/subutil.h 129 135 148 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 179 186 187 188 189 190 207 211 219 292 293 294 306 307 308 319 320 321 337 365 366 367 379 380 381 392 393 394 406 407 408 482 487 494 499 511 516 532 537 538 539 540 541 542 543 544 560 561 562 563 564 565 566 567 587 588 589 590 591 592 593 598 599 600 601 602 759 874 1077 1088 1089 1090 1091 1092 1123 1124 1125 1126 1127 1150 1151 1152 1153 1154 1155 1156 1172 1219 1248 1303 1324 1328 1341 1342 1343 1351 1352 1353 1382 1390 1391 1392 1393 1395 1396 1397 1398 1399 1404 1405 1406 1407 1408 1409 1410 1411 1412 1413 1418 1428 1433 1434 1441 1443 1456 1466 1468 1469 1470 1471 1472 1473 1479 1480 1486 1494 1495 1496 1498 1499 1504 1505 1509 1510 1516 1523 1529 1551 1557 1558 1563 1564 1577 1589 1590 1596 1602 1608 1614 1620 1631 1632 1637 1697 1698
/api/tofasta.c 307 340 471 617 628 754 880 885 922 926 958 969 972 1073 1096 1097 1101 1456 1477 1479 1632 1665 1702 1718 1729 1730 1779 1791 1806 1937 1967 2134 2135 2191 2193 2195 2196 2204 2206 2208 2214 2218 2219 2225 2229 2230 2238 2241 2247 2249 2251 2252 2266 2267 2269 2278 2279 2281 2283 2302 2320 2322 2347 2347 2362 2365 2400 2429 2444 2457 2458 2462 2479 2483 2484 2500 2504 2505 2512 2516 2542 2679 2730 2760 2762 2764 2765 2775 2777 2840 2864 2876 2887 2983 2985 2987 2988 3001 3003 3005 3018 3025 3046 3049 3069 3104 3106 3133 3134 3134 3138 3144 3171 3725 3753 3756 3776 3780 3782 3787 3790 3831 3839 3844 3849 3851 3910 3918 3918 3922 3923 3947 3947 3951 3952 3976 3984 4012 4014 4017 4023 4024 4077 4117 4119 4122 4159 4161 4164 4181 4181 4184 4210 4226 4231 4232 4237 4238 4240 4242 4248 4249 4252 4253 4254 4288 4291 4303 4321 4348 4375 4375 4385 4404 4412 4416 4420 4427 4433 4446 4459 4501 4526 4551 4577 4580 4582 4602 4604 4605 4611 4673 4771 4781 4782 4783 4834 4835 4835 4838 4846 4848 4861 4869 4875 4982 4984 4986 4988 4990 4999 5113 5389 5390 5390 5394 5395 5395 5444 5448 5541 5678 5766 5807 5880 5882 5883 5912 5915 5921 5923 5924 5928 5929 5931 5932 5933 5936 5937 5938 5939 5942 5946 5964 5987 5995 6123 6317 6329 6357 6390 6431 6588 6589 6595 6596 6618 6619 6624 6625 6649 6650 6655 6656 6680 6686 6687 6688 6698 6708 6721 6730 6731 6758 6770 6776 6777 6823 6828 6918 6922 6945 6950 6951 6952 7118 7156 7161 7183 7189 7231 7243 7250 7311 7321 7338 7345 7363 7368 7510 7552 7578 7587 7592 7594 7596 7599 7601 7602 7607 7609 7610 7611 7644 7655 7711 7738 7766 7800 7880 7893 7903 7916 7929 7949 7957 7958 7963 7965 7966 7967 7968 7969 7970 7997 8031 8070 8074 8080 8088 8093 8185 8191 8248 8250 8254 8325 8327 8333 8480 8494 8505 8523 8525 8570 8575 8667 8718 8730 8744 8750
/api/tofasta.h 69 85 92 93 219 230 243 254 267 278 312 313 325 338 368 369 371 371 372 374 374 375 376 379 382 384 393 394 395 396 411 422 423 427 442 444 446 461 461 461 463 464 464 465 466 466 467 468 468 476 485 493 503 531 542 577
/api/tofile.c 87 100 104 105 126 226 330 335 339 390 480 493 510
/api/tofile.h 93
/api/tomedlin.c 169 170 175 176 176 177 177 188 202 203 204 205 211 212 213 254 261 266 271 272 275 281 282 284 285 286 287 314 348 419 618 708 709 712 712 718 719 727 730 741 744 750 755 759 759 763 765 767 768 769 770 844 844 857 858 859 860 866 867 868 914 917 921 922 924 997 1002 1031 1036 1040 1041 1041 1043 1044 1044 1072 1072 1073 1073 1076 1076 1077 1077 1087 1087 1088 1088 1096 1096 1182 1184 1231 1550
/api/tomedlin.h 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159
/api/txalign.c 92 100 112 112 113 115 305 305 306 307 307 307 722 722 957 957 1046 1047 1084 1084 1088 1094 1095 1134 1164 1165 1386 1386 1390 1396 1397 1714 1721 1731 1790 2101 2107 2131 2138 2141 2142 2149 2163 2170 2677 2680 2758 2957 2957 2968 2969 2972 2974 2994 3015 3015 3017 3018 3023 3031 3160 3330 3344 3370 3389 3397 3598 3598 3602 3613 3780 3780 3785 3786 3786 3806 3808 3822 3844 3844 3844 3844 3849 3981 3986 4074 4078 4123 4123 4182 4182 4182 4697 4701 4702 4704 4716 4716 4736 4737 4915 4916 4924 5143 5144 5158 5262 6057 6058 6131 6131 6244
/api/txalign.h 312 313 314 328 329 331 377 399 400 401 486 487 500 501 548 549 594 595 606 607 608 617 617 663 663 675 681 705 706 708 708
/api/udvseq.c 130 147 165 206 238 268 301 1333 1339 1376
/api/udvseq.h 238 250 294 296
/api/utilpars.c 108 151 151 153 171 190 190 212
/api/utilpars.h 47 47 53 56 57 62
/api/utilpub.c 888 888 890 1056 1707 1707 1710
/api/utilpub.h 79 79
/api/valapi.c 153 155 213 235 259 259 280 321 361 377 463 463 463 470 488 774 786 816 886 1017 1020
/api/valapi.h 54 81
/api/valid.c 106 108 108 110 157 510 512 558 562 569 648 755 779 813 1024 1050 1074 1080 1116 1126 1132 1548 1549 1599 1600 1909 2186 2201 2248 2260 2269 2270 2271 2285 2341 2355 2359 2360 2397 2426 2429 2595 2609 2814 3282 3319 3325 3456 3536 3539 3543 3548 3554 3570 3573 3602 3769 3856 3929 3942 4017 4143 4146 4148 4149 4208 4274 4298 4447 4465 4465 4494 4495 4496 4497 4498 4678 5319 5688 5927 6047 6214 6327 6356 6389 6391 6399 6726 6732 6797 6800 6813 6817 6832 6939 6955 7011 7104 7203 7219 7223 7277 7280 7282 7363 7367 7387 7542 7880 7952 7953 7956 7966 8009 8031 8453 8558 8562 8571 8632 9245 9336 9476 9512 9517 9568 9620 9691 9815 9837 9841 9848 9856 9856 9859 9897 9928 9939 9961 9968 9978 9998 10002 10069 10123 10140 10165 10168 10332 10350 10672 10726 10738 10912 11145 11429 11446 11449 11452 11455 11459 11462 11523 11523 11526 11556 11596 11613 11618 11651 11652 11653 11841 11843 11845 11851 11872 11873 11874 11899 11900 11904 11908 12152 12153 12159 12182 12202 12237 12256 12265 12328 12329 12334 12346 12387 12405 12416 12433 12434 12476 12477 12519 12520 12535 12548 12562 12571 12609 12610 12635 12636 12650 12651 12659 12660 12861 12877 12896 12897 12975 12976 12993 13012 13030 13127 13129 13133 13137 13141 13149 13212 13217 13270 13290 13295 13308 13315 13456 13472 13477 13529 13628 13632 13634 13635 13647 13670 13672 13702 13704 13742 13754 13760 13762 13763 13821 13821 13824 13838 13838 13842 13875 13910 13939 13945 13965 14079 14083 14143 14157 14161 14217 14230 14233 14248 14249 14250 14254 14255 14284 14288 14357 14388 14455 14464 14506 14525 14552 14564 14637 14674 14675 14676 14677 14678 14679 14680 14681 14682 14691 14692 14803 14804 14805 14877 14878 14879 14880 14884 14885 14888 14889 14890 14891 14892 14948 14949 14950 14951 14954 15003 15004 15005 15036 15037 15119 15120 15147 15148 15149 15153 15176 15177 15182 15188 15193 15439 15439 15443 15459 15459 15461 15483 15487 15488 15513 15514 15545 15546 15551 15556 16571 16578 16602 16607 16646 16650 16683 16687 16709 16713 16735 16739 16765 16778 16782 16796 16803 16817 16825 16839 16847 16883 16894 17163 17193 17199 17209 17389 17391 17690 17690 17734 17835 17866 17871 17872 17873 17894 18060 18102 18169 18665 18982 19081 19190 19204 19257 19320 19393 19394 19407 19409 19423 19452 19586 21211 21322 21322 21325 21343 21375 21403 21403 21403 21405 21424 21477 21493 21520 21621 21621 21695 21696 22214 22313 22329 22382 22401 22414 22427 22479 22487 22566 22574 22680 22680 22680 22689 22691 22699 22777 22783 22789 22795 22798 22804 22836 22842 22862 22868 22894 22895 22907 22923 22923 22934 22936 22944 23036 23068 23076 23086 23138 23171 23173 23175 23186 23258 23279 23290 23359 23362 23388 23409 23416 23545 23547 23575 23674 23693 23759 23833 23844 23853 23855 24357 24382 24386 24392 24393 24899 24902 24910 24964 24992 25000 25051 25052 25057 25060 25082 25084 25085 25099 25101 25103 25126 25185 25190 25274 25288 25289 25297 25305 25307 25487 25941 25943 26019 26088 26112 26138 26162 26168 26169 26719 26747 26785 26964 27000 27036 27037 27054 27055 27056 27162 27193 27200 27203 27217 27337 27354 27378 27407 27577 27577 27601 27618 27635 27728 27742 27746 27787 27834 27911 27932 27951 28001 28028 28029 28148 28151 28172 28173 28261 28268 28300 28309 28313 28318 28319 28684 28694 28708 28747 28964 28985 28990 29086 29124 29140 29153 29731 29749 29761 29763 30024 30028 30103 30110 30123 30154 30220 30318 30441 30471 30575 31754 31761 32228 32716 32716 32734 32734 32737 32738 32774 32774 32777 32901 32940 32997 33014 33046 33068 33118 33119 33120 33121 33122 33123 33124 33125 33126
/api/valid.h 92 93 94 95 96 97 98 99 100 125 208 210 211 212 214 215 216 217 218 220 221 222 223 223 225 228 229 230 240 243 247 252 257 261 266 272 280 287 295 296 299 300 306 306 306 307 309 310 312 313 320 320 331 332 334
/api/wprint.c 61 62 169 171 330 333 339 352 355 371 388 391 407 425 428 433 446 449 457 472 477 490 493 499 511 515 521 540 543 580 599 602 619 635 638 646 658 661 667 679 683 695 696 703 720 721 739 740 758 759 777 779 816 817 835 836 854 855 873 874 892 893 911 912 930 931 949 950 973 974 988 989 1007 1020 1033 1034 1052 1053 1071 1072 1090 1091 1112 1113 1131 1132 1145 1158 1159 1177 1178 1196 1197 1215 1216 1234 1235 1253 1254 1275 1279 1289 1290 1297 1314 1316 1333 1334 1355 1358 1361 1379 1395 1398 1401 1423 1426 1443 1445 1471 1481 1513 1560 1563 1566 1595 1626 1626 1629 1651 1725 1806 1825 1883 1898 1980 1982 1992 2007 2011 2067 2089 2090 2110
/asnlib/asn.h 102 113 128 133 134 187 189 194 215 226 336 339 347 348 350 353 357 357 359 362 362 363 383 383 384 384 401 403 409 412 413 416 418 419 486 487 488
/asnlib/asnbufo.c 71 74 102 106 154 158 200 281 300 347
/asnlib/asncode.c 73 87 88 89 114 194 247 269 269 286 287 288 289 290 291 306 307 309 326 327 335 339 340 446 447 566 567 567 569 572 573 574 574 576 793 794 796 830 946 947 948 1306 1516 1517 1830 2051 2472 2473 3044 3047 3141 3144 3145 3146 3328 3330 3331 3479 3533 3534 3536 3539 3586 3596 3624 3625 3722 3723 3853 3853 3885 3886 3888 3889 3890 3891 3892 3893 3894 4062 4076 4305 4306 4311 4312 4315 4316 4317 4318 4323
/asnlib/asndebin.c 547 1036 1041 1042 1047 1093 1099 1143
/asnlib/asndebin.h 96
/asnlib/asnenbin.c 52 118 122 466 482 487 652
/asnlib/asnenbin.h 89
/asnlib/asngen.c 401 484 536
/asnlib/asnio.c 68 68 120 121 123 125 137 153 173 185 191 198 468 496 500 518 522 522 539 566 651 699 712 962 962 984 987 988 989 1028 1053 1093 1142 1192 1241 1260 1291 1346 1361 1382 1448 1510 1537
/asnlib/asnio.h 69
/asnlib/asnlex.c 61 642 676 962 964 966 1049 1299 1299 1322 1324
/asnlib/asnlex.h 102 107 107
/asnlib/asnlext.c 61 591 728 987 1001 1001 1004 1025 1031
/asnlib/asnout.c 84 109 123 546 546 549
/asnlib/asnout.h 109 116 116
/asnlib/asnprint.c 61 61 63 79 79 79 81 92 92 116 130 245 304 447 459 531 578 590 1072 1112 1131 1143 1198 1501 1503 1641 1647 1676 1682 1713 1716 1843 1879 1911 1911 1915 2027 2043 2068 2070 2092 2095 2140 2236 2248 2330 2564 2568
/asnlib/asnprint.h 100 112 114 115
/asnlib/asntool.c 177 192 322
/asnlib/asntool.h 67 69 74 75 76
/asnlib/asntypes.c 128 147 489 495 551 586 589 708 708 911 1126 1138 1227 1236 1270 1356 1356 1375
/asnlib/asntypes.h 172
/biostruc/PubStructAsn.h 93 94 95
/biostruc/bsannotvs.c 71 82
/biostruc/cblast/cblast.c 110 117 122 584 753 1092 1093
/biostruc/cblast/cblast.h 99 109 125 127 136 144 145 150 155 165 166
/biostruc/cblast/cblastgraph.c 63 266 521 574 752
/biostruc/cblast/cblastutil.c 133 136 1030 1030 1189 1439 1531 1564 1583
/biostruc/cdd/cddposutil.c 158 1237 1368 1393 1401 1677 1984 1986 2187
/biostruc/cdd/cddposutil.h 98 100 140
/biostruc/cdd/cddutil.c 376 393 408 423 443 460 490 493 496 509 522 555 555 668 676 726 733 740 752 839 847 979 979 979 980 1205 1207 1228 1236 2375 2416 2577 2616 3838 4302 4479 4545 4723 4738 4765 4789 5637 5637 5639 5778 5779 5780 5811 5816 5848 5927 5962 5966 5967 5978 5996 5996 6011 6011 6031 6044 6103
/biostruc/cdd/cddutil.h 264 273 425 426 427 428 430 431 438 443 446 447 452 459 459 459 459 462 463 464 472 473 507 534 542 649 649 657 659 660 660 661 661
/biostruc/cdd/objcdd.h 68 129 195 217 284 285 287 323 339 340 510 569 617 681 682 741 742
/biostruc/cn3d/objcn3d.h 199 338 339
/biostruc/corematx.c 374 379 384 389 399 404 409 414 415 421 422 429 430 436 437 526 533 541 549 601 602 603
/biostruc/mkbioseq.h 58 66 68 70 70 73 76 77
/biostruc/mkbioseqA.c 60 141 236 258 260 306 333 333 338 365 423 472 545 581 587 684
/biostruc/mkbioseqB.c 55 96 125 175 175 177 193 193 212 316 379
/biostruc/mkbioseq_vs.c 126 157 225
/biostruc/mmdbFF.c 79 97 97 100 102 167 273
/biostruc/mmdb_pubstruct.c 81 94 210
/biostruc/mmdbapi.c 140 178 365
/biostruc/mmdbapi.h 253 256 276
/biostruc/mmdbapi1.c 1185 1191 1237 1924 1925 1948 1967 2231 2248 2831 2850 2851 2862 2986 3001 3187 3416 3863 4039 4162 4175 4213 4444 4538 4554 4564 4574 4627 4768 4777 4782
/biostruc/mmdbapi1.h 575 588 621 630 632 633 634 690 695 696 734 735 737 738 739 740 777 971 972 1054 1057 1061 1076 1079 1082 1091 1094 1094 1114
/biostruc/mmdbapi2.c 175 176 177 178 182 210 239 268 298 1283 1307 1316 1325 1385 1546 1561 1563 1588 1943 1949 1959
/biostruc/mmdbapi2.h 173 175 176 177 180 190 192 193 209
/biostruc/mmdbapi3.c 217 218 219 220 247 392 393 394 395 396 397 398 435 464 637 646 662 682 1057 1058 1059 1060 1061 1062 1416 1439 1486 1530 1584 1717 1719 1748 1751 1757 1758 1759 1760 1765 1840 1842 1858 1894 1928 1941 1942 1943 1944 1945 1946 1972 1987 2235 2287 2385 2394 2396 2604 2606 2624 2647 2648 2903 2915 2916 2917 3159 3175 3333 3380 3386 3387 3388 3459 3461 3470
/biostruc/mmdbapi3.h 129 141 142 155 157 159 161
/biostruc/mmdbapi4.c 471 536 781 860 1154 1159 1186 1191 1246 1248 1482 1637 1653 1700 1749
/biostruc/mmdbapi4.h 112 113 114 118 119 121 122 124
/biostruc/mmdbdata.h 78 79
/biostruc/mmdbdumy.c 63
/biostruc/mmdbentr.c 109 163
/biostruc/mmdblocl.c 149 167 167 171 173 290 317
/biostruc/mmdblocl.h 79 83
/biostruc/mmdbsrv.c 396 401 436 490 493 512 514 515 545 545 572 572 581 582 583 590 680 688 980 980 985 1149 1175 1389 1573 1583 1584
/biostruc/newVSch/vast2cn3dDB_comb.cpp 90 213
/biostruc/newVSch/vastuti.cpp 64 64 64
/biostruc/newVSch/vastuti.hpp 62 62 62
/biostruc/newmmdb/mmdbsrv.c 322 327 362 401 405 423 425 426 473 473 553 561 890 916 1099 1099 1106 1345 1573 1584
/biostruc/newmmdb/mmdbuti.c 406 406 407 418
/biostruc/newvast/PrintBanner.c 171 171 270 271
/biostruc/newvast/mkbioseqA.c 69 150 245 267 269 315 342 342 347 374 432 481 554 590 596 693
/biostruc/newvast/mkbioseqB.c 64 105 134 184 184 186 202 202 221 325 388
/biostruc/newvast/mkbioseq_vs.c 129 160 228
/biostruc/newvast/vast2cn3dDB.c 103 126 162 303 372 818
/biostruc/newvast/vastchkid.c 173 183 249 264 482 503
/biostruc/newvast/vastgraphDB.c 55 98 182 182 261 263 327 328 352 352 426 427 427 430 441 562 565 565 571 797 797 798 809 981 982 983 984 1077 1160 1160 1163 1163
/biostruc/newvast/vastlocl.c 180
/biostruc/newvast/vastsrvDB.c 108 129 131 131 223 253 253 254 263 318 318 320 320 387 553 590 590 591 592 593 790 1067 1132 1191 1192 1244 1244 1247 1261 1262 1304 1331 1332 1587 1614 1644 1674 1678 1732 1735
/biostruc/newvast/vastuti.c 72 93 97 149 178 277 277 283 388 388 393 410 410 411
/biostruc/newvast/vastuti.h 21 23 25 27 31 31 35 35
/biostruc/nrpdb/nrpdbsrv.c 330 588
/biostruc/objmmdb1.h 180 343 413
/biostruc/objmmdb2.h 369
/biostruc/objmmdb3.h 256 334 602 779
/biostruc/pdbeast/interface.c 1033
/biostruc/pdbeast/mmdborgcpy.c 280 402 447
/biostruc/pdbeast/orgmatch.c 370 370 370
/biostruc/pdbeast/pdbeast.c 148 153 166 780 782 794 830 847 859
/biostruc/pdbeast/tax_index.c 168 274
/biostruc/prunebsc.c 174 519 522
/biostruc/prunebsc.h 21
/biostruc/vast2cn3d.c 88 118
/biostruc/vast2mage.c 85 143 190 199 201 331 332 382 383
/biostruc/vast2pdb.c 92 96 97
/biostruc/vastchkid.c 170 180 246 261 479 500
/biostruc/vastsrv.c 216 216 271 276 326 326 326 400 420 421 614 614 925 925 929 936 966 1034 1066 1248 1248 1254 1388 1394 1399
/biostruc/vastsrv.h 75 77 78 79 79
/biostruc/vastsubs.c 344
/cdromlib/accentr.c 381 401 401 401 410 410 425 536 600 603 604 605 608 752 791 874 879 879 1549 1640 2461 2466 2744 2745 2769 2792 2951 2965 2984 3318 3318 3318 3340
/cdromlib/accentr.h 185 186 196 197 258 269 270 272 280 281 306 315 316 319 340 343 345 350 351 351 376 397 408 411 411 411 428
/cdromlib/accmmdbs.c 125 170 173
/cdromlib/accutils.c 194 232 239 240 423 437 509 511 512 515 526 539 680 682 736 798 857 862 922 927 986 992 1035 1041 1044 1077 1089 1106 1174 1179 1186 1202 1202
/cdromlib/accutils.h 144 145 156 157 158 159 161 162 163 164 166 168
/cdromlib/casn.c 126 333
/cdromlib/cdconfig.c 84 118 118 118 119 119 186 187 187 240 240 241 246 247 248 249 250 251 446 446 446 508 508 510 548 549 993 1193 1193 1194 1194 1422 1423
/cdromlib/cdconfig.h 77 90 110 111 112 120 143 144 144 146 146 155
/cdromlib/cdentrez.c 224 224 236 237 238 253 253 280 281 330 376 497 526 600 600 717 717 1008 1096 1099 1708 1708 1777 1777 1786 1917 1948 2480 2481 2564 2574 2576 2608 2902 2905 2926 2945 3000 3004 3013 3020 3043 3280 3282 3373 3379 3385 3393 3398 3406 3409 3541 3599
/cdromlib/cdentrez.h 155 157 160 161 166 166
/cdromlib/cdromlib.c 158 160 179 187 208 208 208 209 210 215 231 237 238 239 240 240 253 331 331 386 520 529 570 573 580 595 622 622 622 628 657 694 727 727 783 802 804 818 846 968 1014 1023 1073 1080 1157 1299 1304 1343 1376 1395 1419 1438 1439 1486 1492 1495 1500 1533 1606 1686 1735 1739 1773 1773 1777 1831 1910 1992 2020 2026 2293 2314 2362 2366 2512
/cdromlib/cdromlib.h 128 130 131 132 133 158 164 167 174 177
/cdromlib/objentr.c 269 306
/cdromlib/objentr.h 131 132 133 192 193 194
/cn3d/algorend.c 823 824 825 826 834 2850 3383 4209 4210 4211 4212 4213 4214 4294 4311 4317 4336 4773 4774 5754
/cn3d/cn3dmain.c 232 234 387
/cn3d/cn3dmodl.c 418
/cn3d/cn3dmsel.c 169
/cn3d/cn3dopen.c 919 1394 1717 1719
/cn3d/cn3dopen.h 122 183
/cn3d/cn3dsave.c 357 363 521 598 627 704 775 845 857 857 862 889 1014 1015 1081
/cn3d/cn3dstyl.c 98 192 296
/cn3d/cn3dwin.c 702 1681 2399
/cn3d/cn3dxprt.c 206 378
/connect/urlquery.c 303 312 339 355 567 569 570 571 572 573 581 582 586 630 631 633 634 635 636 637 644 675 677 678 679 680 681
/connect/urlquery.h 180 262 263 265 266 267 268 269 273 275 276 277 278 279
/corelib/ncbimain.h 97
/corelib/ncbimisc.h 72 384
/corelib/ncbistd.h 124
/corelib/ncbithr.c 604 605 644 843 844 2714 2714 2737 2769 2770 2771 2866 2867 2868
/corelib/ncbiwin.h 117
/corelib/ncbiwww.h 142 143 153 154 155 156 157 158 159 160 200 204 221 224 313 315 364 372 380 387 395 403 413 438 449 459 469 490 490 501 501 513 513 525 525
/corelib/tree.c 92 92 953 1027
/corelib/treemgr.h 142 147
/corelib/tsprintf.c 497
/corelib/wwwutils.c 173 173 174 175 176 193 194 195 196 197 198 199 200 204 205 270 281 292 303 314 325 336 395 395 416 416 441 505 524 546 557 579 579 594 594 598 613 618 641 642 649 651 668 673 694 695 702 704 720 726 727 743 764 798 804 807 818 828 837 866 869 883 893 902 974 1031 1031 1048 1057 1071
/ctools/asn_connection.c 42 43 49 57
/ddv/ddvclick.c 857 877 940
/ddv/ddvclick.h 119 121
/ddv/ddvcreate.c 1815 1834 1857 3112 3128
/ddv/ddvgraph.c 694 824 844
/ddv/ddvopen.c 2111 3239 3401
/ddv/ddvopen.h 238 317
/ddv/ddvpanel.c 2454 2486
/demo/aceread_tst.c 140 146 190 244 246 261 261 261 277 277 277 280 286 299 300 301 302 303 306 307 467 539 600 600 810 810 909 909 1005 1030 1031 1032 1033 1036 1037 1039 1040 1060 1291 1292 1293 1294 1295 1296 1297 1301 1302 1304 1305 1552 1561 1566 1567 1568 1569 1570 1574 1576 1609 1625 1632 1637 1642 1643 1645 1652 1654 1679 1684 1685 1691 1750 1750 1813
/demo/alint.c 49 50 80 87 114 114 118 153 182 195 196
/demo/asn2all.c 59 113 123 129 561 585 602 607 640 977 1152 1168 1416 1506 1511 1518 1519 1563 1568 1576 1577 1621 1621 1625 1634 1806 1878 1880 1881 1883 1884 1885 1886 1887
/demo/asn2asn.c 52
/demo/asn2fast.c 34
/demo/asn2fsa.c 67 270 500 532 533 534 707 708 709 728 983 984 985 1018 1019 1020 1092 1093 1094 1101 1111 1131 1144 1148 1155 1156 1289 1342 1343 1344 1345 1348 1350 1404 1405 1406 1407 1409
/demo/asn2gb.c 61 65 81 155 157 159 160 279 281 283 284 403 405 407 408 529 530 750 751 892 949 1017 1027 1036 1045 1056 1057 1058 1060 1102 1103 1104 1116 1117 1342 1343 1357 1358 1359 1397 1762 1864 1868 1875 1876 2116 2117 2121 2134 2145 2153 2333 2366
/demo/asn2idx.c 57 60 65 69 77 78 79 80 88 98 119 131 137 201 241 242 246 247 248
/demo/asn2xml.c 44
/demo/asnbarval.c 66 77 78 79 95 97 99 100 219 221 223 224 343 345 347 348 495 503 584 699 720 884 976 976 978 980 998 1014 1014 1017 1026 1040 1041 1094 1095 1096 1097 1098 1099 1115 1133 1134
/demo/asndhuff.c 255 282
/demo/asndisc.c 71 83 84 85 86 102 104 106 107 226 228 230 231 350 352 354 355 530 535 591 711 733 910 925 1057 1057 1060 1069 1080 1082 1100 1100 1105 1161 1161 1166 1222 1245 1247 1253 1302 1303 1304 1305 1306 1307 1308 1311 1312 1336 1346 1382 1383
/demo/asnmacro.c 63 155 156 157 158 159 165 166 167 180 181 182 209 235 301 343 434 443 444 446 455 491 536 631 632 638 686 696 697 701 702 703 704
/demo/asnstrip.c 57 60 61 62 63 64 70 71 72 92 93 94 121 147 318 356 461 470 471 473 482 518 607 608 670 671 675 676 677 678
/demo/asnval.c 71 77 112 126 128 130 131 250 252 254 255 374 376 378 379 585 589 598 602 602 640 642 643 645 659 660 661 662 663 664 665 666 667 673 681 951 1049 1113 1118 1119 1134 1234 1362 1554 1672 1695 1709 1880 1900 1908 2165 2276 2354 2606 2658 2706 2707 2708 2709 2710 2717 2725 2808
/demo/batch.c 170 181 182 213 221 231 581 898 901 913 1041 1044 1046 1069
/demo/bl2seq.c 319 321 650 979 986
/demo/blastalign.c 84 103 103 174 175 266
/demo/blastall.c 795 913 1141 1141 1781 1791 2797
/demo/blastclust.c 249 347 465 471 472 476 490 501 501 524 525 528 964 966 972 979 981 1132 1134 1150 1155 1155 1193 1193 1208 1214 1232 1238 1355
/demo/blastpgp.c 754 766 1291 1349
/demo/bulk2htgs.c 53 120 125 213 214 217 273 291 368
/demo/ccp.c 152 153
/demo/ccpv.c 78 105 118 360 362 397 413 428 444
/demo/cdscan.c 99 100 114 114 116 118 118 169 351 399 406 433 476 616 617 713 713 770 802 802 843 843 848 848
/demo/checksub.c 20
/demo/cleanasn.c 79 119 131 132 133 134 137 138 139 140 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 157 177 179 181 182 300 302 304 305 423 425 427 428 799 800 870 886 920 942 951 960 1026 1047 1174 1175 1180 1334 1334 1340 1340 1417 1421 1570 1574 1624 1763 1767 1891 1897 1936 1940 2182 2182 2185 2333 2370 2429 2462 2840 2850 2860 2880 2909 2913 3034 3036 3040 3043 3046 3123 3165 3191 3360 3379 3408 3412 3423 3581 3601 3605 3633 3654 3705 3718 3748 3772 3774 3780 3803 3841 3857 3914 4142 4145 4821 4832 4857 4876 4883 4947 4963 4964 5012 5167 5200 5221 5936 6074 6090 6098 6099 6100 7341 7349 7371 7373 7376 7377 7556 8376 8409 8411 8592 8593 8610 8722 8750 8786 8787 8817 8818 8847 8848 8890 8892 8893 8895 8896 8897 9012 9150 9151 9174 9181 9230 9237 9259 9265 9266 9331 9337 9350 9377 9387 9398 9471 9506 9511 9518 9526 9541 9542 9543 9555 9556 9562 9575 9576 9585 9601 9660 9665 9666 9710 9718 9719 9733 9740 9746 9761 9766 9772 9790 9804 9852 9890 9899 9913 9924 9984 9988 10008 10042 10043 10060 10247 10249 10250 10251 10290 10386 10387 10388 10426 10487 10520 10541 10545 10683 10684 10709 10770 10776 10845 11290 11291 11368 11430 11430 11561 11565 11993 11994 11995 11996 11997 11998 11999 12000 12001 12008 12012 12175 12178 12265 12266 12267 12268 12269 12270 12271 12272 12273 12345 12349 12367 12373 12468 12472 12473 12474 12493 12500 12534 12544 13147 13289 13295 13723 13736 13875 13891 13896 14110 14116 14199 14240 14299 14316 14687 14731 14747 14748 14752 14753 14754 14755 14756 14887 14930 14931
/demo/cnsgn.c 86 500 501 510 527 544 553 554 760 762 783 918 920 1038 1061 1079 1100 1121 1178 1195
/demo/cnsgnv.c 87 99 103 104 126 278 379 381 423 432 460 474
/demo/cnsrt.c 76
/demo/cnsrtv.c 76 123 189 198 226 240
/demo/condense.c 57 88 174 183 188 193 212 253 257 370
/demo/copymat.c 366 619 718 724
/demo/cspeedtest.c 62 71 72 73 74 75 76 77 78 108 157 215 256 337 398 452 478 488 504 515 516 517 518 519 520 521 522 523 528 819 837 1046 1064 1200 1336 1379 1380 1381 1382 1383 1454
/demo/diffshift.c 56 80 82 88 111 156 204 216 217
/demo/dotmain.c 112 125 152 165 179 904
/demo/dst.c 137
/demo/dustn.c 64
/demo/dustv.c 81 108 121 419 421
/demo/elecpcr.c 110 115 118 121 122 123 133 137 138 142 142 143 153 190 192 380 597 670 843 847 1014 1014 1017 1018 1040 1047 1059 1070 1084 1094 1108 1110
/demo/entrcmd.c 149 156 168 169 216 324 325 371 463 567 669 678 713 750 878 1026 1031 1161 1177 1190 1202 1292 1292 1301 1303 1403 1403 1470 1472 1473 1482 1575 1577 1578 1624 1628 1646 1647 1650 1906 1911 1915 1916 1917 1918 1919 1921 1922
/demo/entrez.c 273 300 361 620 620 620 620 631 631 631 695 695 703 703 1102 1102 1118 1325 1325 1553
/demo/entrez2.c 135 148 163 163 163 163 374 374 672 830 863 866
/demo/epi.c 167
/demo/epiv.c 79 125 226 240 582
/demo/export_cmt.c 78 140 140 166 212
/demo/fa2htgs.c 81 104 110 237 255 330 330 334 335 371 371 377 378 406 424 442 443 443 444 444 517 517 521 522 539 547 551 552 631 637 653 654 798 807 1237
/demo/fastacmd.c 220 226
/demo/fdef.c 19 98
/demo/fdselect.c 88 130 130 132 159 161 184 189 204 280 314 317 366 466 467 488 490
/demo/fetchent.c 217 269 280
/demo/flint.c 77 78 234 246 247
/demo/formatdb.c 509 563 601 603 607 610 708 836 836
/demo/formatrpsdb.c 308 348
/demo/gbseqget.c 57 58 65 66 210 290 305 411
/demo/gene2xml.c 53 239 240 251 254 255 375 376 377 378 391 407 442 498 549 550 554 555
/demo/genget.c 16 66 68 182 185 187 251 256 261 272 276 282 291 301 310 319 328 337 346 355 364 373 382
/demo/getmesh.c 21
/demo/getpub.c 24
/demo/getunfin.c 95 99
/demo/gi2accn.c 418 457 458
/demo/gil2bin.c 62 62
/demo/idcleanscan.c 80 80 102 102 663 693 697 779 811 822 919 997 1089
/demo/indexpub.c 22
/demo/ingenmain.c 72 166 239 239 241 261 262 264 265 267 268 282
/demo/insdseqget.c 60 62 63 70 71 215 295 310 417
/demo/makemat.c 331
/demo/makeset.c 28 29 33
/demo/megablast.c 714 716 717 742 753 828 887 898 920 930 1006 1067 1100 1272 1283
/demo/mts.c 149 367
/demo/nps2gps.c 55 58 59 72 73 304 311 313 316 339 376 412 413 423 425 426 427 450 492 519 696 778 779 780 787 829 1220 1324 1407 1427 1433 1435 1443 1444 1640 1650 1656 1757 1772 1879 1897 1901 2190 2206 2430 2493 2494 2498 2499 2500 2501
/demo/profiles.c 204 205 222 225 235 236 239 390 1011 1395
/demo/qbatch.c 140 144 145 417 419 434 576 612 638 641 750 780 891
/demo/raw2delt.c 58 61 62 63 64 65 71 72 73 86 87 88 115 141 222 247 334 343 344 346 355 391 484 485 576 577 581 582 583 584
/demo/readbclhits.c 70 71 89 100 100
/demo/reblobber.c 78 112 113 115 116 117 118 119 134 135 136 137 138 152 177 215 256 266 282 326 387 407 750 751 752 753 765 818 823 889 936 1007 1010 1028 1094 1128 1149 1153 1169 1176 1238 1446 1533 1572 1573 1581 1597 1655 1871 1982 1982 1986 1988 2079 2080 2123 2124
/demo/releasescan.c 67 85 112 117 132 144 150 174 228 312 383
/demo/replicon.c 78 82 124 125 126 129 130 156 200 209 249 250 251 252 332
/demo/rtestval.c 40 41 53 284
/demo/sapcitfetch.c 202 239 240
/demo/scantest.c 121 122 123 124 125 165 261 280 311 313 316 320 358 386 411 467 473 648 798 800 837 863 956 975 1001 1111 1114 1259 1296 1334 1384 1425 1434 1480 1484 1495 1867 1975 1976 1977 1978 2136 2342 2383 2391 2392 2393 2394
/demo/searchv.c 75 79 84 129 261 275 447 487
/demo/seedtop.c 173 174 175 176
/demo/seqget.c 57 81 85 132 143
/demo/seqtest.c 28
/demo/setsts.c 66 67 93 109 110 111 112
/demo/sgd2asn.c 62 63 64 92 93 94 116 117 118 149 150 151 177 178 179 221 234 485 486 487 504 521 614 648 649 650 666
/demo/sigme.c 136
/demo/sigmev.c 87 96 97 123 136 490 492 792 793
/demo/snpscan.c 58 62 71 402 698 699 700 887 922 923 974
/demo/snpsynon.c 59 60 61 89 90 91 107 108 109 122 132 248 509 574 575 576 713 747 756
/demo/sortbyquote.c 48 49 54 80 81 100 107 108 121 128 129 147 172 199 212 213
/demo/sortcmd.c 69 78 81 82 87 383
/demo/spideymain.c 152 152 153 190 191 583 583 586 587 613 654 658 662 709 713
/demo/sqn2agp.c 60 63 80 173 179 233 490 491 492 493 494 502 592 621 632 787 829 830 834 835 836
/demo/src_chk.c 65 69 71 87 89 97 102 107 118 124 188 292 298 324 326 327 346 510 512 514 515 669 718 735 929 1072 1074 1115 1156 1170 1324 1358 1369 1421 1422 1451 1453
/demo/srchaa.c 160 163 164 220 244 325 326 331 332 333
/demo/srchnt.c 193 197 198
/demo/subfuse.c 54 55 56 117 136 137 138 177 223 224 225 253
/demo/sugint.c 149 188 189 190
/demo/tbl2asn.c 81 121 122 124 125 126 127 128 129 130 147 148 149 150 151 167 168 169 190 191 192 193 239 243 257 258 259 260 261 262 263 264 265 271 324 325 326 374 375 376 400 401 402 409 420 550 724 725 726 727 947 976 977 985 991 1181 1262 1397 1398 1399 1433 1474 1484 1500 1544 1605 1625 1876 1877 1884 1885 1978 1991 2084 2084 2104 2105 2113 2114 2128 2129 2135 2136 2162 2171 2295 2296 2297 2324 2329 2654 2701 2709 2721 2731 2744 2977 3119 3247 3268 3321 3330 3391 3546 3741 3822 3849 3850 3851 3853 3854 3855 3856 3857 3858 3864 3870 3957 3965 4011 4013 4014 4015 4016 4097 4100 4101 4107 4122 4125 4260 4297 4489 4506 4880 4925 4935 5412 5447 5454 5456 5459 5460 5484 5528 5529 5539 5541 5542 5543 5566 5607 5688 5821 5903 6058 6064 6102 6103 6107 6153 6155 6158 6159 6164 6264 6288 6319 6324 6354 6406 6457 6480 6519 6587 6629 6629 6749 6768 6795 6796 6797 6948 6948 6967 6971 7084 7085 7090 7096 7175 7176 7177 7178 7183 7204 7205 7211 7215 7221 7222 7226 7933 7936 7937 7938 7939 7944 7977 7978 7979 7985 7990 7991 8000 8025 8287 8288 8298 8323 8327 8333 8349 8350 8354 8355 8384 8394 8458 8522 8527 8528 8532 8539 8547 8553 8561 8573 8588 8601 8602 8603 8608 8833 8840 8841 8843 8848 8851 8852 8853 8858 8862 8872 8874 8875 8879 8930 8931 8935 8937 8938 8942 8943 8945 8953 9095 9096 9098 9100 9102 9104 9188 9228 9277 9334 9369 9562 9567 9639
/demo/tbl_chk.c 65 69 71 87 89 97 102 107 118 124 289 294 320 322 323 342 506 508 510 511 665 708 874 1011 1013 1054 1095 1109 1229 1231 1360 1416 1442 1444
/demo/testcgi.c 83 276 308 335 337 338 341 345 413 413 430 430 449 452 458 459 460 528 583 592 593 595 650 653 654 655 656 657 660 661 662 663 666 669 670 674 675 834 834 837 848 851 852 881 887 888 889 890 893 894 896 899 900 903 905 906 1104 1113 1117 1118 1119
/demo/testcore.c 194 233 238 247 295 296 301 339 398
/demo/testent2.c 108 115 131 174 176 297 298 299 302 592 628
/demo/testval.c 30 31 42 244
/demo/trna2sap.c 50 53 54 60 61 62 63 74 78 79 81 82 83 86 87 91 191 192 197 239 281 457 507 508 509 510 512 513 517 518 519 520
/demo/trna2tbl.c 80 124 125 128 129 130 133 134 138 139
/demo/twop.c 144 145 148
/demo/twopv.c 84 149 250 255 271 493 494 497 796
/demo/vecscreen.c 97 98 108
/demo/vsmapp.c 70
/demo/xlint.c 97 99 111 112 116 117 118 119
/desktop/aacomp.c 16 87 131 131 138 194
/desktop/aacomp.h 19 19 23
/desktop/apparam.c 47 47 57 57 66 67 80 91 91 110 110 123 133 148 150 153 176 181 182 200 205 206 225 230 231 247 252 253 274 275 287 297 303 308 308 314 314 322 324 336 338 353 355 370 372 387 389 404 406 421 421 423
/desktop/apparam.h 70 70 71 73 74 75 75 76 76 79 80 81 82 85 89 90 91 92 93 94 95 95 101 101
/desktop/asn2graphic.c 190 215 249 275 298 317 334 347 364 379 396 449 479 479 499 519 530 540 609 623 637 652 672 691 693 716 735 820 928 1038 1147 1162 1177 1376 1571 1610 1614 2295 2527 2676 2933 4144 5880 6382 6557 6558 6559 6621 6631 6641 6646 6651 6668 6673 7138 7144
/desktop/asn2graphic.h 62 63 70 71 72 78 79 80 81 82
/desktop/asn2graphicp.h 141 185 208 233 255 259 311 312 313 317 318 321
/desktop/biosrc.c 98 100 101 152 172 1016 1019 1021 1024 1027 1028 1128 1176 1196 1274 1274 1279 1307 1310 1321 1365 1644 1683 1759 1763 1766 1830 1848 2062 2072 2441 2575 2627 2629 2639 2649 2652 2684 2812 2817 2818 2900 3015 3074 3110 3112 3122 3132 3135 3198 3202 3206 3217 3221 3336 3337 3351 3354 3360 3366 3376 3382 3406 3408 3486 3488 3499 3590 3613 4006 4043 4088 4156 4209 4489 4544 4785
/desktop/biosrc.h 60 85 87 91 98 100
/desktop/bspview.c 241 358 902 903 911 912 966 982 987 1136 1139 1389 1406 1410 1551 1624 1645 2032 2038 2046 2131 2287 2450 2483 2539 2655 2664 2799 2843 2844 3507 3521 3579 3649 3936 3973 4012 4087 4119 4120 4229 4229 4242 4340 4486 4486 4486 4486 4527 4563 4564
/desktop/bspview.h 210 210 216 301 302 303 307 363 372 385 394
/desktop/cdrgn.c 181 358 485 741 943 1381 1441 1442 1597 1783 1784 1932 1953 1961 2065 2067 2077 2087 2091 2125 2149 2179 2204 2215 2276 2308 2414 2418 2584 2714 2916 2960 2965 3040 3065 3121 3172 3177 3183 3186 3187 3188 3214 3259 3262 3265 3277 3336 3351 3356 3386 3614 3868 4073 4079 4095 4652 4653 4720 4721 4774 4778 4782 4786 4833 4849 5029 5046 5063 5126 5479 5483 5606 5801 5818 5835 5962 6264 6278 6323 6410 6411 6502 6538 6648 6689 6770 6789 7046 7059 7065 7090 7144 7220 7388 7393 7471 7488 7623 7750 7842 8017 8032 8041 8044 8057 8099 8288 8290 8301 8309 8494
/desktop/cdrgn.h 97 109 116 123 135 141 142
/desktop/dlgutil1.c 72 880 918 1066 1139 1181 1210 1235 1261 1293 1311 1312 1317 1325 1350 1410 1744 1758 1758 1764 1799 1802 1805 1845 2022 2036 2041 2411 2427 2431 2448 2452 2471 2472 2608 2609 2613 2620 2622 2747 2759 2783 2852 2864 2880 2958 2979 2979 2981 3043 3057 3069 3071 3090 3090 3092 3113 3124 3127 3130 3176 3209 3313 3325 3325 3327 3582 3740 3746 3752 3758 3764 3770 3861 3910 3920 3938 3939 3969 3973 4316 4436 4438 4445 4448 4784 4788 4841 4850 4915 4920 4951 4958 5000 5007 5099 5100 5101 5102 5103 5126 5136 5142 5152 5360 5368 5686 5691 5695 5698 5702 5789 5832 5837 5841 5844 6034 6063 6104 6105 6217 6217 6219 6235 6287 6311 6753 6791 6869 6934 6981 7044 7056 7072 7086 7088 7115 7124 7140 7157 7158 7250 7251 7253 7262 7281 7285 7352 7352 7352 7354 7366 7400 7465 7508 7512 7524 7538 7568 7669 7675 7701 7710 7724 7738 7818 7820 7921 7927 7965 7967 7982 8051 8079 8085 8099 8108 8110 8143 8144 8158 8208 8210 8366 8373 8483 8484 8495 8845 8846 8857 8960 8991 9082 9159 9190 9247 9294 9301 9317 9319 9321 9322 9323 9440 9457 9467 9545 9613 9619 9638 9763 9770 9816 9818 9843 9880
/desktop/dlgutil2.c 77 82 83 113 113 118 143 147 272 336 386 387 390 391 402 408 423 448 456 506 555 696 701 729 742 748 749 753 769 770 898 977 991 1166 1173 1173 1177 1178 1214 1214 1214 1218 1236 1239 1391 1509 1639 1644 1665 1669 1676 1680 1681 1682 1737 1744 2131 2138 2140 2143 2144 2202 2207 2209 2246 2252 2254 2257 2258 2357 2459 2461 2581 2612 2613 2738 2739 2756 2756 2769 3035 3046 3222 3224 3302 3302 3368 3369 3370 3371 3372 3472 3484 3656 3659 3691 3730 3764 3775 3841 3866 3945 3957 4067 4082 4098 4099 4202 4218 4586 4784 5033 5115 5130 5314 5377 5398 5433 5459 5466 5528 5560 6196 6208 6210 6227 6227 6229 6230 6276 6284 6348 6359 6360 6382 6387 6388 6420 6422 6452 6458 6496 6497 6499 6500 6501 6502 6503 6504 6505 6506 6507 6620 6635 6668 6683 6690 6768 6834 6920 6949 7002 7090 7235 7235 7256 7261 7262 7263 7469 7470 7476 7477 7478 7806 7806 7831 7847 7863 7895 7908 7909 7910 7926 7985 7993 8182 8182 8182 8184 8604 8619 8735 8737 8766 8784 8789 8801 8804 8805 8816 8854 9373 9764 9772 9851 9921 10202 10418 10435 10452 10544 10545 10546 10547 10659 10660 10661 10662 10689 10690 10691 10692 10714 10714 10714 10714 10756 10757 10797 10831 10877 10931 10931 10935 10941 10952 10960 10981 10992 11001 11059 11069 11111 11116 11147 11153 11183 11201 11231 11330 11332 11344 11398 11399 11400 11510 11544 11546 11570 11572 11618 11625 11642 11643 11654 11663 11693 11706 11710 11710 11710 11712 11775 11776 11782 11795 11796 11809 11817 11820 11852 11864 11878 11885 11896 11928 11929 11935 11956 11957 11996 12030 12036 12044 12051 12061 12070 12104 12120 12125 12148 12172 12186 12189 12189 12204 12209 12221 12234 12234 12272 12304 12304 12307 12318 12329 12340 12381 12410 12410 12458 12463 12464 12471 12480 12483 12489 12498 12503 12509 12518 12537 12546 12548 12589 12590 12596 12605 12607 12610 12663 12690 12695 12730 12764 12774 12857 12857 12859 12864 12870 12870 12904 12911 13042 13089 13154 13155 13198 13213 13226 13347 13374 13392 13407 13411 13465 13472 13559 13989 13991 13998 14002 14015 14023 14030 14445
/desktop/dlogutil.h 81 173 173 175 186 187 189 190 191 196 198 200 214 215 218 224 231 242 286 289 289 290 292 292 296 297 299 337 337 345 346 346 347 370 370 388 388 388 388 388 390 390 407 423 432 442 455 465 480 494 502 507 561 566 567 576 577 578 579 592 593 594 595 609 610 611 612 624 624 624 624 627 628 630 633 654 656 657 672 673 681 683 684 697 705 706 708 709 712 713 717 735 736 737 738 762 792 795 797 798 802 809 811 816 817 822 823 824 825 830
/desktop/dotvibrant.c 115 116 2327 2327 2376 2377 2378 2517 2518 3390 5916 6777
/desktop/dotviewer.h 165 166 251 252 275 289 384
/desktop/drawseq.c 136 190 1896 1923 2330 2338 2377 3393
/desktop/drawseq.h 310
/desktop/e2docsum.c 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 491 522 563 563 567 709 854 858 859 860 861 862 864 866 867 868 869 870 871 873 874 875 876 877 878 879 880 881 882 883 884 885 886 887 888 889 1107 1112 1137 1139 1148 1149 1154 1282 1288 1300 1304 1304 1310 1341 1344 1382 1385 1390 1432 1438 1444 1572 1577 1589 1591 1668 1674 1680 1686 1692 1698 1710 1715 1720 1762 1765 1770 1811 1812 1922 1923 2167 2589 2691 2763 3118 3430 3663 3714 3719 3720 4276 4892 4908 5333
/desktop/e2trmlst.c 237 238 247 264 352 357 382 382 546 547 549 550 551 552 558 568 580 685 723 798 836 836 873 913 1112 1112 1120 1168 1171 1396 1475 1475 1517 1547 1551 1552 1589 1593 1594 1600 1602 1606 1617 1621 1629 1682 1685 1686 1729 1733 1752 1756 1775 1779 1801 1801 1806 1807 1836 1905 1916 2011 2070 2075 2141 2145 2173 2173 2180 2181 2254 2393 2396 2467 2470 2550 2858 2897 2903 2968 2971 2973 2974 3124 3165 3342 3644 3647 3667 3670 3789 3912 3996 4134 4135 4479 4480 4481 4530 4544 4566 4702 4752 4778 4826 4832 4834 4835 4911 5241 5347 5349 5351 6451 6562 6602 6636 6637 6638 6640 6728 6788 6855 6855 6855 6914 6987 6987 6992 7016 7026 7122 7122 7122 7208 7218 7221 7224 7461 7464
/desktop/entrez2.h 61 64 88 89 90 106 118 134 137 143 144 151 151 151
/desktop/fea2seg.c 119 122 255 287 287 362 366 399 472 731 790 827 859 873 886
/desktop/fea2seg.h 87
/desktop/fstyle.c 89 125 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 265 266 267 287 288 289 567 580 595 614 629 646 667 672 725 731 793 835 954 1116 1121 1149 1226 1266
/desktop/fstylep.h 79
/desktop/gbfview.c 226 245 274 346 357 363 538 552 576 580 593 604 614 616 773 785 988 989 990 991 993 1278 1318 1828 1954 2319 2448 2459 2502 2502 2514 2595 2595 2601 2601 2607 2612 2612
/desktop/glbpic.c 389 881 1419 1561 1748 1942
/desktop/glbpic.h 16
/desktop/gphview.c 399 1998 2001 2001 2006 2034 2037 2048 2230 2359 2407 2416 2428 2447 2467 2501 2509 2536 2537 2545 2546 2706 2737 2737 2752 3262 3325 3342 3342 3349 3349 3880 3881 3882 3883 3887
/desktop/gtrdraw.c 81 105
/desktop/import.c 87 88 261 349 360 502 519 536 602 604 768 981 1101 1118 1135 1198 1200 1446 1449 1468 1494 1494 1599 1616 1633 1637 1700 1712 1810 1811 1812 1835 1921 2046 2294 2298 2430 2449 2648 2824 2836 2857 2859 2861 2863 2865 2866 2868 2869 2871 2872 2874 2875 2877 2878 2880 2882 2934 2945 2956 2967 2978 2989 3000 3002 3013 3024 3035 3070 3163 3164 3165 3166 3167 3168 3169 3170 3171 3241 3310 3311 3320 3372 3390 3470 3609 3613 3622 3658 3662 3746 3755 3756 3776 3840 3897 4089 4141
/desktop/import.h 57 69 79 88 93 101 113 122 127 128 129 131
/desktop/ingenext.c 150 150 256 318 320 321 494 496 501 502 503 510 511 512 513 514 515 521 547 576 576 635 687 734 735 746 749 750 803 814 831 878 896 905 911 912 913 917 918 1010 1010 1010 1010 1010 1010 1016 1051 1215 1268 1310 1311 1499 1499 1757 1757 1770 2015 2020 2077 2202 2204 2288 3032 3156 3158 3265 3270 3272 3273 3298 3307 3325 3327 3461 3465 3594 3594 3597 3609 3828 3833 3843 4043 4323 4324 4677 4677
/desktop/ingenext.h 109 110 129 130 146 151
/desktop/ingengraph.c 73 93 106 106 109 110 111 112 123 127 146 146 151 151 268 288 299 363 430 464 495 721 1020 1439 1645
/desktop/ingengraph.h 186 187 199 200 245 246 307
/desktop/ingenwin.c 79 109 109 562 712 785 819 909 960 1011 1062 1117 1290 1290 1296 1360 2102 2144 2144 2144 2146 2147 2174 2198 2198 2274 2276 2286 3039 3039 3050 3050 3059 3059 3101 3105 3122 3129 3137 3139 3140 3141 3224 3224 3224 3226 3232 3256 3300 3301 3305 3306 3388 3388 3392 3393 3410 3428 3446 3511 3516 3518 3520 3522 3650 3657 3659 3982 3982 4074 5006 5007 5008 5009 5143 5144 5145 5188 5189 5535 5543 5598 5599 5695 5699 5717 6261 6754 6755 6808 6814 6814 6818 6818 6832 6832 6845 6845 6849 6849 6863 6863 7029 7029 7031 7034 7034 7305 7406 7569 7569 7569 7569 7569 7569 7569 7605 7605 7605 7605 7605 7605 7605 7717
/desktop/ingenwin.h 157 211 212 212 213 213 222 226 228 228 234 234 234 234 234 234 234 235 235 235 235 235 235 235 239 243 244 244 244 251 251 255
/desktop/layout.c 99 101 2362
/desktop/legend.h 11 12
/desktop/macrodlg.c 66 75 140 175 176 208 220 225 269 274 345 372 411 918 1627 1643 1659 1659 2178 2284 2309 2889 2919 3107 3143 3165 5149 5272 7393 7433 7488 7488 8205 8235 8552 8577 8882 9097 9122 9973 9975 11245 11359 11402 13043 13199 13199 14547 14573 14576 14591 14678 14745 14834 14837 14838 14853 15070 15074 15081 15092 15095 15123 15223 19085 19219 19219 19319 19513 19524 19528 20176 20203 20647 20648 20649 20650 20660 20691 20781 21150 21152 21180 21281 21282 21287 21346 21348 21389 21390 21391 21405 23144 23171 23172 23193 23300 23300 23317 23341 23441 23516 23517 23518 23540 24516 24518 24519 24525 24550 24557 24558 24566 24664 24666 24667 24668 24669 24707 24715 24721 24725 24740 24742 24743 24744 24745 24746 24747 24748 24767 24859 24860 24897 25025 25086 25531 25650 26431 26470 26471 26503 26536 26541 26584 26614 26619 27141 27156 27191 27192 27193 27211 27215
/desktop/macrodlg.h 57 69 78 96
/desktop/mapgene.c 36 2092 2100 2103 2182 2241 2351 2352 2355 2356 2604 2604 2693 2735 2735 2740 2740 2745 2745 2749 2764 2764 2766 2783 2783 2806 2806 2808 2827 2827 2829 2867 2902 2912 2917 2933 2934 2937 2959 2959 3079 3143 3202 3207 3207 3228 3268 3268 3270 3285 3285 3397 3464 3464 3485 3485 3529 3555 3555 3572 3575 3629 3635
/desktop/mapgene.h 34 55 55 64 64 66 80 92 101
/desktop/medview.c 88 89 98 122 124 130 188 208 475 550 560 682 705 846 894 1093 1093 1098
/desktop/medview.h 77 102 110
/desktop/prtgene.c 26 26 28 28 58 84 186 234 280 384 384 384 442 450 541 544 594 678 683 744 744 747 837 839 842 1086 1121
/desktop/prtgene.h 32
/desktop/pubdesc.c 196 199 202 206 209 212 216 219 223 226 230 339 348 371 380 1001 1032 1059 1068 1101 1117 1126 1143 1153 1175 1184 1220 1224 1226 1309 1413 1425 1426 1427 1470 1474 1646 1648 1650 1652 1654 1713 1743 1770 2055 2060 2070 2076 2097 2130 2277 2962 3022 3132 3146 3150 3306 3321 3326 4382 4406 4729 4730 4863 4906 4914 5048 5057 5066 5075 5084 5113 5201 5216 5316 5585 5588 5629 5630 5733 5734 5737 5738 5791 5891 6073 6073 6241 6243
/desktop/pubdesc.h 63 74 79 88
/desktop/saldist.c 920 928 930 931 1101 1171 1266 1266 1443 1522 1535 1614 1628 1719 1732 1759 1784 1804 1858 1913 2509 2516 2531 2541 2541 2543
/desktop/saled.c 550 555 555 581 590 615 651 662 667 702 705 2088 2628 2629 2630 2631 2632 2633 2644 2658 2673 2686 2844 2883 2889 2974 2978 2979 2980 3060 3067 3069 3098 3099 3101 3119 3228 3318 3491 3493 3567 3570
/desktop/saledit.h 148 148
/desktop/salfiles.c 65 68 72 86 93 103 108 118 137 139 203 208 238 269 271 273 308 471 647 652 653 725 772 784 826 872 872 875 876 877 1002 1110 1115 1170 1202 1206 1253 1261 1301 1303 1364 1369 1371 1385 1652 1668 1722 1740 1745 1782 1790 1841 1846 1847 1893 1898 1899 1951 1981 2307 2518 2561 2588 2708 2709 2710 2712 2768 3673 3776 3833
/desktop/salfiles.h 64 65 66 67 68 72 73 87 88 89
/desktop/salogif.c 106 156 162 264 835
/desktop/salpanel.c 276 276 280 309 385 1223 1227 1432 1432 1434 1439 1448 1796 1796 2120 2123 2124 2136 2159 2174 2183 2263 2268 2340 2341 2342 2460 3768 4140 5093 5093 5221 5224 5225 5241 5504 5527 5706 5709 6109 6110 6111 6180
/desktop/salpanel.h 125 126 127 128 129 130 132 134
/desktop/salparam.c 1237 1450 1553 1553 1555 1560 1576 1595 1596 1649 1653 1707 1713 1716 1729 1744 2198 2308 2353 2422 2875 2876
/desktop/salparam.h 133 134 135
/desktop/salsa.c 104 1862 1863 2125 2607 2654 3894 4681 5571 5593 6057 6251 6253 6552 6552 6554 6571 6639 6744 6745 7028 7396 7456
/desktop/seqanal.c 245
/desktop/seqanal.h 53
/desktop/seqfltr.c 13 14 14 208
/desktop/seqfltr.h 32
/desktop/seqgraph.c 113 944 959 983 1007 1020 1122 1138 1483
/desktop/seqgraph.h 50
/desktop/seqmtrx.c 145 146 153 213 216 245 258 260 285
/desktop/seqmtrx.h 44 45 47 48
/desktop/seqpanel.c 122 1233 1260 1303 1477 1496 1497 1698 1699 1798 1799 2122 2129 2361 2766 2827 3613 3620 3708 3715 3804 3810 3813 3957 3961 4040 4066 4104 4122 4174 4201 4304 4316 4320 4322 4327 4329 4332 4333 4336 4337 4340 4341 4344 4345 4348 4349 4352 4353 4359 4374 6147 6222 6302 6303 6470 6582 6587 6618 7104 7108 7113 7153 7153 7166 7166 7199 7228 7318 7375 7435 7464 7466 7487 7764 7829 8112 8521 8523 8535 8580 8625 8626 8628 8646 8700 8705 8708 8721 8721 8737 8876 8880 8884 9422 9573 9983 10030 10040 10048 10064
/desktop/seqpanel.h 55 58 61 66
/desktop/seqpcc.c 132 139
/desktop/seqscrl.c 18 45
/desktop/seqscrl.h 22
/desktop/seqsub.c 74 82 83 125 134 306 336 394 515 624 633 700 729 795 839 969 972 1035 1036 1038 1073 1133 1317 1363 1400 1421 1573 1692 2021 2075 2114 2154 2384 2384 2481 2762 2764 2808 3173 3176 3183 3225 3248 3380 3503 3887 3899 4240
/desktop/seqsub.h 66 67 68 73 84
/desktop/smdlg2.c 72 98 214 221 228 243 251 267 364 395 397
/desktop/smdlg3.c 83 118 121 124 161 164 639
/desktop/styleman.c 78 91 275
/desktop/stylemui.c 79 136
/desktop/udvgraph.c 730 777 1934 1935 2323 2345 2357 2448 2471 2483 3583 3593 3603
/desktop/udviewer.h 613 648
/desktop/udvopen.c 382 1204
/desktop/udvpanel.c 2078 3185
/desktop/valdlg.c 81 84 85 92 100 103 128
/desktop/vibgraph.c 405
/desktop/vibgraph.h 47
/desktop/vsm.c 226 226 453 514 649 656 1403 1570 1571 2186 2500 2559
/desktop/vsm.h 65 65
/desktop/vsmfile.c 604 662 783 785 869 1231 1306 1316 1340
/desktop/vsmpriv.h 97 115
/desktop/vsmutil.c 66 67 68 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 193 409 415 644 644 644 664 670 695 833 833 835 836 837 865 867 887 891 895 899 900 936 948 952 989 998 1000 1011 1033 1089 1141 1141 1143 1168 1171 1219 1592 1594 1631 1633 1667 1669 1712 1715 1797 1809 1811 1939 1975 2048 2055 2110 2116 2347 2450 2455 2461 2702 2714 2722 2821 2821 2821 2821 2825 2847 2896 2896 2897 2967 2968 2969 3051 3053 3093 3094 3095 3096 3097 3098 3099 3100 3101 3106 3107 3108 3380 3394 3395 3442 3469 3540 3716 3812 3867 3867 3867 3872 3875 3877
/desktop/vsmutil.h 66 68 72 76 92 92 92 95 95 111 112 113 114 115 116 117 118 119 131 131 131 134 148 152 152 152
/network/blast3/client/netblap3.c 378 393 551 555 557 622 677 930 930 992 1074 1079 1085 1267 1524 1525 1536 1618 1624 1633 1779 1792 1893 1917 1934 1983 2016 2016 2025 2025 2034 2034 2040 2132 2132 2141 2226 2226 2236 2317 2317 2440 2440 2450 2525 2679 2679 2686 2686 2694 2694 2701 2701 2741 2795 2800 2878 2934 2952 2971
/network/blast3/client/netblap3.h 167 185 204 204 208 212 214 219 223 229 229 231 231 233 233 235 235 237 237 239 239 241 241 243 243 244 244 246 246 248 248 254 259
/network/blast3/client/objblst3.h 43 130 132 133 134 135 143 214 239 240 241 315 350 374 412 466 483 484 502 503
/network/entrez/client/netentr.c 170 181 183 184 189 194 200 204 206 208 264 269 284 292 506 580 581 1194 1298 1444 1481 1536 1577 1629 1632 1693 1772 2340 2374 2405 2422 2439 2549 2594 2594 2594 2662 2662 2662 2694 2729 2738
/network/entrez/client/netentr.h 109 124 125 131 136 157 159 162 163 169 169 193 194 202 202 202 207
/network/entrez/client/netlib.c 107 130 136 510 521 645 814 814 820
/network/entrez/client/netlib.h 102 109 114 114 132 134
/network/entrez/client/netpriv.h 67 67
/network/entrez/client/objneten.c 3342 3345 3346 3351 3367
/network/entrez/client/objneten.h 166 204 222 238 445 473 474 475 588
/network/id1arch/accid1.c 10 20 91 261
/network/id1arch/accid1.h 45
/network/id1arch/id1arch.c 44 46 110 185 377 381 529 613
/network/id1arch/id1arch.h 57 63
/network/id1arch/id1gen.h 71 147 152
/network/id1arch/idfetch.c 52 54 55 134 139 278 293 341 354 355 356 681 701 853 1115
/network/medarch/client/medarch.c 161 213 215 238 242 299 304 306 882 884 934 993 1001 1170 1214 1811 1813 2039 2079
/network/medarch/client/medarch.h 188 190 227 231
/network/medarch/client/medutil.c 66 69 89 111 116 117 118 120 121 248 249 250 251 252 426 495 496 497 498 1410 1444 1445 1467 1519 1541 1554 1554 1554 1554 1556 1658 1660
/network/medarch/client/medutil.h 128 131 131 131 131 137
/network/medarch/client/sybmed.c 225 225 246 255 255
/network/nsclilib/ncbinet.h 100 100 100
/network/nsclilib/ni_debug.c 77 85 93 103 103 104 121 121 129 129 130
/network/nsclilib/ni_lib_.c 130 212 212 212 213 274 274 275 284 284 294 294 295
/network/nsclilib/ni_lib_.h 101 101 102 104 104 107 107 108 123 123 124 126 126 129 129 130
/network/nsclilib/ni_service.c 164 174 174 175 191 191 199 199 200 302 302
/network/nsclilib/ni_types.h 92 125 126
/network/spell/client/spellapi.c 33 151 180 180 188 189 225 235 235 243 244 280 288 288 347 351
/network/spell/client/spellapi.h 23 23 24 24 25 25
/network/sybutils/ctlib/accpubseq.c 27 42 97 105 105 126 231 276 366 487 499 555 569 622 636 689 769 778 962 1368 1577
/network/sybutils/ctlib/accpubseq.h 95 96 96 100 103 117 137 158 164 165 166 167 168
/network/sybutils/ctlib/accvdb.c 20 130 135 206 265 390 408 421 426 427 472 505 505 505 583 639
/network/sybutils/ctlib/accvdb.h 10 12
/network/sybutils/ctlib/bcp_table.c 81
/network/sybutils/ctlib/cmp_table.c 70
/network/sybutils/ctlib/ctlibutils.c 91 91 91 91 189 189 189 189 189 217 295 299 375
/network/sybutils/ctlib/ctlibutils.h 40 41 42 43 59 59 59 59 62 62 62 62 62 63 65
/network/sybutils/ctlib/gipropmmap.c 55 55 269
/network/sybutils/ctlib/gipropmmap.h 40 41 41 42
/network/sybutils/ctlib/seqidtest.c 70 73 106 110 191
/network/sybutils/ctlib/test.c 53
/network/sybutils/ctlib/testsnp.c 77 81
/network/sybutils/idloadlib/idload_lib.c 63 64 246 246 594 692 818 818 839
/network/sybutils/idloadlib/idload_lib.h 154 155 162 163
/network/taxon1/common/checkid.c 62 66 67 72 89 98 109 119
/network/taxon1/common/objtax1.h 69 128 148 149 167 168
/network/taxon1/common/taxinc.h 89 90 100 101 111 111 112 141 154 163 163 188
/network/taxon1/common/taxutil.c 42 63 66 117 128 128 145 172 175 205 207 238 246 314 360 386 389 403 406 483
/network/taxon1/common/taxutil.h 67 68 70 71 71 72 73 76 77
/network/taxon1/taxon2/taxcs.c 93 107 142 153 166 189 223 232 246 270 270 305 305 314 314 333 333 355 387 395 408 427 427 427 463 463 501
/network/taxon1/taxon2/taxext.h 100
/network/taxon1/taxon2/tc2proc.c 60 133 360 370 403 409 566 584 604 609 613 637 661 671 671 751 751 751 753 764 764 777 779 1088 1093 1094 1165 1423 1477 1494 1935 1945 1945 1947 2102 2102 2181 2220 2222
/network/taxon1/taxon2/txcdproc.c 131 145 241 241 241 241 307 336 365 483 511 539 567 590 1089 1182 1186
/network/taxon1/taxon2/txclient.h 102 107 111 112 117 124 125 133 135 136 137 138 138 139 148 153 153 153 153 174 175 176 181 182 184 195
/network/taxon1/taxon2/txcommon.h 149 150 202 206 207 207 208 209 210 214 214 216 216 217 220 221 222 223 225 226 227 228 230 230 231 231 232 232 233 233 235 236 237 238 240 240
/network/taxon1/taxon2/txcproc.c 96 96 96 96 118 1247 1391 1707 1809 1935 2369
/network/vibnet/docsum.c 303 333 649 649 653 695 699 703 785 788 804 804 810 835 838 843 871 874 879 907 910 915 943 946 952 986 989 995 1029 1033 1039 1084 1088 1094 1136 1142 1148 1153 1159 1196 1199 1204 1475 1478 2212 2214 2216 2218 2220 2222 2224 2287 2340 2345 2664 3236 3270 3282 3617 4403
/network/vibnet/entrez.h 75 92 93 94 106 109 118 149 158 159 160 161 162 163 164 169 185 186
/network/vibnet/netcnfg.c 118 118
/network/vibnet/trmlst.c 75 76 222 239 256 267 270 352 642 646 647 648 672 760 836 1004 1008 1009 1015 1018 1023 1031 1045 1060 1067 1071 1088 1088 1094 1096 1100 1117 1170 1174 1188 1202 1261 1272 1327 1336 1336 1342 1343 1372 1450 1503 1505 1683 1689 1738 1741 1857 2366 2382 2385 2388 2390 2391 2454 2455 2463 2464 2484 2487 2489 2513 2566 2578 2651 2653 2724 2726 2865 3074 3087 3142 3233 3286
/object/mapproj.h 59 61 63
/object/objalign.c 49 55 62 62 131 131 135 137 195 200 206 211
/object/objalign.h 233 461
/object/objbibli.c 224 237 239 241 243 245 247 249 251 253 259 262 1200 1202 1204 1206 1208 1210 1214 1410 2103 2114 2119 2160 2172 2177 2179 2358 2368 2370 2580 2582 2584 2586 2590 2993 3179 3441 3444 3491 3502 3515 3554
/object/objbibli.h 158 237 252 261 321 363 370 372 377 382 400 403 418 422 427
/object/objblock.c 303 305 309 311 313 315 317 319 321 323 523 525 527 561 563 1152 1369 1371 1373 1375 1377 1589 1607
/object/objblock.h 104 131 174 200 201 202 203 204 232 235
/object/objcode.c 352 514 519 519 522 522 547 551 554 811
/object/objcode.h 119 120 121
/object/objfdef.c 205 207 462 602 868 903 962 1032 1032 1045 1052 1058 1078 1171 1489 1492 1496 1521 1526 1601 1645
/object/objfdef.h 75 102 151 184 210
/object/objfeat.c 86 597 599 605 1254 1257 3333 3412 3429 3829 3831 3833 4876 5038 5041 5044 5047 5087 5294 5296 5715 5721 5724 5751 5993 6003 6013 6187 6870 6944 6948 7136 7138 7407 7409 7653 7655 7657 8016 8018
/object/objfeat.h 87 125 159 179 180 221 335 339 346 521 530 580 581 609 610 630 631 647 654 671 686 698 716 718 722 737 761 778 779 863 906 911 913 974 975 998 999 1022 1134 1172 1174 1239 1240 1295
/object/objgbseq.h 56 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 72 74 75 76 77 79 82 83 84 87 88 109 110 112 113 114 119 138 158 178 179 181 208 228 248 249 268 269 270 304 323 324 350 351 352 353 354 355
/object/objgen.c 181 227 263 507 529 680 685 795 908 911 994 1239 1512 1517 1564 1847 1874 1921 1992 2011 2012 2015 2226 2291 2447
/object/objgen.h 126 134 135 136 143 169 186 197 212 255 310
/object/objinsdseq.h 56 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 72 74 75 76 77 79 82 83 84 87 88 109 110 112 113 114 119 138 158 178 179 181 208 228 248 249 268 269 270 304 323 324 350 351 352 353 354 355
/object/objloc.c 53 75 80 82 116 138 143 958 960 962 1242 1244 1406 1410
/object/objloc.h 196 229 247 263 266 309
/object/objmacro.h 124 165 449 796 1581 1582 1632 2614 2643 2661 2733 2754 2947 3017
/object/objmdrs.h 54 55
/object/objmedli.c 115 137 284 429 433 708 1093
/object/objmedli.h 114 131 175 195
/object/objmime.h 116 119
/object/objproj.c 36
/object/objproj.h 83
/object/objprt.c 231 237 404 410 416 422 732 878 884 1111 1217 1223
/object/objprt.h 116 117 118 119 135 136 162 177 178 206 220 221
/object/objpub.c 136 158 175 197 214 236 241 243 1068 1323 1337 1339 1340 1364 1385 1483 1616 1642 1647
/object/objpub.h 126 137 185
/object/objpubd.h 75 81 141 142 157 173 175
/object/objpubme.h 36 38 56 57
/object/objres.c 93 115 120 380 386 397 403
/object/objres.h 109 112 130
/object/objscoremat.h 147 224
/object/objseq.c 77 99 104 106 155 177 182 184 185 226 249 255 261 263 276 413 418 420 421 490 513 517 529 570 575 577 578 2870 2871 2900 2902 2902 2913 2919 2919 2925 2934 3092 3276 3278 3284 3286 3290 3554 4187 4191 4743 4745 4747
/object/objseq.h 116 230 236 248 447 572
/object/objsset.c 66 191 196 198 247 269 274 775
/object/objsset.h 90 103 194
/object/objsub.c 95 117 122 124 167 189 194 197 264 286 291 294 807 809 811 1112 1114 1116 1118 1120 1124 1126 1128
/object/objsub.h 109 111 117 128 141 151 174
/object/objtable.h 35 39
/object/objtseq.c 414 420 421 422 424 450 451 538 540 563
/object/objtseq.h 44 45 46 50 51 53
/object/objvalid.h 43 44 84 85 126
/sequin/sbtedit.c 64 553 639 639 639 639
/sequin/sequin.h 129 135 136 137 150 170 186 191 196 197 199 205 221 222 248 248 252 253 256 256 268 269 270 271 272 273 274 290 292 293 299 300 301 302 303 304 305 307 325 326 327 363 364 371 373 380 380 380 387 387 387 407 408 412 426 548 552 552 552 553 553 554 554 555 555 560 569 593 687 688 689 690 706 713 720 722 728 739 769 771 779 909 974 976 979 997 997 1012 1014 1022 1024 1054 1089 1145 1155 1164 1166 1168 1183 1193 1216 1224 1249 1250 1264 1302 1304 1305 1310 1324 1344 1345 1346 1346 1347 1355 1368 1379 1423 1499 1499 1499 1499 1529 1529 1543 1543 1543 1546 1561 1562 1563 1564 1565 1585 1588 1590 1594 1596 1600 1634 1675 1700 1702 1703 1709 1723 1725 1727 1729 1781 1866 1867 1870 1870 1870 1880 1881 1892 1892 1892 1893 1893 1894 1894 1894 1894 1904 1907 1907 1908 1939 1971 2006 2027 2035 2038 2042 2065 2068
/sequin/sequin1.c 149 150 151 168 323 334 339 339 339 339 350 350 350 371 371 371 382 382 436 451 630 738 738 1024 1024 1031 1077 1078 1079 1081 1082 1083 1085 1089 1198 1200 1202 1203 1204 1205 1294 1360 1409 1433 1437 1454 1573 2156 2158 2159 2160 2161 2234 2276 2422 2523 2627 2675 2832 2837 2838 2853 2953 2996 3367 3367 3367 3370 3377 3380 3398 3576 3613 3622 3660 3827 3984 4048 4070 4210 4672 4672 4733 4852 4855 4857 5191 5240 5427 5466 5472 6141 6180 6190 6191 6222 6233 6272 6272 6280 6281 6286 6287 6363 6378 6407 6409 6410 6487 6497 6536 6546 6701 6713 6798 6801 6970 6976 7005 7019 7030 7070 7072 7094 7097 7100 7107 7114 7130 7167 7178 7206 7215 7739 7890 7890 7901 7901 8062 8084 8088 8089 8284 8806 8811 8815 9497 9497 9523 9523 9626 9626 9719 9719 10104 10662 10662 10752 10754 11131 11212 11311 11311 11311 11370 11396 11684 12223 12278 12280 12282 12283 12405 12407 12409 12410 12567 12569 12571 12572 12720 12722 12724 12725 12912 13131 13173 13178 13220 13230 13294 13299 13300 13321 13325 13397 13409 14563 14565 14593 14595 14618 14618 14621 14622 14625 14635 14659 14678 14680 14682 14700 14708 14729 14729 14729 14731 14732 14733 14734 14735 14736 14737 14738 14739 14758 14761 14765 14773 14773 14773 14776 14777 14778 14779 14791 14795 14804 14818 14818 14818 14831 14831 14831 14834 14835 14836 14837 14838 14848 14855 14863 14930 14943 14943 14945 14947 14955 15001 15005 15028 15032 15049 15053 15087 15109 15109 15109 15112 15113 15118 15120 15127 15151 15152 15169 15169 15183 15194 15208 15214 15236 15243 15245 15265 15266 15267 15267 15269 15269 15269 15282 15291 15371 15387 15387 15387 15390 15427 15430 15431 15435 15437 15438 15439 15440 15448 15448 15462 15462 15496 15496 15505 15505 15547 15552 15566 15582 15583 15584 15588 15589 15603 15604 15615 15618 15619 15620 15690 15691 15694 15696 15698 15709 15870 15894 15900 16036 16099 16111 16111 16111 16111 16123 16123 16300 16300 16471 16545 16629 16877 16878 16921 16977 16977 16977 16977 16977 16992 17028 17030 17032 17033 17042 17064 17226 17228 17246 17252 17268 17270 17288 17290 17322 17324 17345 17349 17378 17378 17380 17419 17424 17474 17507 17510 17527 17527 17555 17555 17561 17561 17561 17561 17561 17563 17608 17608 17608 17624 17624 17624 17627 17647 17828 17875 17875 17921 17922 18000 18000 18078 18079 18118 18217 18323 18377 18433 18433 18499 18567 18574 18628 18637 18696 18702 18734 18783 18795 18811 18831 18885 18893 18955 18961 18967 19080 19193 19258 19283 19376 19392 19393 19458 19458 19458 19458 19458 19460 19471 19486 19488 19494 19555 19557 19594 19604 19727 19728 19892 19901 19901 19901 19904 19906 19908 19908 19928 19931 19932 19933 19934 19940 19940 19941 19941 19942 19942 20029 20033 20063 20067 20097 20128 20132 20158 20168 20227 20262 20264 20313 20316 20317 20362 20365 20366 20367 20373 20373 20374 20374 20472 20475 20479 20479 20536 20539 20542 20542 20565 20571 20577 20583 20587 20590 20590 20641 20643 20674 20678 20769 20769 20801 20801 20807 20807 20810 20833 20835 20882 20885 20886 20887 20941 21303 21305 21411 21497 21569 21649 21731 21804 21857 22124 22188 22190 22196 22196 22197 22341 22407 22408 22455 22455 22563 22563 22591 22670 22676 22701 22739 22740 22744 22746 22747 22764 22764 22803 22927 23011 23011 23013 23014 23017 23027 23030 23034 23091 23104 23108 23138 23145 23153 23158 23158 23159 23191 23196 23216 23272 23332 23379 23382 23389 23389 23402 23402 23423 23427 23545 23601 23729 23731 23738 23738 23739 23988 24046 24061 24179 24180 24181 24195 24383 24495 24549 24550 24568 24568 24695 24698 24699 24709 24719 24721 24732 24732 24734 24746 24768 24797 24829 24829 24831 24850 24850 24852 24871 24871 24871 24873 24874 24875 24876 24877 24893 24900 24900 24900 24902 24903 24904 24905 24906 24922 24930 24949 24951 24962 24962 24968 24968 24968 24974 24977 24978 25000 25011 25013 25014 25023 25033 25036 25037 25058 25065 25077 25079 25080 25101 25106 25228 25279 25282 25304 25306 25307 25308 25324 25386 25426 25555 25598 25630 25661 25812 25813 25814 25815 25839 25865 25948 25976 25977 26002 26003 26039 26039 26039 26049 26050 26127 26170 26188 26194 26236 26237 26341 26477 26478 26479 26480 26481 26514 26575 26575 26575 26580 26587 26606 26643 26643 26643 26649 26669 26669 26671 26671 26842 26903 26906 26908 26911 26917 26929 26957 27082 27141 27166 27167 27168 27169 27170 27171 27207 27219 27234 27249 27263 27353 27357 27397 27497 27666 27676 27689 27690 27697 27717 27718 27730 27738 27753 27829 27830 27838 27862 27872 27898 27899 27910 27932 27935 28005 28006 28018 28097 28123 28123 28127 28150 28152 28177 28178 28199 28219 28401 28511 28587 28588 28668 28678 28691 28694 28721 28731 28733 28769 28893 29050 29051 29143 29209 29348 29509 29589 29665 29681 29768 29769 29784 29817 29883 29891 29899 29904 29919 29936 29938 29939 29957 29969 30021 30077 30078 30081 30082 30162 30267 30473 30658 30664 30699 30700 30718 30843 30922 30957 30958 30959 30988 31047 31049 31164 31258 31469 31472 31777 31777 31777 31784 31788 31793 31794 31795 31838 31842 31860 31864 31910 32056 32087 32088 32089 32153 32156 32345 32348 32407 32409 32413 32422 32429 32479 32481 32483 32484 32498 32564 32568 32586 32602 32667 32669 32670 32748 32752 32771 32772 32773 32775 32856 32863 33024 33062 33093 33125 33169 33206 33247 33282 33283 33286 33437 33445 33446 33449 33450 33501 33609 33643 33791 33796 33818 33838 33872 34046 34047 34212 34443 34530 34562 34631 34661
/sequin/sequin10.c 359 360 1336 1339 1361 1364 1367 1406 1444 1445 1619 1627 1628 1633 1786 1813 1834 1935 1948 1958 1975 1976 1979 2015 2080 2080 2082 2101 2416 2420 2420 2425 2429 2464 2489 2754 2970 3808 4008 4032 4079 4118 4144 4176 4198 4230 4236 4276 4307 4351 4399 4445 4475 4479 4503 4578 4750 4933 4941 5123 5124 5125 5138 5148 5167 5175 5182 5222 5227 5347 5351 5538 5586 5586 5589 5589 5610 5610 5630 5634 5644 5686 5981 6183 6200 6266 6284 6363 6373 6500 6863 6965 6972 6973 7105 7256 7745 7751 7772 7796 7874 7875 7886 7887 8001 8440 8441 8442 8443 8467 8473 8479 8507 8750 8759 8760 8765 8868 8961 8968 9016 9309 10167 10170 10172 10173 10175 10176 10177 10178 10228 10230 10255 10293 10313 10394 10480 10481 10522 10544 10545 10603 10766 10806 10857 10859 10869 10879 10896 11050 11052 11062 11072 11089 11319 11342 11356 11370 11608 11612 11637 11644 12050 12166 12249 12568 13045 13324 13334 13349 13370 13813 13857 13859 13860 13861 13872 13892 13921 14068 14079 14107 14141 14407 14464 14469 14526 14827 14918 14924 14992 15009 15095 15097 15098 15131 15232 15236 15250 15250 15307 15314 15347 15381 15419 15422 15427 15443 15455 15537 15582 15963 15964 15972 15974 16001
/sequin/sequin2.c 156 156 157 157 396 596 636 637 640 642 645 648 691 715 716 754 754 756 757 784 785 853 882 882 921 974 977 997 997 1001 1019 1020 1041 1054 1056 1056 1116 1118 1152 1155 1235 1272 1274 1316 1316 1318 1339 1339 1339 1341 1363 1363 1365 1366 1408 1410 1412 1485 1486 1487 1489 1492 1522 1544 1579 1581 1597 1597 1601 1613 1628 1641 1654 1676 1793 1793 1793 1793 1795 1797 1839 1839 1839 1839 1841 1863 1863 1863 1865 1866 1882 1892 1892 1892 1892 1894 1907 1907 1907 1909 1933 1933 1935 1946 1946 1948 1949 1978 2004 2025 2051 2053 2054 2055 2056 2057 2059 2062 2063 2125 2125 2125 2128 2141 2155 2157 2158 2159 2162 2171 2190 2192 2193 2194 2195 2197 2198 2199 2200 2302 2304 2305 2306 2308 2339 2341 2342 2343 2344 2348 2350 2373 2420 2429 2452 2466 2466 2468 2479 2479 2481 2492 2508 2510 2535 2537 2558 2558 2611 2643 2643 2655 2661 2674 2676 2677 2678 2683 2684 2837 2840 2841 2842 2916 2996 3025 3055 3072 3093 3180 3186 3475 3475 3477 3478 3496 3496 3496 3505 3505 3505 3506 3506 3508 3508 3509 3509 3511 3528 3528 3529 3529 3529 3531 3548 3548 3550 3559 3603 3605 3608 3609 3612 3613 3614 3615 3618 3792 3929 3988 4016 4055 4082 4086 4198 4213 4272 4288 4484 4486 4495 4495 4545 4546 4578 4581 4590 4805 4807 4856 4861 4862 4890 4921 4954 5067 5069 5123 5132 5142 5151 5160 5183 5208 5209 5219 5336 5338 5341 5344 5345 5346 5347 5348 5527 5552 5561 5592 5606 5618 5704 5704 5705 5907 5978 5978 5981 5983 6015 6015 6021 6022 6070 6171 6172 6175 6177 6202 6205 6206 6243 6251 6252 6392 6398 6399 6464 6476 6502 6533 6535 6538 6539 6553 6555 6558 6559 6583 6585 6586 6588 6622 6625 6627 6644 6664 6666 6668 6671 6863 6865 6867 6870 7008 7009 7010 7030 7116 7175 7180 7186 7236 7294 7296 7297 7351 7365 7372 7415 7418 7419 7420 7421 7507 7509 7510 7511 7512 7513 7582 7620 7621 7623 7660 7682 7683 7693 7719 7789 7789 7792 7801 7805 7805 7809 7828 7849 7863 7912 8106 8111 8347 8626 8628 8632 8641 8678 8678 8680 8681 8730 8849 8890 8930 8936 8972 9009 9058 9093 9106 9110 9111 9116 9136 9153 9186 9762 10440 10447 10450 10470 10673 10673 10675 10725 10742 10770 10827 11246 11250 11254 11258 11262 11266 11276 11277 11384 11384 11384 11388 11405 11557 11560 11562 11565 11569 11570 11571 11572 11573 11576 11582 11599 11626 11645 11665 11667 11681 11683 11706 11708 11722 11722 11724 11751 11751 11751 11753 11767 11767 11767 11769 11820 11823 11823 11825 11826 11862 11862 11864 11865 11867 12086 12087 12107 12139 12156 12158 12162 12276 12277 12278 12282 12286 12331 12331 12331 12335 12394 12394 12394 12396 12397 12433 12471 12471 12473 12510 12569 12569 12585 12588 12608 12768 12804 12805 12833 12860 12961 12964 12966 13076 13167 13175 13176 13183 13221 13255 13344 13344 13344 13344 13346 13366 13385 13386 13433 13433 13435 13518 13519 13546 13546 13547 13547 13586 13610 13641 13669 13697 13717 13721 13756 13786 13843 13906 14005 14046 14086 14087 14092 14130 14131 14214 14302 14304 14312 14369 14391 14392 14432 14491 14536 14553 14742 14742 14745 14763 14767 14780 14785 14789 14814 14817 15031 15042 15170 15334 15335 15338 15341 15427 15427 15427 15435 15438 15666 15668 15712 15743 15746 15747 15751 15752 15754 15771 15802 15821 15857 15859 15865 15927 15927 15929 15930 15945 15947 15948 15952 15999 16020 16031 16043 16069 16189 16193 16203 16331 16347 16489 16502 16505 16630 16676 16679 16838 16843 16877 16883 16916 16917 16932 16933 16934 16935 16941 17016 17052 17193 17194 17233 17234 17353 17353 17417 17417 17418 17418 17684 17688 17756 17787 17802 17814 17824 17901 17956 17956 18084 18177 18178 18359 18515 18556 18558 18596 18600 18620 18645 18748 18827 18828 18829 18855 18855 18855 18919 18921 18922 18923 18924 18936 18943 18944 18956 18957 18958 18959 18960 18981 19010 19100 19101 19102 19111 19112 19113 19114 19119 19133 19159 19242 19242 19244 19264 19264 19266 19286 19286 19288 19308 19308 19310 19328 19328 19330 19348 19349 19350 19353 19373 19373 19373 19375 19393 19393 19432 19447 19544 19549 19585 19586 19588 19695 19740 19742 19929 20177 20181 20182 20215 20384 20390 20449 20450 20511 20511 20514 21266 21359 21360 21655 21656 21707 21715 21755 22037 22038 22039 22040 22044 22124 22127 22205 22208 22366 22396 22718 22724 22943 22943 22945 22967 22967 22969 22989 22989 23005 23005 23007 23052 23054 23057 23447 23449 23502 23502 23503 23503 23514 23606 23627 23667 23667 23668 23668 23816 23883 23891 23911 23914 23939 23955 23973 23996 23997 23998 24051 24053 24071 24088 24088 24090 24091 24105 24132 24134 24201 24316 24319 24321 24383 24383 24384 24384 24860 24890 24925 25011 25014 25058 25206 25206 25836 26149 26345 26491 26541 26542 26543 26575 26674 26719 26725 26736 26737 26996 27325 27331 27461 27462 27768 27791 27793 27825 27911 27912 28143 28160 28196 28225 28249 28281 28290 28399 28429 28521 28522 28523 28588 29271 29277 29278 29284 29334 29514 29684 29876
/sequin/sequin3.c 92 159 236 262 323 414 415 433 480 487 488 581 587 594 595 598 598 598 600 616 619 623 691 695 869 966 982 984 1019 1025 1055 1098 1104 1134 1143 1827 2248 2269 2270 2605 2606 2634 2635 3442 3443 3477 3479 3480 4564 4604 4987 5220 5253 5317 5358 5373 5558 5571 5582 5593 5599 5618 6033 6325 6327 6348 6378 6380 6425 6428 6792 6815 6934 6954 6957 6958 6960 6996 7033 7047 7048 7155 7189 7282 7298 7366 7549 7938 8020 8176 8234 8323 8352 8385 8386 8397 8413 8423 8425 8476 8537 8546 8583 8592 8650 8659 8728 8729 8741 8776 8783 8785 8843 8843 8846 8887 8922 8977 9026 9102 9103 9136 9167 9203 9206 9211 9212 9278 9288 9464 9489 9532 9543 9559 9560 9585 9799 9807 9808 9877 9999 10665 11197 11204 11220 11389 11409 11559 11559 11609 11921 12049 12484 12602 12609 12611 12612 12646 12652 12829 12833 13016 13030 13274 13370 13377 13416 13622 13622 13622 13623 13646 13663 13714 13822 13885 13902 14065 14146 14215 14240 14245 14531 14533 14591 14620 14625 14628 14638 14837 15033 15116 15153 15207 15326 15327 15493 15803 15997 16009 16588 16601 16604 16907 17568 17569 17570 17685 17702 17771 18148 18856 19002 19015 19033 19061 19151 19157 19163 19179 19179 19250 19798 20043 20044 20045 20046 20048 20078 20095 20167 20207 20216 20603 20605 20659 20672 20685 20731 21176 21500 21504 21507 21533 21615 21620 21632 21659 21659 21697 21918 22002 22387 22391 22395 22417 22434 22442 22487 22542 22568 22671 22671 22688 22707 22755 22794 22884 22886 22887 22888 22907 22965 22981 23105 23106 23221 23279 23281 23282 23289 23379
/sequin/sequin4.c 214 3758 3760 3769 4054 4056 4058 4076 5152 5326 5328 5384 6181 6286 6286 6398 6411 6413 6755 6942 7461 7471 7475 7481 7629 7753 8510 8853 8855 9309 9397 9398 9400 9402 9403 9404 9454 9455 9475 9552 9556 9639 9640 9642 9644 9671 9706 9706 9708 9710 9728 9849 10294 10300 10336 10419 10421 10463 10465 10494 10514 10525 10527 10538 10557 10632 10634 10686 10752 10755 10897 10921 10934 11154 11163 11316 11491 11530 11531 12018 12042 12045 12048 12055 12059 12070 12160 12445 12446 12569 12570 12669 13023 13026 13288 14176 14231 14237 14273
/sequin/sequin5.c 88 171 177 217 217 217 220 339 339 361 438 438 489 489 493 518 796 799 1573 1626 1702 1715 1733 1735 1736 1737 1924 1938 2021 2052 2354 2361 2362 2379 2403 2404 2411 3108 3220 3394 3678 3678 3680 3682 3701 3711 3727 3733 3758 3788 3806 3831 3843 3859 3884 3900 3916 3966 3978 3978 3978 3980 3996 4005 4017 4023 4069 4082 4334 4334 4336 4338 4367 4388 4388 4390 4392 4410 4420 4424 4435 4446 4462 4466 4481 4854 4914 4918 4935 4956 4959 5038 5041 5058 5088 5089 5099 5132 5394 5532 5545 5549 5550 5583 5583 5585 5587 5598 5616 5617 5708 5709 5800 5801 5834 5835 5994 5996 6042 6055 6065 6079 6093 6100 6434 6442 6456 6463 6588 6623 6630 6731 6736 6750 6753 7049 7051 7060 7060 7094 7117 7137 7229 7231 7277 7462 7467 7469 7471 7481 7578 7580 7582 7584 7620 7623 7688 7718 8110 8129 8132 8240 8245 8258 8288 8302 8316 8349 8363 8760 8760 8795 8797 8800 9033 9257 9666 9667 9949 10545 10550 10697 10699 10864 10870 10885 10905 11001 11140 11800 11854 11959 11959 11961 12000 12048 12781 12787 12793 12881 13101 13103 13153 13309 13371 13373 13422 13547 14176 14653 14854 15042 16215 16217 16219 16233 16525 16528 16589 16617 16681 16764 17523 17545 17554 17738 17795 17958 18094 18236 18237 18407 18408 18420 18427 18673 18703 18800 18860 18881 18930 18931 19009 19010 19137 19138 20613 20698 21095 21097 21100 21103 21195 21197 21209 21220 21418 21427 21448 22724 22726 22730 22752 22764 22766 22962 23059 23059 23061 23108 23110 23336 23959 24043 24085 24364 24412 24445 24497 24545 24581 24612 24712 24742 24747 24798 25054 25535 25645 25698 25823 25879 25891 25981 26007 26033 26061 26087 26142 26420 26651 26739 26748 27644 27648 27666 27675 27855 27887 27982 27995 27995 28663 28738 28985 29205 29219 29259 29529 29752 29755 29802 29878 30109 30153 30153 30155 30184 30230 30277 30321 30687 30713 31049 31073 31080 31098 31117 31117 31122 31124 31124 31128 31140 31145 31164 31189 31194 31201 31201 31202 31206 31261 31280 31280 31354 31371 31374 31382 31396 31397 31429 31441 31445 31495 31530 31530 31565 31565 31600 31600 31637 31642 31667 31702 31704 31753 31761 31774 31790 31798 31809 31827 31848 31857 31891 31912 31921 31928 31967 31988 31997 32038 32059 32069 32083 32281 32299 32302 32310 32324 32325 32371 32553 32733 33054 33072 33090 33170 33348 33391 33428 33431 33432 33433 33502 33539 33540 33551 33567 33568
/sequin/sequin6.c 204 221 530 544 580 584 588 631 632 786 1175 1182 1183 1188 1414 2213 2635 2668 2834 2837 2838 2839 2840 2872 2874 2875 2925 2946 2974 3001 3010 3016 3034 3130 3182 3201 3738 3757 3789 3905 3927 3939 4580 4611 4747 5020 5036 5156 5222 5437 5441 5468 5502 5754 5757 6062 6503 6505 6556 6600 7080 7090 7106 7107 7199 7202 7235 7237 7238 7239 7290 7374 7375 7469 7473 7504 7506 7525 7525 7527 7686 7748 7758 7849 7892 7903 7955 7965 7966 8016 8030 8117 8153 8193 8225 8265 8288 8319 8498 8574 8678 8886 8920 8921 8974 8976 9094 9122 9157 9158 9187 9188 9216 9217 9246 9247 9252 9331 9363 9377 9379 9386 9401 9430 9564 9614 9708 9789 9817 9818 9880 9887 9888 9925 9927 10279 10283 10320 10366 10587 10592 10610 10859 10974 11389 11390 11391 11450 11479 11654 11752 11911 11919 11924 12044 12045 12142 12142 12149 12386 12388 12413 12413 12415 12442 12445 12448 12489 12513 12631 13057 13064 13068 13123 13179 13181 13182 13183 13202 13223 13274 13289 13292 13296 13298 13318 13357 13359 13362 13388 13392 13401 13435 13455 13455 13468 13468 13481 13481 13534 13817 13863 13874 14085 14092 14442 14442 14464 14583 14634 14635 15085 15174 15228
/sequin/sequin7.c 97 99 101 108 110 124 174 176 269 316 404 643 655 808 923 923 923 927 928 1057 1058 1058 1153 1190 1192 1226 1319 1342 1380 1411 1501 1576 1593 1594 1595 2007 2068 2208 2232 2478 2498 2773 2776 3066 3113 3276 3276 3276 3279 3280 3303 3310 3355 3420 3441 3462 3482 3519 3522 3564 3676 3720 3748 3895 3924 4176 4176 4176 4181 4254 4254 4258 4259 4307 4373 4374 4377 4377 4400 4400 4473 4473 4545 4570 4589 4600 5011 5031 5070 5149 5150 5218 5312 5315 5316 5317 5319 5346 5351 5450 5758 5759 5825 5826 6021 6110 6182 6183 6615 6621 6732 6773 6809 6831 6959 6976 6991 7103 7105 7109 7165 7257 7316 7321 7327 7330 7333 7352 7380 7527 7739 8031 8065 8147 8192 8193 8453 8454 8543 8544 8613 8614 8635 8752 8958 9002 9462 9463 9464 9540 9540 9540 9606 9606 9882 9978 10023 10769 10772 10773 10801 11104 11107 11431 11434 11435 11460 12394 12442 12491 12493 12574 12575 12576 12607 12607 12625 12627 12632 12750 12752 12757 12847 13048 13049 13052 13052 13086 13096 13151 13155 13233 13237 13572 13575 13628 13669 13673 13687 13780 13781 13782 13783 13784 14003 14003 14005 14023 14048 14129 14226 14253 14417 14462 14503 14632 14721 14771 14771 14773 14791 14791 14791 14791 14791 14793 14835 14835 14835 14837 14851 14876 14877 14879 15190 15349 15361 15380 15570 15574 15589 15592 15607 15619 15653 15660 15932 15933 15941 15951 15952 15963 15973 15974 15981 16010 16011 16019 16093 16097 16291 16641 16645 16849 16889 16925
/sequin/sequin8.c 156 522 888 964 970 971 1203 1216 1230 1445 1863 1985 2284 2301 2303 2309 2322 2323 2337 2338 2397 2464 2721 2819 3114 3315 3386 3479 3480 3482 3499 3534 3548 3550 3577 3586 3683 3834 3851 3993 4164 4165 4171 4183 4274 4276 4280 4286 4291 4291 4295 4312 4318 4325 4334 4507 4704 4708 4715 4716 4726 4728 4763 4771 4773 4831 4843 4856 4858 4874 4893 4916 4927 4938 5002 5003 5005 5048 5059 5199 5334 5337 5352 5429 5433 5434 5452 5467 5470 5486 5489 5490 5506 5508 5511 5525 5552 5566 5568 5595 5604 5620 5670 5717 5761 5887 6056 6076 6105 6108 6117 6130 6142 6200 6286 6288 6289 6290 6291 6292 6293 6294 6382 6391 6407 6417 6436 6447 6494 6572 6593 6597 6598 6659 8218 8670 8782 8783 8806 8834 8838 8874 8876 8877 8878 8891 8928 8942 8944 8971 8980 8996 9077 9083 9089 9129 9158 9227 9263 9283 9329 9361 9417 9597 9616 9619 9634 9666 9668 9674 10141 10420 10422 10423 10434 10443 10445 10461 10544 10571 10573 10581 10597 10623 10654 10739 10798 10949 10955 10974 10975 10983 10984 11046 11051 11059 11062 11082 11095 11123 11169 11171 11348 11348 11350 11400 11401 11403 11511 11512 11588 11589 11989 12023 12024 12079 12080 12164 12392 12393 12394 12418 12495 12544 12622 12629 12645 12662 12696 12698 12706 12732 12753 13114 13261 13914 14084 14086 14227 14236 14237 14257 14275 14275 15158 15185 15343 15378 15385 15557 15720 15722 16322 16410 16446 16562 16562 16587 16604 16748 16788 16791 16824 17708 17807 17809 17817 17824 17826 17827 17858 17866 17885 17926 17944 18509 18635 18692 18705 18706 18718 18721 18736 18741 18757 19161 19372 19384 19397 19466
/sequin/sequin9.c 118 119 153 154 328 597 598 599 605 761 766 770 771 803 932 994 994 1008 1010 1011 1334 1334 1398 1466 1466 1471 1472 1473 1525 1526 1534 1535 1542 1543 1699 1710 1729 1789 1839 1847 1848 1849 1859 1862 2133 2262 2271 2272 2272 2275 2275 2276 2276 2285 2419 2419 2424 2431 2446 2586 2677 2699 2712 2809 2839 3854 3861 3917 3922 3989 3990 3991 4004 4040 4041 4042 4055 4335 4338 4435 4436 4441 4579 4579 4585 4585 4839 4844 4907 4912 4967 4972 5024 5164 5174 5175 5435 5455 5458 5462 5574 5584 5682 5690 5798 5799 5803 5862 6121 6687 6744 6746 6758 6797 6799 6886 7418 7419 7597 7598 7642 7646 7650 7657 8196 8199 8202 8579 9196 9197 9198 9221 9958 10006 10040 10122 10128 10133 10136 10266 10297 10762 10782 10793 10973 11004 11239 11266 11361 11373 12406 12414 12416 12922 13078 13082 13085 13092 13142 13145 13157 13415 16236 16658 17070 17458 17874 18145
/sequin/streamer.c 70 559 645 645 645 645 671 681 781 783 805 808 811 818 825 841 878 889 1003 1004 1085 1085 1142 1151 1152 1156 1157
/tools/actutils.c 238 248 251 254 277 295 315 344 380 428 749 754 771 3065 3089
/tools/actutils.h 135 185
/tools/bandalgn.c 747
/tools/bandalgn.h 434
/tools/blast.c 3739 3744 4183 4409 4434 4959 5007 5015 5569 5626 5652 5652 5677 5677 5714 5714 5840 5840 5847 5847 5859 5859 5868 5868 5876 5999 6006 6907
/tools/blast.h 484 485 489 491 493 512 512 514 514 516 516 518 518 521 523 525 534 551 553 556 590 592 594 601 639 639 641 641 643 643 645 645 647 647 649 649 651 651 653 653 661 664 665 674 674 676 676 687 687 687 696 697 698 714
/tools/blastconcat.c 249 252 262 764 764 768 768 783 783 785 785
/tools/blastdef.h 1105 1116 1139 1146 1153 1154 1163 1189 1223 1226 1237 1244 1263 1424 1644 1735 1949 1974 1984
/tools/blastkar.c 731 1592 1596 1689 1722 1856 1921 1936 1958 1961 2187 2189 2576 2580 2590 2608 3180 3268 3286 3304 3385 3436 3483 3499 3550 3618 3621 3622 3645 3650 5001
/tools/blastkar.h 431 449 479 481 494 514 516 527 530 534 577 586 602 614 628 630 632 634 637
/tools/blastool.c 985 992 1214 1214 1217 1218 1311 1316 1337 1374 1376 1405 1405 1422 1425 1477 1484 1671 1693 1900 4073 4091 4092 4093 4094 4096 4099 4109 4109 4172 4196 4221 4449 4574 4582 4585 4733 4760 5029 5037 5043 5046 5083 5095 5204 5357 5360 5453 5454 5974 5976 5983
/tools/blastpri.h 711 749 749 752 752 758 758 760 760 765 765 776 843 852 858 858 867 869 871 873 883 950 950 950 950 952 1031 1033 1033 1060 1062 1062 1062 1066 1073 1080
/tools/blastutl.c 1860 1872 2078 2965 3003 3075 3517 3761 3767 3774 3805 4936 4936 4951 4951 4958 4958 4965 4965 4981 4981 4989 4989 4996 4996 5003 5003 5104 5233 5233 5315 5315 5399 5460 6004 6004 6017 6017 6472 6580 6591 6763 6769 6866 6903 6904 6904 6907 7129 7190 7242 7293 7294 7294 7297 7346 7353 7367 7374 7381 7382 7651 10965 11253 11257 11293 11336 11576 11639 11746 11831 11859 11966 12030 12138 12259
/tools/blfmtutl.c 198 198 201 237 237 248 447 458 471 471 474 497 501 524 552 578 582 621 642 646 672 692 696 719 867 868 880 896 897 1003 1015 1026 1037 1046 1091 1134 1408 1413
/tools/blfmtutl.h 77 78 79 141 148 150 155 164 164 166 174 174 176 176 179 180 184 186 189 197
/tools/bxmlobj.h 35 36 37 38 39 40 42 63 76 77 78 98 99 105 149 150 151 207 208 209
/tools/csim.c 133 133 134 134 135 135 136 136 137 137 138 138 142 142 192 200 205 354 463 463 628 628 746 746 764 764 920 920 1152 1152 1336 1336
/tools/dotseq.c 933
/tools/dotseq.h 131 132
/tools/falign.c 148 170 171 208 209 307 307 484 511 534 538 562 564 681 756 787 854 1470
/tools/g_any.c 124 127 133 136 136 137 137 138 138 368
/tools/gapxdrop.c 2058
/tools/impatool.c 157 161 184 196 200 226 231 256 259 288
/tools/kappa.c 1158
/tools/list.h 131 132 132 133 133 134
/tools/lookup.c 749
/tools/lookup.h 453
/tools/mblast.c 757 759 764 764 822 822 879 944 994 995 1152 1173 1285 1344 1349 1534 1713 1738 3960
/tools/mblast.h 216 224 224 233 233 248 248
/tools/motif.c 311 324
/tools/motif.h 69
/tools/ncbisam.c 231 231 232 233 233 234 234 269 270 276 347 347 348 375 376 378 379 380 381 382 724 726 866 868 870 872 874 876 878 885 891 908 931 931 933 1082 1161 1164 1165 1166 1167 1168 1178 1179 1181 1942 1948 2072 2074 2094 2094 2097 2129 2140 2141 2163 2200 2244 2245 2245 2247 2271 2273 2274 2282 2308 2383 2595 2666 2672
/tools/ncbisam.h 145 146 180 194 197 198 199 200 201 211 212 214 215 216 217 218 233 233 234 282 284 285 289
/tools/ncbisami.h 139 140 142 143 144 149 161
/tools/ncbisort.c 91 128 226 245 256 257 328 329 332 332 341 352 356 449 452 477 491 662 1030 1030 1051 1130 1131 1156 1235
/tools/ncbisort.h 123 146 160 174 190 201
/tools/ncbisrti.h 111 163 175 187
/tools/pobutil.c 42 51 359 359 384 452 1365 1384 1388
/tools/pobutil.h 58 95 95 96 97 136
/tools/posit.c 2563 2592 2696 2889 2951
/tools/posit.h 371 373 375
/tools/posit2.c 327
/tools/profiles.h 124
/tools/pseed3.c 438 438
/tools/readdb.c 2132 2195 2493 2493 2631 2631 2735 2752 2879 2914 2917 2918 3281 3281 3306 3480 3480 3480 3483 3522 3522 3528 3552 3552 3561 3710 3720 3904 4020 4031 4031 4031 4202 4456 4484 4687 4688 4689 4690 5100 5180 5183 5188 5292 5353 5358 5489 5633 5670 5719 5751 5767 6348 6350 6522 6526 6539 6550 6564 6579 6609 6617 6622 6760 6783 6814 6820 7013 7030 7054 7075 7199 7368 7368 7507 7538 7539 7552 7553 7555 7688 7708 7708 7717 7728 7728 7730 7736 7739 7753 7902 7902 7905 7905 7988 7993 8407 8580 8711 8949 8957 9017 9025 9086 9087 9089 9217 9217 9220 9403 9598 9598 9605 9851 9924 9927 9988 10515 10660 10664 10669 11019 11103 11108 11156 11176 11391 11579 11583 11608 11699 11918 11922 12018 12059 12059 12060 12067 12067 12068 12070 12077 12416 12475 12475 12592 12592 12594 12597 12597 12665 12665 12667 12677 12700 12700
/tools/readdb.h 880 925 980 994 1121 1122 1127 1165 1176 1177 1182 1187 1188 1188 1189 1207 1213 1225 1226 1226 1349 1356 1382 1384 1390 1402 1448 1454 1457 1463 1476 1476 1511 1511 1646 1647 1656 1657 1676 1677 1750 1752 1760 1761 1795 1795 1796 1838 1844 1845 1845 1847 1851 1851 1866 1884 1889 1893 1914 1919 1931 1931 1932 1944 1944 1945 1947 1978 1978 1985 1985 1987 1987 1988 1990 1990 1992 1992 2004 2005
/tools/rpsutil.c 328 382 383 430 435 2172 2173 2173 2175 2209 2215 2216 2286 2605 2605 2691
/tools/rpsutil.h 170 198 199 200 211 227 255 257
/tools/salign.c 606 613 849 910 953
/tools/salign.h 32
/tools/salptool.c 1468 1512
/tools/sec.c 155 155 165 173 173
/tools/seed.h 271 271
/tools/seg.c 116 155 190 226 267 304 344 393 422 594 737 1224 1236 1300 1312 1370 1421 1498 1631 1634 1644 1647
/tools/seg.h 89 108 138 139
/tools/sim2.c 19
/tools/sim3.c 67 67 72 74 236 236 248 248 267 267 349 349 476 476 769 769 806 806 875 875 875 882 883 1092
/tools/sim4.c 143
/tools/simutil.c 152 232 232 234 679 685 685 691 691 703 705 720 720 735 848 855 855 1100 1100 1102 1160 1160 1163 1195
/tools/simutil.h 121 312 312 333 333 338 339 339 340 340 341 342 342 361 396 396 485 541
/tools/spidey.c 347 348 1037 1048 1053 1214 1301 1301 1655 1656 1728 1741 1756 1762 2266 2282 2736 2748 9718 9721 9722 9723 9731 9734 9821 9827 9855 9884 9887 9896 9909 9921
/tools/spidey.h 265 277 425 426 534
/tools/splutil.c 62 111 142
/tools/splutil.h 50 51 52
/tools/stsutil.c 151 152 168 171 171 172 173 174 174 329 399 421 477 572 599 635 691 692 692 697 744 761 761 763 764 768 824 909 910
/tools/stsutil.h 61 63 66 67 68 69 70 78 82 83 84 88 89 90 92 122 127 175 185
/tools/suggest.c 231 232 514 1331 1359 1490 1544 1670
/tools/suggest.h 101 145 171 172 188
/tools/suggslp.c 166 166
/tools/taxblast.c 186 197 203 216 267 350 379 415 422 460 507 631 661 661 664 774 789 789 1149 1190 1231 1233 1269 1272 1291 1354 1354 1355 1367 1368 1463 1490 1580 1619 1769 1769 1770 1835 1838
/tools/taxblast.h 72 73 74
/tools/tfuns.c 24 26 36 44 44 47 70 70 70 72 108 133 133 135 158 158 158 160 185 185 193 193 195 210 210 227 227 344 346 347 401 404 405 729 785 785 788 809 809 826 826 826 828 858 858 978 978 991 1213 1213 1311 1326 1328
/tools/tfuns.h 12 12 14 14 15 15 16 16 18 18 18 19 20 20 21 21 21 23 23 58 58 60 60 62 62 62
/tools/toasn3.c 38 41 71 75 86 102 102 107 142 398 976 1078 1099 1234 1554 1626 1627 1711 1711 1714 1728 2566 2714 2718 2721 2956 2958 2977 2977 2992 2992 2992 2994 3005 3005 3007 3034 3035 3036 3056 3058 3120 3208 3242 3244 3281 3305 3305 3307 3327 3329 3358 3448 3506 3524 3526 3553 3559 3597 3604 3680 3681 3682 3683 3687 3687 3692 3717 3727 3728 3787 3803 3851 4095 4095 4098 4100 4101 4148 4148 4152 4154 4155 4192 4210 4222 4862 5219 5221 5254 5314 5320 5485 5570 5647 5735 5907 5926 5975 6024 6027 6033 6034 6059 6343
/tools/toasn3.h 59 74 189
/tools/toporg.c 587 610 673 1040 1058 1572 1574 1640 1812 1913 1984 2000 2000 2018 2119 2119 2605 2606 2608 2643 2644 2646 2898 2907 3146 3156 3315 3599 4468 4496 4501 4517 4518 4970 4986 5124 5229 5230 5255 5256 5304 5312 5333 5414 5415 5663 5798 5898 5934 5935 5960 6217 6218 6306 6307 6311 6314 6318 6384 6499 6502 7093
/tools/urkcnsrt.c 365 545 1029 1045 1243 1243 1353 1353
/tools/urkdust.c 427
/tools/urkdust.h 99
/tools/urkepi.c 177 182 272 354 359 415 506 555 728 933 1097 1284
/tools/urkepi.h 83 97
/tools/urkfltr.c 175 270 291
/tools/urkfltr.h 73 74 84
/tools/urkpcc.c 64 215 220 286 293
/tools/urkpcc.h 67 68 86
/tools/urkptpf.c 191 196 231 237 238 239 243 289 357 358 363 364 365 366 367 368 369 424 513 533 533 535 536 547 574 615 640 672 689 703 703 706 707 708 769 771 886 974 1004 1007 1009 1029 1123 1126 1333 1549 1549 1552 1552 1553 1553 1605 1609 1610
/tools/urkptpf.h 102 103 105 106 108 109 109 111 111 112 118 131
/tools/urktree.h 63
/tools/urkutil.c 63 63 63 65 66 93 116 119 123
/tools/urkutil.h 65 65 65 66
/tools/vecscrn.c 132 132 170 173 188 196 198 200 238 238 238 910 963 992 1242 1242 1247
/tools/vecscrn.h 116 116 116 186 188 204 222 222
/tools/xmlblast.c 373 903 914 1005 1005 1083 1084 1086 1116 1116 1118 1232 1232
/tools/xmlblast.h 119 120 122 125 125 127 130 130 137 143 152 152
/vibrant/diagnost.c 68 68 69 71 130
/vibrant/document.c 87 88 248 438 640 647 654 655 678 730 969 1162 1166 1167 1340 1944 2368 2455 2459 2472 2496 2537 2577 2634 2808 2824 2829 2886 3232 3413 3425 3430 3515 3968 3971 4051 4053 4250 4394 4479 4493 4494 4496 4497 4500 4501 4522 4606 4629
/vibrant/imagelst.c 107 138
/vibrant/imagelst.h 85 90
/vibrant/panels.h 96 97
/vibrant/pictur3d.c 74 556
/vibrant/pictur3d.h 185
/vibrant/ppict3d.h 158
/vibrant/prim3d4.c 88 234 235 706 707 1243
/vibrant/table.c 241 273 447 491 494 508 516 525 535 668 673 708 716 725 734 754 781 789 798
/vibrant/treeview.c 162 165 167 341 563 600 626 710 873 923 1160 1504 1509 1524 2037
/vibrant/treeview.h 133
/vibrant/vibforms.c 59 72 93 93 132 140 151 157 249 262 301 512 526 649 663 811 863 873 954 965 969 973 978 993 1019 1031 1052 1052 1058 1104 1110 1126 1131 1143 1213 1223 1242 1256 1256 1256 1260 1261 1262 1266 1314 1314 1330 1330 1335 1336 1360 1381 1393 1518 1534 1556 1572 1592 1596 1601 1617 1618 1632 1717 1748 2244 2537 2543 2735 2949 3069
/vibrant/vibforms.h 429 429
/vibrant/vibmouse.c 118 126 786
/vibrant/viewer3d.c 318 2187

24662 references in 700 files.